Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001407330.1
Sequence Length
1019 nt
GC Content
0.5329
GCUCGCACUCCCGCUCCUCCGCCCGACCGCGCGCUCGCCCCGCCGCUCCUGCUGCAGCCCCAGGGCCCCUCGCCGCCGCCACCAUGGACGCCAUCAAGAAGAAGAUGCAGAUGCUGAAGCUCGACAAGGAGAACGCCUUGGAUCGAGCUGAGCAGGCGGAGGCCGACAAGAAGGCGGCGGAAGACAGGAGCAAGCAGCUGGAAGAUGAGCUGGUGUCACUGCAAAAGAAACUCAAGGGCACCGAAGAUGAACUGGACAAAUACUCUGAGGCUCUCAAAGAUGCCCAGGAGAAGCUGGAGCUGGCAGAGAAAAAGGCCACCGAUGCUGAAGCCGACGUAGCUUCUCUGAACAGACGCAUCCAGCUGGUUGAGGAAGAGUUGGAUCGUGCCCAGGAGCGUCUGGCAACAGCUUUGCAGAAGCUGGAGGAAGCUGAGAAGGCAGCAGAUGAGAGUGAGAGAGGCAUGAAAGUCAUUGAGAGUCGAGCCCAAAAAGAUGAAGAAAAAAUGGAAAUUCAGGAGAUCCAACUGAAAGAGGCCAAGCACAUUGCUGAAGAUGCCGACCGCAAAUAUGAAGAGGUGGCCCGUAAGCUGGUCAUCAUUGAGAGCGACCUGGAACGUGCAGAGGAGCGGGCUGAGCUCUCAGAAGGCCAAGUCCGACAGCUGGAAGAACAAUUAAGAAUAAUGGAUCAGACCUUGAAAGCAUUAAUGGCUGCAGAGGAUAAGUACUCGCAGAAGGAAGACAGAUAUGAGGAAGAGAUCAAGGUCCUUUCCGACAAGCUGAAGGAGGCUGAGACUCGGGCUGAGUUUGCGGAGAGGUCAGUAACUAAAUUGGAGAAAAGCAUUGAUGACUUAGAAGACGAGCUGUACGCUCAGAAACUGAAGUACAAAGCCAUCAGCGAGGAGCUGGACCACGCUCUCAACGAUAUGACUUCCAUGUAAACGUUCAUCCACUCUGCCUGCUUACACCCUGCCCUCAUGCUAAUGUAAUAAACUCACCACCAUGCCUUCCUUGCUCCCUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-325.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -343.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 222.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.((((.(((...((((((((....)))...((.(((((((((...(((....)))......((((((((..(.((...((.(((........)))))...((((..((((((((((((......)))))..))))))).))))(((....)))..)).)..)))))))).)).)))))))..))((((........))))((((((.((..............))))))))....................((((..((((((...))).)))..)))).(((((((((((.((((((....(((.((....((....))....)).)))))))))..))...)).)))))))))))).))).)))).)))..))))....)))).........(((((((...))))))).(((.(((...(((((((((((...((((((.((((((((((.(((((((((((((.((...(((.................)))...(((((.........)))))...(((((.((...(((((((.(..(((.(((.............)))))).(((...((((((((((.((...((..((((.......))).)..))..(((((.(((((...((((..(((((((....((......))............(..((((.((((...(((........((((.(((........)))))))..(((((...(((.(((........)))..))).))))).....)))....))))))))..))))))))..))))...))))).)))))..................)).))))))).)))...))).(((((((..((((...)))).))))..)))).)))))))...))))).)).)))))))).....))))))).))))).....))).))))))))..))))(((((....((......))...)))))..............)))))))...))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((.((((.(((...(((((({{.{,,|||,,,({,(((((((((,..(((....)))....,,((((((((....||,..{,((((........))))}...((((..((((((((((((......)))))..))))))).))))(((....)))..,,.,..)))))))).}).)))))))..}}{(((,,......)))|((((((.((..............}))))))),...................((((,.((((((...))).))),.)))).(((((((((((.((((((....(((.{{,...((....)),...)).)))))))))..))}.,,}.)))))))))))).))).)))).)))..))))..,{|||||...||{,.(((((((...})))))),(((.{((.{.(,(((((((((.,,{(((((,({(,,(((((.(((((((((((((,{{...(({.................}))...(((((.........)))))...((((,{((.,.(((((((.,..(((.{((.,.........,.)))))).(((...((((((((((.((...(({{(((......{{{{{{...,|((.(((({,((((,...{(((...(((..((((({......,..,,.....,,,|({{...((((((((...{.,...,..((((.(((........)))))))..,.....{.....}}.........))))))))..,)))....}))))..)))))))))}}))))).))).,)))})},.,))})),))..{,.....,........)).)))))))},))...))).(((((((..((((...)))).))))}.,)),.)))))))...))))).)).}))))))),....})))))).)))))...,.))),)))))))),.))))}|{{,....||,,}}..))...}))),..............})))}}}..})))}),,..
Back