Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001412270.1

Sequence Length

975 nt

GC Content

0.5867

AGAGCCUGGACCUACAGCGCUGUUGGUGGAGGUCCUGCCUCCAGGAAUAGAUGGACAUGGCCUGGCAGAUGAUGCAGCUGCUGCUUCUGGCUUUGGUGACUGCUGCGGGGAGUGCCCAGCCCAGGAGUGCGCGGGCCAGGACGGACCUGCUCAAUGUCUGCAUGAACGCCAAGCACCACAAGACACAGCCCAGCCCCGAGGACGAGCUGUAUGGCCAGGUGGGAGCUCCUCAAGGGCCCUCCCCAGGAAGUGUUCCUCUGGAUGACCUACCUGGGGCAGAGGAGCCAGAAUAUGGAGGAGAUGGCUGUGGUGGGGAGAGACUUAGUCCUGUGUCUUCCCCACCCAGUGCAGUCCCUGGAAGAAGAAUGCCUGCUGCACGGCCAGCACCAGCCAGGAGCUGCACAAGGACACCUCCCGCCUGUACAACUUUAACUGGGAUCACUGUGGUAAGAUGGAACCCACCUGCAAGCGCCACUUUAUCCAGGACAGCUGUCUCUGAGUGCUCACCCAACCUGGGGCCCUGGAUCCGGCAGGUCAACCAGAGCUGGCGCAAAGAGCGCAUUCUGAACGUGCCCCUGUGCAAAGAGGACUGUGAGCGCUGGUGGGAGGACUGUCGCACCUCCUACACCUGCAAAAGCAACUGGCACAAAGGCUGGAAUUGGACCUCAGGGAUUAAUGAGUGUCCGGCCGGGGCCCUCUGCAGCACCUUUGAGUCCUACUUCCCCACUCCAGCCGCCCUUUGUGAAGGCCUCUGGAGCCACUCCUUCAAGGUCAGCAACUAUAGUCGAGGGAGCGGCCGCUGCAUCCAGAUGUGGUUUGACUCAGCCCAGGGCAACCCCAAUGAGGAGGUGGCCAAGUUCUAUGCUGCGGCCAUGAAUGCUGGGGCCCCGUCUCGUGGGAUUAUUGAUUCCUGAUCCAAGAAGGGUCCUCUGGGGUUCUUCCAACAACCUAUUCUAAUAGACAAAUCCACAUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-387.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -402.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 287.50

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((.((.((.....(((((((..(((((((...)))))))..))))).)).....)))).)))....((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((.(.((((.(((.(((((((((((((((.....)).)))))....(((((((.((.....)).))......)))))..((((((..((.((...(((.((((....((((((((((.((((..(.(((((((((((......(((((((((.....((.....))..))))))))).......))).))))..)))).)((((((((((.((........)).)).))))))))..(((((((.(((((.........(((........))).........))))).))))))).))))...)))))))))))))).)))...)).))....))).)))..(((((..((((((....((((((((...(((((((..(((..((...))..)))..((((...))))..)))))))..((((.((....(((((...((((.....)))).))))).)).))))(((.(....).)))...))).)))))))))))....)))))))).))))).....(((....))).(((((......)))))....((((((((........)))).)))))))..))))))))))))))......((((...)))).....((((((..(((.........)))..))))))............))))).)))....))))..))))))))).))))))))((.((((((((((.....(((...)))(((((((((((((.((.((((..((((...((....))...)))).....)))))).))))))((((((...)))))).(((((.....)))))...)))))))...........((((....)))).)))).)))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

...(((.((.((.....(((((((..(((((((...)))))))..))))).)).....)))).)))....((((((((.(((((((((((((,(({({{(((((({((((,(,((((.(((.{(((((({(((((((.,,..|}.}}}}}.,..,{{{{{{.{{...,,},.}}|,,,,.,}}}{{{((,(,{((.,..||.,|,|||||.{{..((((((((((,((((,.,.(((((((((((,,..,,((((({{{|,....|{,.,,,)),.}}))))}))}......}}),))))..}}}|{,((((((((((.((........)).))}})))))))},(((((((.(((((..,..,...(((.,......)))...}..,..))))).))))))).}}}}...))))))))))..)).,.....|||||.,..,,|||{{..,.{({..,||,||,...,,,|||||...||||||{|||||,}||,||}{{{|||{{(,,..,,||||{{|||||....{{{{,|{....(((((...((((.....)))).))))).}}.))))||{.{....,.)))...)))}))))),|||||{||.}}},}}}})))))),}...(((....))).{{|{(.....,)))))....((((((((........)))).)))))}}..))))})))}))))},,,,,,||||,...,,,.....((((((..({(,{{...,,.)))..))))))..,}}}}},...))})),}})}},.))))..))))))))).))))))))((.((((((((((.....{((..,||}{((((({((((((.((.((((.,((((.,,((....)).,,))}},,,..)))))).)))))){((({{...,,,)))}(((((.....))))),..))))))}...........((({....}))).)))).)))))).))