Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001413554.1
Sequence Length
1422 nt
GC Content
0.4360
GACCUUCAGCGUUGCCCUGGCGGAGCAGAGACAGGCCCUCGGGGUGGAGGUCUUUGGUUUCAUAAGAGCCUGAGAGAGAUUUUUCUAAGAUAUGUGUAACACACCAACGUACUGUGACCUAGGAAAGGCUGCUAAGGAUGUCUUCAACAAAGGAUAUGGCUUUGGCAUGGUCAAGAUAGACCUGAAAACCAAGUCUUGUAGUGGAGUGGAAUUUUCUACUUCUGGUCAUGCUUACACUGAUACAGGGAAAGCAUCAGGCAACCUAGAAACCAAAUAUAAGGUCUGUAACUAUGGACUUACCUUCACCCAGAAAUGGAACACAGACAAUACUCUAGGGACAGAAAUCUCUUGGGAGAAUAAGUUGGCUGAAGGGUUGAAACUGACUCUUGAUACCAUAUUUGUACCGAACACAGGAAAGAAGAGUGGGAAAUUGAAGGCCUCCUAUAAACGGGAUUGUUUUAGUGUUGGCAGUAAUGUUGAUAUAGAUUUUUCUGGACCAACCAUCUAUGGCUGGGCUGUGUUGGCCUUCGAAGGGUGGCUUGCUGGCUAUCAGAUGAGUUUUGACACAGCCAAAUCCAAACUGUCACAGAAUAAUUUCGCCCUGGGUUACAAGGCUGCGGACUUCCAGCUGCACACACAUGUGAACGAUGGCACUGAAUUUGGAGGUUCUAUCUACCAGAAGGUGAAUGAGAAGAUUGAAACAUCCAUAAACCUUGCUUGGACAGCUGGGAGUAACAACACCCGUUUUGGCAUUGCUGCUAAGUACAUGCUGGAUUGUAGAACUUCUCUCUCUGCUAAAGUAAAUAAUGCCAGCCUGAUUGGACUGGGUUAUACUCAGACCCUUCGACCAGGUAAGAGUCAAAUUGACUUUAUCAGCUUUAAUCGAUGGGAAGAACUUCAGUGCAGGAGGUCACAAGGUUGGCUUGGGAUUUGAACUGGAAGCUUAAUGUGGUUUGAGGAAAGCAUCAGAUUUGUCCCUGGAAGUGAAGAGAAAUGAACCCACUAUGUUUUGGCCUUAAAAUUCUUCUGUGAAAUUUCAAAAGUGUGAACUUUUUAUUCUUCCAAAGAAUUGUAAUCCUCCCCACACUGAAGUCUAGGGGUUGCGAAUCCCUCCUGAGGGAGAUGCUUGAAGGCAUGCCUGGAAGUUGUCAUGUUUGUGCCACGUUUCAGUUCAGUUCUGAAGUGUUAUUAAAUGUGUUCCUCAGCGACAGUGUAGCGUCAUGUUAGAGGAGACGAUCUGACCCACCAGUUUGUACAUCACGUCCUGCAUGUCCCACACCAUUUUUUCAUGACCUUGUAAUAUACUGGUCUCUGUGCUAUAGUGGAAUCUUUGGUUUUGCAUCAUAGUAAAAUAAAAUAAACCCAUCACAUUUGGAACAUAACUGCUCAUGUGACUUGCUGGUGAUGGUUUUCUUACCUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-408.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -435.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 458.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(((((((..((((((((.(((((.(((((.(((((((((((((.(((((((((......((((((...(((....))).((.(((((...........)))))))((((((.....((((((((((((((((((((......)))))))..)))))))..((((......)))).........)))))).....((((((((....)))))))).))))))((((.(.(((...))).).)))).))))))......)))))))))....((((((((....))))))))))))))))))............(((.((((.(((((((((......)))))..)))).....)))).)))(((((((......)))))))....((((.(((...((.......))...)))..)))).....))).))))).((((((.(.((..(((.......((((((((((((((((...(((((.((((((((((.(((....))).))(((((((((((..((((...(((((((....)))))))...))))..)))))))))))...........))).))))).))))).(((.((.....)).))).(((((((((((((((((((....))))...(((((.(((.........))).)))))..(((((((((..(((.((.(.......).)))))..))))).).))).)))))))))))........)))).))))))))))))))))..)))..)).).))))))....)))))))))))))..))))(((((.((((((.....)).))))))))).......(((.((((..((((.(((((((...)))))))....))))...)))).)))...........))).))))))).((((((.((...((((((((((((...(((((..(((((...(((((..(((.........((..((((((.((((((...(((..(((........)))..)))...))))))...........((((((....))))))....))))))..))..)))..))))).)))))...))).))...)))).)))))))).))...((((.((((..(((((((((.(........).)))))))....(((((((((.((((....)))).)).....)))))))((((((((((((........)))..))).))))))((((.(((......))).))))........))..)))).))))...(((((....(((((((..(((...))).))))...)))....)))))........(((((((......))))))).........(((((((....(..((((........))))..)......))))))).......)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{((((({((,{{((,,({({(({(|{{{{,.{{{{(,((,((((((((((.(((((((((....,.((((((,{{(,...,}))).,{.({((({,.....,...}}}}}}}{(((((.....{{((((((((((((((((((......)))))))..))))))),.((((......)))),,.....,,}))))).....((((((((....)))))))).)))))}((((.{.(((...))),}.)))).))))))....,.)))))))))....((((((((....)))))))))))))))))).,,...|,....{{{.,,,{.(((((((((......}))))..)))).,,,.|||||}|}(((((((,....,))))))).,..|||{.|||||.{{.......}|,{{{||,.||||{,...|||{|}}||{(((({(,({((.,(((,...,{{(((((((({{{(({||.,,{((({.(((((((({{.(({....})).}}(((((((((({..((((...(((((((....)))))))...))))..}))))))))))...........))).))))).))))}{(((,({.....)},))}.||||(((((((((((((((....})))...(((((.(((.........))).)))))..(((((((((..(((.((.{.......}.)))))..))))).}}})).)))))))))))...,,..,)))),}||||||||}|}}}})||}}}.,|},|.,,||||,...}}}},})))))},.|||}.,||||,||{((({{.,{||,||||{||,,.,,..},|||,||||.,||||.(((((({...}))))))....,}},...}}}),)))..}..}}}}}||||,|||}|||,(({{{{,{(|,{{((({{(((((({(,.(((,..((({(,.,(({{{,,((({,.{,{...,{.,{(((({,((((((...(({..(((........)))..}}}..,|||||},,.({,...,,{(((((....)))))}.,..})))))}}))}}}}},,,}}}}.,}}}},,,,,)},},}}))}}|}}}}||||{....})))},|||}|,..,(((((({,{{{.....,,)},}},,}})))|||||||||}}}}..}))})))),..,}}..})))}|||||||||{||,.,..,,,}})..))).))))}}((((.(((......))).)))).,...}}.)))})))},)))))}.||,||,},,|,.((((..(({...})).)))).,,)}}|,|,,|}}}.,,,..,,|{(((((......)))))}}.,,..,,,.(((((((....(,.((((........))))..)......)))))))}},....,}},,}.
Back