Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001413681.1

Sequence Length

1395 nt

GC Content

0.4910

AGUCUCCUCCUCUGCGUCCUCGGCCGCGGCCCGGGUCCCUCGCAAAGCCGCUGCCAUCCCGGAGGGCCCAGCCAGCGGGCUCCCGGAGGCUGGCCGGGCAGGCGUGGUGCGCGGUAGGAGCUGGGCGCGCACGGCUACCGCGCGUGGAGGAGACACUGCCCUGCCGCGAUGGGGGCCCGGGGCGCUCCUUCACGCCGUAGGCAAGCGGGGCGGCGGCUGCGGUACCUGCCCACCGGGAGCUUUCCCUUCCUUCUCCUGCUGCUGCUGCUCUGCAUCCAGCUCGGGGGAGGACAGAAGAAAAAGGAGAAUCUUUUAGCUGAAAAAGUAGAGCAGCUGAUGGAAUGGAGUUCCAGACGCUCAAUCUUCCGAAUGAAUGGUGAUAAAUUCCGAAAAUUUAUAAAGGCACCACCUCGAAACUAUUCCAUGAUUGUUAUGUUCACUGCUCUUCAGCCUCAGCGGCAGUGUUCUGUGUGCAGGCAAGCUAAUGAAGAAUAUCAAAUACUGGCGAACUCCUGGCGCUAUUCAUCUGCUUUUUGUAACAAGCUCUUCUUCAGUAUGGUGGACUAUGAUGAGGGGACAGACGUUUUUCAGCAGCUCAACAUGAACUCUGCUCCUACAUUCAUGCAUUUUCCUCCAAAAGGCAGACCUAAGAGAGCUGAUACUUUUGACCUCCAAAGAAUUGGAUUUGCAGCUGAGCAACUAGCAAAGUGGAUUGCUGACAGAACGGAUGUUCAUAUUCGGGUUUUCAGACCACCCAACUACUCUGGUACCAUUGCUUUGGCCCUGUUAGUGUCGCUUGUUGGAGGUUUGCUUUAUUUGAGAAGGAACAACUUGGAGUUCAUCUAUAACAAGACUGGUUGGGCCAUGGUGUCUCUGUGUAUAGUCUUUGCUAUGACUUCUGGCCAGAUGUGGAACCAUAUCCGUGGACCUCCAUAUGCUCAUAAGAACCCACACAAUGGACAAGUGGGUCUUCUCCUGUGGCCCAGGCUGGAGUUCAGUGGCGUGAUCACAGCCUACUUUUAACUUCAAAAUCCUAGGCUCAAGCCAUCCUCCCACCUCAGCCUCCUUAGUAGCUGGGACUACAGGUGCAUGCCACUGCACCCAACUAAUUUUUAAAAUUUUUUGUAGAGACAGGGUCUUGCUAUGUCAUCUAGGCUGGUCUUGGACUCCUAGCCUCAAGUGAUACUCCAGCACUGGCCUGCCAAAGUACCAGGAUUACAGAGGUGAGCCAACCAUGUGCAGCCAUCUUCAGCCUAUUUUAAAUGAACAAUUUUUUAAAAAUACACUGUAAAUAUAACUAGCAAUCAUUUAACUGUAACAACUAUUCAGUGAAUUGUAAUGUAUAUUUUAUUACUGGUAAUUAAUUAAUUCAUUAAUAAAGGCAUUCUCAUUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-464.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -489.02

Frequency: 0.0000

Diversity: 445.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((..(((((....(((((((((((((.(((.((((...(((((.(((..(((((.....((((((..(((....)))..)))))))))))..))))))))..))))..))).)))))).)))..))))...))))).))))))))).(((((((((.(.((.(((((((...))).)))).)).)(((...)))..))))))))).(((((((((....)))((((((((....)))).(((((((((.((((.(((......)))..))))..)))))))))..(((((.....(((..(((.(((((((...........))))))).(((((...))))))))..)))..))))).........))))(((((((.....)))))))...(((..((((((........(((((..((((((((((((((((......((((..(((((((....)))).)))))))((((..(((((.............(((((..(....).))))))))))..))))...(((.((.(((((.(((.....(((.(((..((((((((((((((((.((((................)))))))).))))...))))).)))..))).)))..(((....))))))))))))).)))........(((((....)))))...)))).))))))..)))))).)))))...((((.((..((((((....))))))..)).)))).............((((((((....((...((((.(((((((((((((((..(((((...(((.....((((.((((....((((..((......))..))))...(.(((((((((((.....(((.((..((((........))))....)))))(((((((.((((....))))...)))))))......((((.(((((...........)))))))))...))))))))))).)(((((((.((((((.........))).)))...)))))))...))))...)))))))...)))))...((((((..(....)..))))))......((((((......))))))(((..(((((...)))))..)))((((((((.(((...))).)))).))))((((((..........)))))).)))))))))))..))))..)))).))....))))))))......)))))).)))........)))))).......((((...((((.(((...(((..((((...(((.(.(((((((((....(((((((((.((..((....))..)).)))).)))))....)))))....)))).)))).))))..))))))))))...))))............

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{((((((((,{(({((....(((((((((((((.(((.((((...(((((.(((..(((((.....((((((..(((....)))..)))))))))))..))))))))..))))..))).)))))).))).,)))}..,|}|||,|||||||}}.{(((((((((.{,,.,|,|||{.},)))})))),)),))}},,.)))..|||||||||{(((,(((({....,,,.,,|((((....)))).,{{,,{,{|.||,|}|||}}}}}})),..}})).})))))))))..|,,,,,{{{,((({{{||||{,(((({....,.{(((({(|{{{(((((({{.||||,|{..,,|{{.{{....}}.}}}.{((({(((((((.....)))))))...,,|}}}|,||,,,,.,}}}}}|||.,,||,,,,|,||||||||}}...{{{|,,|||{(((.,..)}||,||||||}{{((..{((((.............(((((..{....}.)))))}}))}..)))},,,||,.,,,|||||{|||||,|.{((,(((,{(((((((((((.((((.((({................))))))))})))).},,}))),},,..|||,|||,{(((({(((((..|||{(|,{{{{{{...,...,(((({{...|||,..{||,|.,,,))}{{|||}},,||||..,|((((.{(..((((({....}))))),,|}.}}}).,...}},.,,...||}||,|}}..,}}}})),..,|||))}))))}}}.,}.,)))}})))}}}..}}},)}})}}}...,,,|,|||}},,,......{{{{.((((((,({((((({{.{{(((.{(,.((({...,,.,.)))}..,{}}}}}(((((((.((((....))))...))))))),|,,,.{(({{(((((...........))))))))).{{{{||{{|((((((((((((((((((((.((,....{(((((.{{({......}}))...)))))))).)))}}........((((((..(....)..))))))......((((((......)))))){{{..((((,...}))))..))){(((((((.(((...))).)))).)))|((((((,,...}},,,)}))))},.,,))),)))))))).)))),,.))))..,,,,))))}...,,)))))),))}.}))))}},)))))}}}},..((((.,.{(,(((((,..,((..((({...{{(.{.(((((((((....(((((((((.{(..((....))..}}.))))}}))))....)))))),..,,}}.}))).})))..}}))))))}}.,,)))),}}}}}.,,,,.