Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001413682.1

Sequence Length

1985 nt

GC Content

0.4312

AGUCUCCUCCUCUGCGUCCUCGGCCGCGGCCCGGGUCCCUCGCAAAGCCGCUGCCAUCCCGGAGGGCCCAGCCAGCGGGCUCCCGGAGGCUGGCCGGGCAGGCGUGGUGCGCGGUAGGAGCUGGGCGCGCACGGCUACCGCGCGUGGAGGAGACACUGCCCUGCCGCGAUGGGGGCCCGGGGCGCUCCUUCACGCCGUAGGCAAGCGGGGCGGCGGCUGCGGUACCUGCCCACCGGGAGCUUUCCCUUCCUUCUCCUGCUGCUGCUGCUCUGCAUCCAGCUCGGGGGAGGACAGAAGAAAAAGGAGAAUCUUUUAGCUGAAAAAGUAGAGCAGCUGAUGGAAUGGAGUUCCAGACGCUCAAUCUUCCGAAUGAAUGGUGAUAAAUUCCGAAAAUUUAUAAAGGCACCACCUCGAAACUAUUCCAUGAUUGUUAUGUUCACUGCUCUUCAGCCUCAGCGGCAGUGUUCUGUGUGCAGGCAAGCUAAUGAAGAAUAUCAAAUACUGGCGAACUCCUGGCGCUAUUCAUCUGCUUUUUGUAACAAGCUCUUCUUCAGUAUGGUGGACUAUGAUGAGGGGACAGACGUUUUUCAGCAGCUCAACAUGAACUCUGCUCCUACAUUCAUGCAUUUUCCUCCAAAAGGCAGACCUAAGAGAGCUGAUACUUUUGACCUCCAAAGAAUUGGAUUUGCAGCUGAGCAACUAGCAAAGUGGAUUGCUGACAGAACGGAUGUUCAUAUUCGGGUUUUCAGACCACCCAACUACUCUGGUACCAUUGCUUUGGCCCUGUUAGUGUCGCUUGUUGGAGGUUUGCUUUAUUUGAGAAGGAACAACUUGGAGUUCAUCUAUAACAAGACUGGUUGGGCCAUGGUGUCUCUGUGUAUAGUCUUUGCUAUGACUUCUGGCCAGAUGUGGAACCAUAUCCGUGGACCUCCAUAUGCUCAUAAGAACCCACACAAUGGACAAGUGAGCUACAUUCAUGGGAGCAGCCAGGCUCAGUUUGUGGCAGAAUCACACAUUAUUCUGGUACUGAAUGCCGCUAUCACCAUGGGGAUGGUUCUUCUAAAUGAAGCAGCAACUUCGAAAGGCGAUGUUGGAAAAAGACGGAGUGUAGUAUCUCAUGUGGCUGCCGUGGUUCCUUUAAUAAUUAUUAACCCCUCCCUGCACUGAGUUCCUCUGCCUUCCCAUAUACAAGUACUUGAGUAGCAUUAUUUUGUUCCACUGCAUAGGAUCAAGUAAUUAUCUUCUGUCUUACUUGAUCACACAUUUCAAGCCUCAUUUCUGAUAGAGCACAACCCAAUGGGGCUACUAAAAAGGAGCAAAGGGAAUGAAAAGAGUGCUUUAUUCUUCUGAAAAAUAAAAAAGGAGAUGGAAGGAAAAGAAAAGAAAGACGUGUUAGAUAAAAUGACAGAUUUGGGAAGUAUAGAGUAAAUAAUUUUGUAAUUAAUUAUAGGUUUUUAUAAACAAAGUUGUUACUAUGCUGUAUCUGGGUCCUGGUAUGUGUCAUACAGGGAUAUUCUAUAAUUUUCAAAAAUGUUUUUUUUAUUUUAUGAUACUCACAGACUCAUUUUUUGCUUUAUUUUCUCCCAAUAUUCAUUUGAAGUUCAGCUGCAUGAGUGUUGUCUGAAAUGAAAUGUCAGAGGCUACACUUGGAUGCUAUUAAAUGUUUGUGUUGUUUCACAAUUCAUAUUCAAAACUUAGAAGAUAUUCCUGUAGAGUUGCAUAAAAAUUGACACAUUUGCAGACCAUAUUUUGACAAAGCCGUACCUUAUGUACUCCAUGAUUGCCAGAAUUGCAGUUAAACUUGGUUUGGUUUAUAUAUUGGAAAAAAUUUUAAAAAUCAUAGUUCCUUAUUAUAGAAUCAUAUAGAUCUGUUUGAUUUUCCUUAUUUUCUUCUGCUUUAAUCUUUCUCUAUUUUACAAAUAACUUCAAAUAUUUUUCAAAUUGUUUAGAAUUCUCUGAAGUGAAUAAAAGGUGUAUUGUGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-597.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -631.01

Frequency: 0.0000

Diversity: 420.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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