Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001414156.1

Sequence Length

2683 nt

GC Content

0.5975

ACACAAAGGCUGCUGCUGCCGCCAGAGGAAGGACUGCUCUGCACGCACCUGGCAUGGUGGCUUUGCCAAUGGUCCUUGUUUUGCUGCUGGUCCUGAGCAGAGGUGAGAGUGAAUUGGACGCCAAGAUCCCAUCCACAGGGGAUGCCACAGAAUGGCGGAAUCCUCACCUGUCCAUGCUGGGGUCCUGCCAGCCAGCCCCCUCCUGCCAGAAGUGCAUCCUCUCACACCCCAGCUGUGCAUGGUGCAAGCAACUGAACUUCACCGCGUCGGGAGAGGCGGAGGCGCGGCGCUGCGCCCGACGAGAGGAGCUGCUGGCUCGAGGCUGCCCGCUGGAGGAGCUGGAGGAGCCCCGCGGCCAGCAGGAGGUGCUGCAGGACCAGCCGCUCAGCCAGGGCGCCCGCGGAGAGGGUGCCACCCAGCUGGCGCCGCAGCGGGUCCGGGUCACGCUGCGGCCUGGGGAGCCCCAGCAGCUCCAGGUCCGCUUCCUUCGUGCUGAGGGAUACCCGGUGGACCUGUACUACCUUAUGGACCUGAGCUACUCCAUGAAGGACGACCUGGAACGCGUGCGCCAGCUCGGGCACGCUCUGCUGGUCCGGCUGCAGGAAGUCACCCAUUCUGUGCGCAUUGGUUUUGGUUCCUUUGUGGACAAAACGGUGCUGCCCUUUGUGAGCACAGUACCCUCCAAACUGCGCCACCCCUGCCCCACCCGGCUGGAGCGCUGCCAGUCACCAUUCAGCUUUCACCAUGUGCUGUCCCUGACGGGGGACGCACAAGCCUUCGAGCGGGAGGUGGGGCGCCAGAGUGUGUCCGGCAAUCUGGACUCGCCUGAAGGUGGCUUCGAUGCCAUUCUGCAGGCUGCACUCUGCCAGGAGCAGAUUGGCUGGAGAAAUGUGUCCCGGCUGCUGGUGUUCACUUCAGACGACACAUUCCAUACAGCUGGGGACGGGAAGUUGGGCGGCAUUUUCAUGCCCAGUGAUGGGCACUGCCACUUGGACAGCAAUGGCCUCUACAGUCGCAGCACAGAGUUUGACUACCCUUCUGUGGGUCAGGUAGCCCAGGCCCUCUCUGCAGCAAAUAUCCAGCCCAUCUUUGCUGUCACCAGUGCCGCACUGCCUGUCUACCAGGAGCUGAGUAAACUGAUUCCUAAGUCUGCAGUUGGGGAGCUGAGUGAGGACUCCAGCAACGUGGUACAGCUCAUCAUGGAUGCUUAUAAUAGCCUGUCUUCCACCGUGACCCUUGAACACUCUUCACUCCCUCCUGGGGUCCACAUUUCUUACGAAUCCCAGUGUGAGGGUCCUGAGAAGAGGGAGGGUAAGGCUGAGGAUCGAGGACAGUGCAACCACGUCCGAAUCAACCAGACGGUGACUUUCUGGGUUUCUCUCCAAGCCACCCACUGCCUCCCAGAGCCCCAUCUCCUGAGGCUCCGGGCCCUUGGCUUCUCAGAGGAGCUGAUUGUGGAGUUGCACACGCUGUGUGACUGUAAUUGCAGUGACACCCAGCCCCAGGCUCCCCACUGCAGUGAUGGCCAGGGACACCUACAAUGUGGUGUAUGCAGCUGUGCCCCUGGCCGCCUAGGUCGGCUCUGUGAGUGCUCUGUGGCAGAGCUGUCCUCCCCAGACCUGGAAUCUGGGUGCCGGGCUCCCAAUGGCACAGGGCCCCUGUGCAGUGGAAAGGGUCACUGUCAAUGUGGACGCUGCAGCUGCAGUGGACAGAGCUCUGGGCAUCUGUGCGAGUGUGACGAUGCCAGCUGUGAGCGACAUGAGGGCAUCCUCUGCGGAGGCUUUGGUCGCUGCCAAUGUGGAGUAUGUCACUGUCAUGCCAACCGCACGGGCAGAGCAUGCGAAUGCAGUGGGGACAUGGACAGUUGCAUCAGUCCCGAGGGAGGGCUCUGCAGUGGGCAUGGACGCUGCAAAUGCAACCGCUGCCAGUGCUUGGACGGCUACUAUGGUGCUCUAUGCGACCAAUGCCCAGGCUGCAAGACACCAUGCGAGAGACACCGGGACUGUGCAGAGUGUGGGGCCUUCAGGACUGGCCCACUGGCCACCAACUGCAGUACAGCUUGUGCCCAUACCAAUGUGACCCUGGCCUUGGCCCCUAUCUUGGAUGAUGGCUGGUGCAAAGAGCGGACCCUGGACAACCAGCUGUUCUUCUUCUUGGUGGAGGAUGACGCCAGAGGCACGGUCGUGCUCAGAGUGAGACCCCAAGAAAAGGGAGCAGACCACACGCAGGCCAUUGUGCUGGGCUGCGUAGGGGGCAUCGUGGCAGUGGGGCUGGGGCUGGUCCUGGCUUACCGGCUCUCGGUGGAAAUCUAUGACCGCCGGGAAUACAGUCGCUUUGAGAAGGAGCAGCAACAACUCAACUGGAAGCAGGACAGUAAUCCUCUCUACAAAAGUGCCAUCACGACCACCAUCAAUCCUCGCUUUCAAGAGGCAGACAGUCCCACUCUCUGAAGGAGGGAGGGACACUUACCCAAGGCUCUUCUCCUUGGAGGACAGUGGGAACUGGAGGGUGAGAGGAAGGGUGGGUCUGUAAGACCUUGGUAGGGGACUAAUUCACUGGCGAGGUGCGGCCACCACCCUACUUCAUUUUCAGAGUGACACCCAAGAGGGCUGCUUCCCAUGCCUGCAACCUUGCAUCCAUCUGGGCUACCCCACCCAAGUAUACAAUAAAGUCUUACCUCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1163.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1205.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 764.73

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.......(((.((....)).))).((((.((((((((((((((((..((((((((((((..(((((.....((((....((((((.((.(.(((......)))).))))))))..))))(((.........(((.(((((((((((((((..((((...(((.(((((((((((((((((((((((..((..((((((((..((((.(((......(((((((........(((.((((...)))))))............((((.((....)).)))).((((((....))))))....))))))).(((((((((((.((((.((((((.....))).)).).)))).)).)))))))))....(((.((.(((((((((((((.....)))))((...))((((.(((((....(((((((((.((.(((..((((((((..(((((....((((....)))))))))..((((((((((((((((.....)))))).....)))))))))).....(((((((((..........)))))).)))..)))))))).))))))))))))))..))))).)))))))))))).)).)))((.(((((...(((((((((((((((((((((..(((.....)))))))))((((((((((.......(((((...(((.((((.((((.((......((((((((.((((((.......))))))....(((.((((......(((((.((((((....))))))))))).......)))).)))))))))))(.((((((((((((((....))))))..(((((.(((((((......)))).))).))))).)))))))).).)).)))).))))..)).)...)))))((((((((.((((((((.........)).)))..)))..))))))))(((.....)))))))))))))....((((((....))))))..((((.(((.....))))))).....)))).)).))))))))).))))).))((((((((((.(((((((....(((.((....((((((((.............))))))))....)).)))...))))))))))).))))))..((((......)))).....)))))))..)))).))))..))))))))))))))...))).))))(((..((((((((((((....((((((((.(((((.(((((((((...((((.....(((((((((.(((.((......((((((........)))))))).))).))..)))))))....((((((.((...((((((.(((((((....(((((((((.(((((.((...)).)))))((((((((..(((((((((...(((((..(((......)))...)))))...)))....))))))...))))))))))))).)))))))))))..(((((((.(((((....))))).))))..)))((.((((....(((....)))..(((((((((((((........)))))..(((....))))))))))))))).))..((((((((.(........).))))))))))))))))))).)))(((.(((((...))))).))).....(((((((...)))))))))))..))))))))).......)))))((((((....))))))))))).))).)))))))))))).))).)))).))))))).))))............))))))))))).)))(((.((((((((.......(((((((((..((..((...(((..((((((.(((((.(..((((..(((((((....((((..((.(((((..((((((....).))))).)))))))..))))..)))))))..))))..).))))).))))..))..))).))..))))))))))))))))))).)))..))).))))).)))))))).........))))..))))))))))((((((....((((((((((((.(.((((.(((.((((....((...(((.(((........(((.(((((((.((..((.(((((..(((.((((((((((....((........)).....))))))))))..)))....))))).))..)).))))).)))))((((.((((..........(((........)))))))))))..((((((.(((......))).)))))).))).)))...))))))))))))))))))))))))))(((....)))(((((((((..........))))))))).....(((((((((((((((((........(((...(((....)))...)))..(((((((.......(((....)))...........(((((((((((...)))))...((((((((((((((.(((((((.((((.(.(((....)))))))))))))))))))...)))))).)))))))))))))))))((((((((.((((...((((((.(((.(((....))).))).)))))))))).).))))))).)))).))))))))))))).(((....)))......((((((..((((....))))..))..))))...))))))...............)))))).))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.......(((.((....)).))).((((.((((((((((((((((..((((((((((((.(((,((,...,(((({.({(,,((,((((((((({{({{.{(({{((.|||,.,,{{,,.||,..{{{{(.,,,....}))}|((({.....})))}...}|))))))|.{{{.{(((((({((((.{(({{{{((..((((,,(((((..,,((.(((((((......,.(((,{((,..,}))}}})...||....,,,((((.((....)).)))).((((({....})))))....))))))))),,|||||,,|}||{{,|{{|||,,,,,)}),}}.}.}})),)).)))))))))}},,|}}},}))))))))),)).,|}},}))))|,(,,{|,(((({(((((.(({(((((((({,((.(((..((((((((..(((((....((((....)))))))))..((((((((((((((((,...,)))))).....)))))))))).....(((((((((..........))))))}}))..)))))))).)))))))))))))).))),,|{|||,(({{||||{{{{(((((.(((((...(((((((((((((((((((((..(((.....))))))))){(((((((((....,,.(((((.,.{({.((((.((((.((......(((((((({{((({({{.{{{,},}|}}....,,|.||{,......(((((.((((((....))))))))))).}}.,,,,))).)),))))))))|.((((((((((((((....))))))..(((((.(((((((......))))}})).))))).)))))))),,.)).)))).))))..)).,...)))))((((((((.((((((({......,..))})},..)))..)))))))){{|,.,..}}})))))))))}....((((((....))))))..((((.(((.....))))))).....)))).)).))))))))).))))).,,({{{{(((((.(((((((..,.(((.((....((((((((.,,.......,,.))))))))....)).)))...)))))))}))),,}|}||.,,{{,...||.}}}}...,,}))))))}}))|,.((({{({,..,)))}})))..{((,((,||{(((..(((((((((({{....{(((((((,((((({(((((((((...(,(({{{{...((((((((((((,,...........}.)))))))...)))))..,|,|)||||||||||||..{|{{|,{{{..,|(({{.(((,.,,}}}}}|}{{{,,..(((((.{{...}}.)))))|,||||||},,||||||||...{|||({{.((({{.{,.,,..,),)))}}.))),|,,}||)}}|||}}|||||||||||.|{|||||{|||,.,,|||||,|||{{.,,,|||||,}}},..|||{.,,}})},.,||||||}}},.{(((((((((((((........)))))..(((....)))))))))))}}}.,||,|||||||{|,{..,,.,,,}.))))))))),))}.((((((.......)))))).||,}})}}}||....(((((((...)))))))}))),.})))))))).,.....)))))((((((....))))))))))).))}.)))))))))))).)))}}},)),)))))))),,,)}}}}.......))))))))))}})),|||.((((((((.......(((((((({..{{..((...(((..((((((.(((((.{..((({..(((((((....((((..((.(((((..((((((....}.))))).))))}))..))))..)))))))..))))..}.))))).))))..))..))).}}..})))))))))))))))))).))),.))),}}))).)))))))}........}))))..))))))))))((((((....((((((((((((.,.((((.((,{((((..,,(.,..,(({(((........(((.(((((((.((,,((.(((((..(({.{((((((((({,..((,{,,,...||,,...,)))))))))},}||{{..}}})).))..}}.))))).)))))((((.(((({...,,..,.,|||,......)))}))))}))..((((((.(((......))).)))))).)))})))},})})))))))))))}))))))))))))(({....}))(((((((((..........))))))))).....(((((((((((((((((........{({...(((....)))...)))..(((((((.......(((....})).........,.(((((((((((...)))))...((((((((((((((.((((((((((((.(.(({....})))))))))))))))))),..)))))),}))))))))))))))))((((((({.((((...((((((.(((.(({....})).))).)))))))))).}.))))))).)))).))))))))))))).(((..,,}|}..,,..{{{{{{..((({....})))..)}},))))...))))))...............)))))).))))...