Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001414167.1

Sequence Length

2544 nt

GC Content

0.5967

AUUACAGGGCAUGGUGGCUUUGCCAAUGGUCCUUGUUUUGCUGCUGGUCCUGAGCAGAGGUGAGAGUGAAUUGGACGCCAAGAUCCCAUCCACAGGGGAUGCCACAGAAUGGCGGAAUCCUCACCUGUCCAUGCUGGGGUCCUGCCAGCCAGCCCCCUCCUGCCAGAAGUGCAUCCUCUCACACCCCAGCUGUGCAUGGUGCAAGCAACUGAACUUCACCGCGUCGGGAGAGGCGGAGGCGCGGCGCUGCGCCCGACGAGAGGAGCUGCUGGCUCGAGGCUGCCCGCUGGAGGAGCUGGAGGAGCCCCGCGGCCAGCAGGAGGUGCUGCAGGACCAGCCGCUCAGCCAGGGCGCCCGCGGAGAGGGUGCCACCCAGCUGGCGCCGCAGCGGGUCCGGGUCACGCUGCGGCCUGGGGAGCCCCAGCAGCUCCAGGUCCGCUUCCUUCGUGCUGAGGGAUACCCGGUGGACCUGUACUACCUUAUGGACCUGAGCUACUCCAUGAAGGACGACCUGGAACGCGUGCGCCAGCUCGGGCACGCUCUGCUGGUCCGGCUGCAGGAAGUCACCCAUUCUGUGCGCAUUGGUUUUGGUUCCUUUGUGGACAAAACGGUGCUGCCCUUUGUGAGCACAGUACCCUCCAAACUGCGCCACCCCUGCCCCACCCGGCUGGAGCGCUGCCAGUCACCAUUCAGCUUUCACCAUGUGCUGUCCCUGACGGGGGACGCACAAGCCUUCGAGCGGGAGGUGGGGCGCCAGAGUGUGUCCGGCAAUCUGGACUCGCCUGAAGGUGGCUUCGAUGCCAUUCUGCAGGCUGCACUCUGCCAGGAGCAGAUUGGCUGGAGAAAUGUGUCCCGGCUGCUGGUGUUCACUUCAGACGACACAUUCCAUACAGCUGGGGACGGGAAGUUGGGCGGCAUUUUCAUGCCCAGUGAUGGGCACUGCCACUUGGACAGCAAUGGCCUCUACAGUCGCAGCACAGAGUUUGAGCUGAGUAAACUGAUUCCUAAGUCUGCAGUUGGGGAGCUGAGUGAGGACUCCAGCAACGUGGUACAGCUCAUCAUGGAUGCUUAUAAUAGCCUGUCUUCCACCGUGACCCUUGAACACUCUUCACUCCCUCCUGGGGUCCACAUUUCUUACGAAUCCCAGUGUGAGGGUCCUGAGAAGAGGGAGGGUAAGGCUGAGGAUCGAGGACAGUGCAACCACGUCCGAAUCAACCAGACGGUGACUUUCUGGGUUUCUCUCCAAGCCACCCACUGCCUCCCAGAGCCCCAUCUCCUGAGGCUCCGGGCCCUUGGCUUCUCAGAGGAGCUGAUUGUGGAGUUGCACACGCUGUGUGACUGUAAUUGCAGUGACACCCAGCCCCAGGCUCCCCACUGCAGUGAUGGCCAGGGACACCUACAAUGUGGUGUAUGCAGCUGUGCCCCUGGCCGCCUAGGUCGGCUCUGUGAGUGCUCUGUGGCAGAGCUGUCCUCCCCAGACCUGGAAUCUGGGUGCCGGGCUCCCAAUGGCACAGGGCCCCUGUGCAGUGGAAAGGGUCACUGUCAAUGUGGACGCUGCAGCUGCAGUGGACAGAGCUCUGGGCAUCUGUGCGAGUGUGACGAUGCCAGCUGUGAGCGACAUGAGGGCAUCCUCUGCGGAGGCUUUGGUCGCUGCCAAUGUGGAGUAUGUCACUGUCAUGCCAACCGCACGGGCAGAGCAUGCGAAUGCAGUGGGGACAUGGACAGUUGCAUCAGUCCCGAGGGAGGGCUCUGCAGUGGGCAUGGACGCUGCAAAUGCAACCGCUGCCAGUGCUUGGACGGCUACUAUGGUGCUCUAUGCGACCAAUGCCCAGGCUGCAAGACACCAUGCGAGAGACACCGGGACUGUGCAGAGUGUGGGGCCUUCAGGACUGGCCCACUGGCCACCAACUGCAGUACAGCUUGUGCCCAUACCAAUGUGACCCUGGCCUUGGCCCCUAUCUUGGAUGAUGGCUGGUGCAAAGAGCGGACCCUGGACAACCAGCUGUUCUUCUUCUUGGUGGAGGAUGACGCCAGAGGCACGGUCGUGCUCAGAGUGAGACCCCAAGAAAAGGGAGCAGACCACACGCAGGCCAUUGUGCUGGGCUGCGUAGGGGGCAUCGUGGCAGUGGGGCUGGGGCUGGUCCUGGCUUACCGGCUCUCGGUGGAAAUCUAUGACCGCCGGGAAUACAGUCGCUUUGAGAAGGAGCAGCAACAACUCAACUGGAAGCAGGACAGUAAUCCUCUCUACAAAAGUGCCAUCACGACCACCAUCAAUCCUCGCUUUCAAGAGGCAGACAGUCCCACUCUCUGAAGGAGGGAGGGACACUUACCCAAGGCUCUUCUCCUUGGAGGACAGUGGGAACUGGAGGGUGAGAGGAAGGGUGGGUCUGUAAGACCUUGGUAGGGGACUAAUUCACUGGCGAGGUGCGGCCACCACCCUACUUCAUUUUCAGAGUGACACCCAAGAGGGCUGCUUCCCAUGCCUGCAACCUUGCAUCCAUCUGGGCUACCCCACCCAAGUAUACAAUAAAGUCUUACCUCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1105.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1147.82

Frequency: 0.0000

Diversity: 516.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((((((..((((((.....(((......)))....)))))).))))))....(((((((((.(..((((..(((((((...((.(((.(((((((((((.....(((.((.....(((((((((((((((.(((((((((((((((((.(..((((((.((((.(((((..((((..(.(((((((((...(((((((..(((...(..((((((((.((.(((..(((.((.(((((((..(((((((.(((.((.(((((((((((((((.((((.((((((.....))).)).).)))).)).)))))))).(((..((((......))))..)))......(((((((.......))))))).((((((((((((.((.(((..((((((((..(((((....((((....)))))))))..((((((((((((((((.....)))))).....)))))))))).....(((((((((..........)))))).)))..)))))))).)))))))))))))).)))...))))).)).))).))).))))(((........)))(((.((((..((........))..)))).)))....(((((((..(((...)))..))))))).......))))))).)))))..))))).))).)))))..))))..).)))))).))))).......(((((.((((((....))))))))))).((((((.....)))))))))).)..)))).(.((((((....)))))).)(((((.(((((((......)))).))).)))))))))))))).))))))..).))))))))......((.(((((((((.((((((((.........)).)))..)))..)))))))))))((((.(((.(((((((......((((((....)))))).))))....(((((((....(((...((((..(((.(((((((((.((.(((.((..(((........)))(((((((.((((((((((((....)))).((((.((((((.......))))))..))))........(((((((((..((...((((((...(.((((((...((((((((((((.(...........).)))))))...)))))......)))))))))))))..))..))))))..)))...(((((((....(((((((((.(((((.((...)).)))))((((((((..(((((((((...(((((..(((......)))...)))))...)))....))))))...))))))))))))).)))))))))))..(((((((.(((((....))))).))))..)))....)))))))))))))))....(((((((((((((........)))))..(((....))))))))))))).))).)))))))))))..))).)))))))...)))))))..((((((.......)))))).))).))))))).......))))))))).))(((((....((.(((((.......)).))).))...))))).))))))))((((...((((((.((((....)).))))))))))))))))))).)))...))))))))))).))))).))))).))(((((..(((((.(((((.......)))))...)))))..))))).((((....)))).((((((.(..(((..(.((((.((((((((..(.....((((((((((........))))))).........(((((((.....))).))))...(((((((.(((.((((.((........)).)))))))))))))).)))...)..))))))))(((((.((((((((....((((((((((((.(.((((.(((.((((....((...(((.(((........(((.(((((((.((..((.(((((..(((.((((((((((....((........)).....))))))))))..)))....))))).))..)).))))).)))))((((.((((..........(((........)))))))))))..((((((.(((......))).)))))).))).)))...))))))))))))))))))))))))))(((....)))(((((((((..........))))))))).....(((((((((((((((((........(((...(((....)))...)))..(((((((.......(((....)))...........(((((((((((...)))))...((((((((((((((.(((((((.((((.(.(((....)))))))))))))))))))...)))))).)))))))))))))))))((((((((.((((...((((((.(((.(((....))).))).)))))))))).).))))))).)))).))))))))))))).(((....))).....)))))))))))))....)))).)..)))..)...)))))).........))))..).)))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,((((((.{{(((((...|}||,..,,,}))))...}}||||.}}}}}}}}},(((((((((.(..((((..{((((((...((.(((.(((((((((((.{...{((,((,...,{({{((({(((((((.(((((((((((((((((.(..((((((.(((,,(((((..((((..(.(((((((((...(((((((..(((...(..((((((((.((,(((.,{((,((.(((((((.{{,{{,{{{.....}.)),))((((((((((.((((.((((((.....))).)).).)))).)).))))))))((((((((((..(((((((((((((.....))))){{...,,((((.(((((.,,.(((((((({,((.(((..((((((((..(((((....((((....)))))))))..((((((((((((((((,...,)))))).....)))))))))).....(((((((((..........))))))}}))..)))))))).)))))))))))))).}))))).)))))))))))).(({{((((.{(.{{{{..{{.(((.((((..((........))..)))).))),},.)))))},,}|,.,}},))).)))))}}})))...}}))))).))))),|)})}),))),)))))..})))..).)))))).))))).......(((((.((((((....))))))))))).((((((.....)))))))))).)..)))).{.((((((....)))))).,(((((.(((((((......))))}})).)))))))))))))).))))))..).)))))))).......,{(((((((((.((((((({......,..})})},..)))..)))))))))))((({{(((.(((((((......((((((....)))))).))))....(((((((..{,{((...((((..(((.(((((((({{((.(((.({..(((........)))((((((,,((((((((({((,..,||||,({((,((((((...,,,,}}}}}},,}))).......{(((((((((..((...((((((...(.((((((...((((((((((((.,...........).)))))))...)))))......)))))))))))))..)).,)}))}}.,))),},|{||{||,,,,|{{{(((({.(((((.{{...}}.)))))((((((((..(((((((((...(((((..,(({.....,)),..)))))...)))....))))))...)))))))))}))),)))))))})))..(((((((.(((((....))))).)))}.,)))....)))))))))))))))....(((((((((((((........)))))..(((....))))))))))))}.))).)))))))))))..))).)))))))}..)))))))..((((((.......)))))).))).))))))).......))))))))).}}||{{|}},.||,||{{|,,,,...})}}}|{||{{.}}}))})))}}))}((((...((((((.{({(....}),})))))))))))))))))}.)})...))))))))))).))))).))))),}}(((((..(((((.(((((.,...,.)))))...)))))..))))).((((....)))).((((((.{.{(((,.,,((((.((((((((..(..((..((((((((((((((((.(((,,,....||,.{{(((((((,...,))).)))).....,||||}..,..))).)),,)))))..)))))}}))..)).,.,......)..))))))))||||{.({(((((({{,{((((((((((((.{.((((.((,,((((..,{(.,..,(({(((........(((.(((((((.((,,((.(((((..(((.{(((((((((,,..((,{,,,...||,,...})))))))))},)}|,|..}}})).))..}}.))))).)))))((((.(((({....,..,..{||.......)))})))))))..((((((.(((......))).)))))).)))})))}.})))))))))))))})))))))))))){{{....}))(((((((((..........))))))))).....(((((((((((((((((........{((...(((....)))...)))..(((((((.......(((....))),..........(((((((((((...)))))...((((((((((((((.((((((((((((.(.(((....))))))))))))))))))),..)))))),,))))))))))))))))((((((({.((((...((((((.(((.(({....})).))).)))))))))).}.))))))).)))).))))))))))))).{{{...,))),.....)))))))))))}....)))).},.}}}},}...)))))).........))))..).)))))))))...