Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001414172.1

Sequence Length

2196 nt

GC Content

0.5929

AUUACAGGGCAUGGUGGCUUUGCCAAUGGUCCUUGUUUUGCUGCUGGUCCUGAGCAGAGGUGAGAGUGAAUUGGACGCCAAGAUCCCAUCCACAGGGGAUGCCACAGAAUGGCGGAAUCCUCACCUGUCCAUGCUGGGGUCCUGCCAGCCAGCCCCCUCCUGCCAGAAGUGCAUCCUCUCACACCCCAGCUGUGCAUGGUGCAAGCAACUGAACUUCACCGCGUCGGGAGAGGCGGAGGCGCGGCGCUGCGCCCGACGAGAGGAGCUGCUGGCUCGAGGCUGCCCGCUGGAGGAGCUGGAGGAGCCCCGCGGCCAGCAGGAGGUGCUGCAGGACCAGCCGCUCAGCCAGGGCGCCCGCGGAGAGGGUGCCACCCAGCUGGCGCCGCAGCGGGUCCGGGUCACGCUGCGGCCUGGGGAGCCCCAGCAGCUCCAGGUCCGCUUCCUUCGUGCUGAGGGAUACCCGGUGGACCUGUACUACCUUAUGGACCUGAGCUACUCCAUGAAGGACGACCUGGAACGCGUGCGCCAGCUCGGGCACGCUCUGCUGGUCCGGCUGCAGGAAGUCACCCAUUCUGUGCGCAUUGGUUUUGGUUCCUUUGUGGACAAAACGGUGCUGCCCUUUGUGAGCACAGUACCCUCCAAACUGCGCCACCCCUGCCCCACCCGGCUGGAGCGCUGCCAGUCACCAUUCAGCUUUCACCAUGUGCUGUCCCUGACGGGGGACGCACAAGCCUUCGAGCGGGAGGUGGGGCGCCAGAGUGUGUCCGGCAAUCUGGACUCGCCUGAAGGUGGCUUCGAUGCCAUUCUGCAGGCUGCACUCUGCCAGGAGCAGAUUGGCUGGAGAAAUGUGUCCCGGCUGCUGGUGUUCACUUCAGACGACACAUUCCAUACAGCUGGGGACGGGAAGUUGGGCGGCAUUUUCAUGCCCAGUGAUGGGCACUGCCACUUGGACAGCAAUGGCCUCUACAGUCGCAGCACAGAGUUUGACUACCCUUCUGUGGGUCAGGUAGCCCAGGCCCUCUCUGCAGCAAAUAUCCAGCCCAUCUUUGCUGUCACCAGUGCCGCACUGCCUGUCUACCAGGAGCUGAGUAAACUGAUUCCUAAGUCUGCAGUUGGGGAGCUGAGUGAGGACUCCAGCAACGUGGUACAGCUCAUCAUGGAUGCUUAUAAUAGCCUGUCUUCCACCGUGACCCUUGAACACUCUUCACUCCCUCCUGGGGUCCACAUUUCUUACGAAUCCCAGUGUGAGGGUCCUGAGAAGAGGGAGGGUAAGGCUGAGGAUCGAGGACAGUGCAACCACGUCCGAAUCAACCAGACGGUGACUUUCUGGGUUUCUCUCCAAGCCACCCACUGCCUCCCAGAGCCCCAUCUCCUGAGGCUCCGGGCCCUUGGCUUCUCAGAGGAGCUGAUUGUGGAGUUGCACACGCUGUGUGACUGUAAUUGCAGUGACACCCAGCCCCAGGCUCCCCACUGCAGUGAUGGCCAGGGACACCUACAAUGUGGUGUAUGCAGGGACUGUGCAGAGUGUGGGGCCUUCAGGACUGGCCCACUGGCCACCAACUGCAGUACAGCUUGUGCCCAUACCAAUGUGACCCUGGCCUUGGCCCCUAUCUUGGAUGAUGGCUGGUGCAAAGAGCGGACCCUGGACAACCAGCUGUUCUUCUUCUUGGUGGAGGAUGACGCCAGAGGCACGGUCGUGCUCAGAGUGAGACCCCAAGAAAAGGGAGCAGACCACACGCAGGCCAUUGUGCUGGGCUGCGUAGGGGGCAUCGUGGCAGUGGGGCUGGGGCUGGUCCUGGCUUACCGGCUCUCGGUGGAAAUCUAUGACCGCCGGGAAUACAGUCGCUUUGAGAAGGAGCAGCAACAACUCAACUGGAAGCAGGACAGUAAUCCUCUCUACAAAAGUGCCAUCACGACCACCAUCAAUCCUCGCUUUCAAGAGGCAGACAGUCCCACUCUCUGAAGGAGGGAGGGACACUUACCCAAGGCUCUUCUCCUUGGAGGACAGUGGGAACUGGAGGGUGAGAGGAAGGGUGGGUCUGUAAGACCUUGGUAGGGGACUAAUUCACUGGCGAGGUGCGGCCACCACCCUACUUCAUUUUCAGAGUGACACCCAAGAGGGCUGCUUCCCAUGCCUGCAACCUUGCAUCCAUCUGGGCUACCCCACCCAAGUAUACAAUAAAGUCUUACCUCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-944.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -978.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 459.68

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((((((..((((((.....(((......)))....)))))).))))))....(((((((((.(....((((((.....(((((........)))))((((.....))))((........))))))))((((((((((((..((..((((((((..((((.(((......(((((((........(((.((((...)))))))............((((.((....)).)))).((((((....))))))....))))))).(((((((((((.((((.((((((.....))).)).).)))).)).)))))))))....(((.((.(((((((((((((.....)))))((...))((((.(((((....(((((((((.((.(((..((((((((..(((((....((((....)))))))))..((((((((((((((((.....)))))).....)))))))))).....(((((((((..........)))))).)))..)))))))).))))))))))))))..))))).)))))))))))).)).)))((.(((((...(((((((((((((((((((((..(((.....)))))))))((((((((((.......(((((...(((.((((.((((.((......((((((((.((((((.......))))))....(((.((((......(((((.((((((....))))))))))).......)))).)))))))))))(.((((((((((((((....))))))..(((((.(((((((......)))).))).))))).)))))))).).)).)))).))))..)).)...)))))((((((((.((((((((.........)).)))..)))..))))))))(((.....)))))))))))))....((((((....))))))..((((.(((.....))))))).....)))).)).))))))))).))))).))((((((((((.(((((((....(((.((....((((((((.............))))))))....)).)))...))))))))))).))))))..((((......)))).....)))))))..)))).))))..))))))))))))))..((((...((((((..((((((((.........(((((((((..((...((((((...(.((((((...((((((((((((.(...........).)))))))...)))))......)))))))))))))..))..))))))..)))...(((((((....(((((((((.(((((.((...)).)))))((((((((..(((((((((...(((((..(((......)))...)))))...)))....))))))...))))))))))))).))))))))))).....((((.(((((....))))).))))((((((((((...(((((((((..((((((((((((.(((........((((((..(((.((.((((((.((((.(((((((....((......))...)))).)))))).).)))))).)).)))..))))))..))).))))))))...((((((.((((((......((....)).((((((((...((((....))))))))))))(((((.((((........)))))))))...((((.((((...)))).))))))))))..)))).))...((..((((((.(((......))).))))))..))...))))..)))))))))))))))))))..((((....)))).(((((((((..........))))))))).....(((((((((((((((((........(((...(((....)))...)))..(((((((.......(((....)))...........(((((((((((...)))))...((((((((((((((.(((((((.((((.(.(((....)))))))))))))))))))...)))))).)))))))))))))))))((((((((.((((...((((((.(((.(((....))).))).)))))))))).).))))))).)))).))))))))))))).......((((.(((...........))).)))))))))))).))))))...))))...............).)))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,((((((.{{(((((...||||,..},}}}))}...}}||||.},}}}},}},(((((((((,(,.{{{(({{,,....{((((.......,|||}}((({.....}))){{..,,,...,|||||||((((((((((((..((..((((((((..((({,(((...{{.(((((((......,,(((,(({,.,,})}}}}}..,|{....,|,((((.((....)).)))).((((({....})))))....)))))))}|((((((((((.((((.((((((.....))).)).).)))).)).))))))))|,,,.(((.((.(((((((((((((.....))))){{...,,((((.(((((.,,.(((((((({,((.(((..((((((((..(((((....((((....)))))))))..((((((((((((((((,...,)))))).....)))))))))).....(((((((((..........))))))}}))..)))))))).)))))))))))))).}))))).)))))))))))).)).)))((.(((((...(((((((((((((((((((((..(((.....))))))))){(((((((((,,,.,..(((((...{((.((((.((((.((......(((((((({{((({({{.{{{,},}|}}....,,|.||{,......(((((.((((((....))))))))))).},.,,,,))).)).))))))))|.((((((((((((((....))))))..(((((.(((((((......))))}})).))))).)))))))),,.)).)))).))))..)).}...)))))((((((((.(((((({,......}..)),)},..)))..))))))))|{|,.,..}},)))))))))}....((((((....))))))..((((.(((.....))))))).....)))).)).))))))))).))))).))((((((((((.(((((((....(((.((....((((((((.,,.......,,.))))))))....)).)))...)))))))))))},)))))..,{{,...}}.}}}},,...)))))))..)))).))))..))))))))))))))..((((...{(((({..((((((((........|(({((((((.,((...((((((...{.((((((...((((((((((((,,...........}.)))))))...)))))......)))))))))))))..))..)}))}}..}}}.,.(((((((....(((((((((.(((((.({...)}.)))))((((((((..(((((((((...(((((..,(({.....,)),..)))))...)))....))))))...))))))))))))).))))))))))).....((((.(((((....))))).))))((((((((((...(((((((((..((((((((((((.(((........((((((..(((.((.((((((.{(((.(((((((....((.....,)}...)))).)))))).}.)))))),)).)))..))))))..))).)))))))).,.((((((.((((((...,{{(({{{({{.{(((((((...((((....)))))))))))}(((({,((((........)))))))))},,((((.{(((...}))).))))))))))..)))).}).,.((..((((((.(((......))).)))))).,)),.}))))..))))))))))))))))))).,({((....)))).(((((((((..........))))))))).....(((((((((((((((((........{({...(((....)))...)))..(((((((.......(((....})),........,.(((((((((((...)))))...((((((((((((((.((((((((((((.(.(({....})))))))))))))))))),..)))))),}))))))))))))))))((((((({.((((...((((((.(((.(({....})).))).)))))))))).}.))))))).)))).))))))))))))).,,,...,|||.{({.......,...})}.}}}})))))))).)))))}...)))).........,,,,..}.)))))))))...