Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001414304.1
Sequence Length
2215 nt
GC Content
0.6185
ACUCCCACUUCCUGAGCUCCGCCAUGGGAGCCCUGGAGGCCCGGCCUGGCCGCUCCCGGCCCUGGGGUGCACAUCGGCCCUGAGUCCCGUCCCAGGCUCUGGGCUCGGGCAGCCGCCGCCACCGCUGCCCAGGACGUCGGGCCUCCUGCCUUCCUCCCAGGCCCCCACGUUGCUGGCCGCCUGGCCGAGUGGCCGCCAUGCUCCUGCCUUGGGCCACCUCUGCCCCCGGCCUGGCCUGGGGGCCUCUGGUGCUGGGCCUCUUCGGGCUCCUGGCAGCAUCGCAGCCCCAGGCGGUGCCUCCAUAUGCGUCGGAGAACCAGACCUGCAGGGACCAGGAAAAGGAAUACUAUGAGCCCCAGCACCGCAUCUGCUGCUCCCGCUGCCCGCCAGGUGAGAGGCAAUGGCAGGACGAACCUGGGCCUCGGAAGUGGGUCACGGGGGCUCCAGCCCCCUCGCGGCCUCAGAGGGAAGGCACCUAUGUCUCAGCUAAAUGUAGCCGCAUCCGGGACACAGUUUGUGCCACAUGUGCCGAGAAUUCCUACAACGAGCACUGGAACUACCUGACCAUCUGCCAGCUGUGCCGCCCCUGUGACCCAGUGAUGGGCCUCGAGGAGAUUGCCCCCUGCACAAGCAAACGGAAGACCCAGUGCCGCUGCCAGCCGGGAAUGUUCUGUGCUGCCUGGGCCCUCGAGUGUACACACUGCGAGCUACUUUCUGACUGCCCGCCUGGCACUGAAGCCGAGCUCAAAGAUGAAGUUGGGAAGGGUAACAACCACUGCGUCCCCUGCAAGGCCGGGCACUUCCAGAAUACCUCCUCCCCCAGCGCCCGCUGCCAGCCCCACACCAGGUGUGAGAACCAAGGUCUGGUGGAGGCAGCUCCAGGCACUGCCCAGUCCGACACAACCUGCAAAAAUCCAUUAGAGCCACUGCCCCCAGAGAUGUCAGGAACCAUGCUGAUGCUGGCCGUUCUGCUGCCACUGGCCUUCUUUCUGCUCCUUGCCACCGUCUUCUCCUGCAUCUGGAAGAGCCACCCUUCUCUCUGCAGGAAACUGGGAUCGCUGCUCAAGAGGCGUCCGCAGGGAGAGGGACCCAAUCCUGUAGCUGGAAGCUGGGAGCCUCCGAAGGCCCAUCCAUACUUCCCUGACUUGGUACAGCCACUGCUACCCAUUUCUGGAGAUGUUUCCCCAGUAUCCACUGGGCUCCCCGCAGCCCCAGUUUUGGAGGCAGGGGUGCCGCAACAGCAGAGUCCUCUGGACCUGACCAGGGAGCCGCAGUUGGAACCCGGGGAGCAGAGCCAGGUGGCCCACGGUACCAAUGGCAUUCAUGUCACCGGCGGGUCUAUGACUAUCACUGGCAACAUCUACAUCUACAAUGGACCAGUACUGGGGGGACCACCGGGUCCUGGAGACCUCCCAGCUACCCCCGAACCUCCAUACCCCAUUCCCGAAGAGGGGGACCCUGGCCCUCCCGGGCUCUCUACACCCCACCAGGAAGAUGGCAAGGCUUGGCACCUAGCGGAGACAGAGCACUGUGGUGCCACACCCUCUAACAGGGGCCCAAGGAACCAAUUUAUCACCCAUGACUGACUGAGUCUGAGAAAAGGCAGAAGAAGGGGGGCACAAGGGCACCUUCUCCCUUGAGGCUGCCCUGCCCACGUGGGAUUCACAGGGGCCUGAGUAGGGCCCGGGGAAGCAGAGCCCUAAGGGAUUAAGGCUCAGACACCUCUGAGAGCAGGUGGGCACUGGCUGGGUACGGUGCCCUCCACAGGACUCUCCCUACUGCCUGAGCAAACCUGAGGCCUCCCGGCAGACCCACCCACCCCCUGGGGCUGCUCAGCCUCAGGCACGGACAGGGCACAUGAUACCAACUGCUGCCCACUACGGCACGCCGCACCGGAGCACGGCACCGAGGGAGCCGCCACACGGUCACCUGCAAGGACGUCACGGGCCCCUCUAAAGGAUUCGUGGUGCUCAUCCCCAAGCUUCAGAGACCCUUUGGGGUUCCACACUUCACGUGGACUGAGGUAGACCCUGCAUGAAGAUGAAAUUAUAGGGAGGACGCUCCUUCCCUCCCCUCCUAGAGGAGAGGAAAGGGAGUCAUUAACAACUAGGGGGUUGGGUAGGAUUCCUAGGUAUGGGGAAGAGUUUUGGAAGGGGAGGAAAAUGGCAAGUGUAUUUAUAUUGUAACCACAUGCAAAUAAAAAGAAUGGGACCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-917.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -959.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 564.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((((.((((((.((((..(((((((.(((((((((((((((..((((((((((((((((.(((....(((((.(((((........))))).))))).(((((((.(......).)))))))..(((((.((((((..............))))))..)))))...((((....))))((((((((.....((....))....))))).))))))))))))...)))).))))))..)))).)))))))))))..))))))))))).(((((((........)))))))((((.........))))..((.(.((((((((((((((....((.....))......((((((....(((((...((((..(((....((((((((...(((...(((((.((....(.(((((.((..(.((((((((((((((.(((((.(((((.........)))))..(((((((.((((((.((((....)))).......)))))).))...)))))....((((((.............)).))))(((..........))).......)))).)..)))))))))))))).)..))))))).)((((.(((.((..(((((...(((...((....))...)))...)).)))..)).))).)))))).)))))...)))((((((((....)))).))))................)))))))).....))).))))....)))))..))))))...(((....))).))).)).)))))).)))).))....((((...(((((((((..((((((.(((((((((..(((((.(((.(((......)))..))).))).)).))))))....((((((((((((((.......((((((...(((((.((((.((..((((((((..((.((((((........))))))))..((.((((.(((((..(((..((((((..((((((.(((.(((((((((((((((...(((((.......)))))...)))))))...(((((.((((........))))))).))(((((.(((.............(..((.(((((((((.(((((..(((((........((((..((..(((...(((....)))..)))..)).))))..(((((((((((....((((((((((((...((((((....))).)))..((((....((((.((.(..(((.((((......)))))))..))).))))..)))))))))))...(((((..(((((.((((....(((.....)))...))))..)))))...........)))))..........((((...))))))))))))))))))))....))))).)))))..))))))))).))..)............))).))))).....((((......(((((....))))).......)))).....))))))))...))).(((((((..((((.(......).)))))))))))...........))))))..)))))))))..........((.((((.....))))))......))))).)))).))(((((...(((((.((((......)))).))))))))))..(((.....)))..((((((.....))))))))))..)))).)).)))).)))))....((((((....)))))).)))))).......))))))))..)))))).(((...)))..(((((((((((((.((....((((((((.....(((((.((((.........)))).)))))..))))))))...(((..((((((((((..((....((((((......)))).))....(((.....)))....(((((.(((.....(((..(........)..)))....))))))))....))..)))).)))))).)))....(((((((((...)))))))))(((((.......))))))).))))))......(((....)))......)))))))(((.(.((((.((((.((((...)))).)))).))))).)))...........))).)))))).))))......)))))..)))))))))).))))))))))......(((..((...(((((.(((((......))))))))))....))..).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((.(((....{({{{(((,.,(((((((.(((((((((((((((,,({{{{|||||{{((((.(((....(((((.(((((,.,.,,,,|}}}),))))}.(((((((.(......}.))))))),||||{|,|||||,,,|||,,,}},,{{|||{||{{|,||,.,,(((({...|||,((((((((.,.,.((....))...})))))},)),)))}}))),,.)))},)))))),,}})).)))))))))))..)))))))|||}.(((((((........))))))){{||,...,.,,,))))..((.{.((((((((((((((....,{.....}}......((((((....(((((...((((..(((....((((((((...((({..((((({,(,,.{({(((((.((..(.((((((((((((((.,((((.(((((,.,....,.)))))..(((({,,.{||||{.({{,..|||}}}.}}....)))}||,||...}}}}}....((((((.,.....,,....)).))))||{........,.,,....,,,,)))).)..)))))))))))))).)..})))))},,|||...||}||,}||||.,..{{{..{((,,,.||{,{}||...,},,|||{||||.,.)))))}}))))),}})},((((((((....)))).)))).....,,,,,..}))))))))))).....))).))))....)))))..))))))...({{....})).))).)))))))))}}))),)){((((((((.......((((((((.,,,....((((((..(((((.(((.(((......)))..))).))).)).))))))....((((((((((((((.{...{.((((((...(((((.((((.((..((((((((..,,.,(((((........)))))}}|(((.((...)).))),....((((((((((((((((((((,..,((((((((((((...(((((.,.....)))))...))))))}..{(((((.((((........))))))).))|(({(,(((......,{{.......||,(((((((((.(((({..(((((........,(((,.((..((({{{((,..}}),)},)})..)).))})..(((((((((((,...((((((((((((...((((((....))).)))..((((..,.((((.((.(.,(((.((((......))))))).,))).))))}.)))))))))))...(((((,,(((((.((((..,.,(({,...}})}}.))))..))))).........,.)))))....,.....{,,....)))}))))))))))))))))....))))).)))))..))))))))).||..,............}}}.}}}},...,.|||||.....(((((....))))},......)))}..,.})))))))))))))..(((((((.,({({.,......).)))})))))))..((((.....})))},,...}}...............({.((((.....)))))).,....)))))))))))),((((,..{(((((.((((......)))).)))))))))).,(((,...,)))..((((((.....))))))))))..)))).)).)))).)))))....((((((....)))))).)))))).,...,.)))))))}.,)))))).{{(,.,{(((((((((((.((((({,{....{(({,,(({....|||,,.(((({{{{{{{{{{{||{||,,,.})))}}}|}...(({..((((((((((..((...,{{((((.....,)))}.||{|..{{{..,,.}))}...(((((.(((.....(({,{(.,......)},)))...,))))))))....))..)))),}))))).}}},,..(((((((.{{{{{,,,,))))|((((.......))))}))))))).,.{{{{{{{(....}}}......)))))||{{,.{{((((.((((.((((...)))).)))).,)))),))}........,,,)))))})))))})).,},})))))))))))},)))))))))).))))))))...))).)))))}.{((((.(((((......)))))))))}..))))))))....
Back