Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001414306.1

Sequence Length

2176 nt

GC Content

0.6149

ACUCCCACUUCCUGAGCUCCGCCAUGGGAGCCCUGGAGGCCCGGCCUGGCCGCUCCCGGCCCUGGGGUGCACAUCGGCCCUGAGUCCCGUCCCAGGCUCUGGGCUCGGGCAGCCGCCGCCACCGCUGCCCAGGACGUCGGGCCUCCUGCCUUCCUCCCAGGCCCCCACGUUGCUGGCCGCCUGGCCGAGUGGCCGCCAUGCUCCUGCCUUGGGCCACCUCUGCCCCCGGCCUGGCCUGGGGGCCUCUGGUGCUGGGCCUCUUCGGGCUCCUGGCAGCAUCGCAGCCCCAGGCGGUGCCUCCAUAUGCGUCGGAGAACCAGACCUGCAGGGACCAGGAAAAGGAAUACUAUGAGCCCCAGCACCGCAUCUGCUGCUCCCGCUGCCCGCCAGGCACCUAUGUCUCAGCUAAAUGUAGCCGCAUCCGGGACACAGUUUGUGCCACAUGUGCCGAGAAUUCCUACAACGAGCACUGGAACUACCUGACCAUCUGCCAGCUGUGCCGCCCCUGUGACCCAGUGAUGGGCCUCGAGGAGAUUGCCCCCUGCACAAGCAAACGGAAGACCCAGUGCCGCUGCCAGCCGGGAAUGUUCUGUGCUGCCUGGGCCCUCGAGUGUACACACUGCGAGCUACUUUCUGACUGCCCGCCUGGCACUGAAGCCGAGCUCAAAGAGGCUCACAGAAGGGUUCUGGAGGGACAUGGAACUGGGACAGAUGAAGUUGGGAAGGGUAACAACCACUGCGUCCCCUGCAAGGCCGGGCACUUCCAGAAUACCUCCUCCCCCAGCGCCCGCUGCCAGCCCCACACCAGGUGUGAGAACCAAGGUCUGGUGGAGGCAGCUCCAGGCACUGCCCAGUCCGACACAACCUGCAAAAAUCCAUUAGAGCCACUGCCCCCAGAGAUGUCAGGAACCAUGCUGAUGCUGGCCGUUCUGCUGCCACUGGCCUUCUUUCUGCUCCUUGCCACCGUCUUCUCCUGCAUCUGGAAGAGCCACCCUUCUCUCUGCAGGAAACUGGGAUCGCUGCUCAAGAGGCGUCCGCAGGGAGAGGGACCCAAUCCUGUAGCUGGAAGCUGGGAGCCUCCGAAGGCCCAUCCAUACUUCCCUGACUUGGUACAGCCACUGCUACCCAUUUCUGGAGAUGUUUCCCCAGUAUCCACUGGGCUCCCCGCAGCCCCAGUUUUGGAGGCAGGGGUGCCGCAACAGCAGAGUCCUCUGGACCUGACCAGGGAGCCGCAGUUGGAACCCGGGGAGCAGAGCCAGGUGGCCCACGGUACCAAUGGCAUUCAUGUCACCGGCGGGUCUAUGACUAUCACUGGCAACAUCUACAUCUACAAUGGACCAGUACUGGGGGGACCACCGGGUCCUGGAGACCUCCCAGCUACCCCCGAACCUCCAUACCCCAUUCCCGAAGAGGGGGACCCUGGCCCUCCCGGGCUCUCUACACCCCACCAGGAAGAUGGCAAGGCUUGGCACCUAGCGGAGACAGAGCACUGUGGUGCCACACCCUCUAACAGGGGCCCAAGGAACCAAUUUAUCACCCAUGACUGACUGAGUCUGAGAAAAGGCAGAAGAAGGGGGGCACAAGGGCACCUUCUCCCUUGAGGCUGCCCUGCCCACGUGGGAUUCACAGGGGCCUGAGUAGGGCCCGGGGAAGCAGAGCCCUAAGGGAUUAAGGCUCAGACACCUCUGAGAGCAGGUGGGCACUGGCUGGGUACGGUGCCCUCCACAGGACUCUCCCUACUGCCUGAGCAAACCUGAGGCCUCCCGGCAGACCCACCCACCCCCUGGGGCUGCUCAGCCUCAGGCACGGACAGGGCACAUGAUACCAACUGCUGCCCACUACGGCACGCCGCACCGGAGCACGGCACCGAGGGAGCCGCCACACGGUCACCUGCAAGGACGUCACGGGCCCCUCUAAAGGAUUCGUGGUGCUCAUCCCCAAGCUUCAGAGACCCUUUGGGGUUCCACACUUCACGUGGACUGAGGUAGACCCUGCAUGAAGAUGAAAUUAUAGGGAGGACGCUCCUUCCCUCCCCUCCUAGAGGAGAGGAAAGGGAGUCAUUAACAACUAGGGGGUUGGGUAGGAUUCCUAGGUAUGGGGAAGAGUUUUGGAAGGGGAGGAAAAUGGCAAGUGUAUUUAUAUUGUAACCACAUGCAAAUAAAAAGAAUGGGACCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-892.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -931.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 434.61

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((.(((....(((((......)))))...(((((((((((..(((((....)))))..(((((........)))))((((((.(((...)))...))))))(((((((.(......).))))))).....)))))))))))(((((((((((((((((((((.(((...(((((...(((.((((((((.....((....))....))))).))).)))..))))).))).)))))))))..(((((((((.((((((....((((((..(((((((........))))))).(((...((((((((....)).)))..))).)))))))))....)))......))).)))))))))((....)).((....))(((((((((((((....)))))..((((....)))).(((...(((((.(((((((((((.((.((((((.............)).))))))...((.((((((((((((...(((((((.((((((.(((((((....))))..)))))).)...)).....)))).)))..........((((((.(((.((((..((((((.(.(((((((..((((((((.((((((((....)))).)))).............))))((.((((......)))).))......)))).))))))).).))))))..)).))))).)))))).))))))..)))))).))))).))))..)))).))))).)))..)).))))))((((((((((...((((..((((((.(((((((((..(((((.(((.(((......)))..))).))).)).))))))....((((((((((((((.......((((((...(((((.((((.((..((((((((..((.((((((........))))))))..((.((((.(((((..(((..((((((..((((((.(((.(((((((((((((((...(((((.......)))))...)))))))...(((((.((((........))))))).))(((((.(((.............(..((.(((((((((.(((((..(((((........((((..((..(((...(((....)))..)))..)).))))..(((((((((((....((((((((((((...((((((....))).)))..((((....((((.((.(..(((.((((......)))))))..))).))))..)))))))))))...(((((..(((((.((((....(((.....)))...))))..)))))...........)))))..........((((...))))))))))))))))))))....))))).)))))..))))))))).))..)............))).))))).....((((......(((((....))))).......)))).....))))))))...))).(((((((..((((.(......).)))))))))))...........))))))..)))))))))..........((.((((.....))))))......))))).)))).))(((((...(((((.((((......)))).))))))))))..(((.....)))..((((((.....))))))))))..)))).)).)))).)))))....((((((....)))))).)))))).......))))))))..)))))).(((...)))..(((((((((((((.((....((((((((.....(((((.((((.........)))).)))))..))))))))...(((..((((((((((..((....((((((......)))).))....(((.....)))....(((((.(((.....(((..(........)..)))....))))))))....))..)))).)))))).)))....(((((((((...)))))))))(((((.......))))))).))))))......(((....)))......)))))))(((.(.((((.((((.((((...)))).)))).))))).)))...........))).)))))).))))((((((....))))))...))))))))))))))))))...))))......(((((.(((((......))))))))))..))))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((.(((..{.(((((......))))).,.(((((((((((..(((((....))))},,{(({{{,....,{|||||({((({.{.{,,,|}},),))))}}(((((((.|......}.))))))),)}..)))))))))))(((((((((((((((((((((.(,,{{,(((((...(((.((((((((.,.,.((....))...})))))},)).)))..))))).))).)))))))))..(((((((((.((((((....((((((..(((((((........))))))).(((...{({((({(....)).)))..))},))}))))))....))}......))).)))))))))((....}}.{{....}}(((((((((((((....}))))..((((....)))).(((...(((((.(((((((((((.({.((((((.,...........)).))))}}...((.(((((((((((((({(((((({,,(((({{.(((((,.{,.{|||{{((.,,({{..,{{,,,.{||,,..))}...||....{{(((({(((.,({(,{((((((.,.|||||{|}}|{{{((((.((((((((....)))).)))).............))))||.||||}},}..)})),})}}...}))))})))),,,})}))}})).,)).))))).,))))}.))))))..)))))).))))),,)))..)))).))))).)))..))}})))))((((((((((...((((,.((((((.(((((((((..(((((.(((.(((......)))..))).))).)).))))))....((((((((((((((.{...{.((((((...(((((.((((.((..((((((((..,,.,(((((........)))))}}|(((.((...)).))),....((((((((((((((((((((,..,((((((((((((...(((((.,.....)))))...))))))}..{(((((.((((........))))))).))|(({(,(((......,{{.......||,(((((((((.(((({..(((((........,(((,.((..((({{{((,..}}),)},)})..)).))})..(((((((((((,...((((((((((((...((((((....))).)))..((((..,.((((.((.(.,(((.((((......))))))).,))).))))}.)))))))))))...(((((,,(((((.((((..,.,(({,...}})}}.))))..))))).........,.)))))....,.....{,,....)))}))))))))))))))))....))))).)))))..))))))))).||..,............}}}.}}}},...,.|||||.....(((((....))))},......)))}..,.})))))))))))))..(((((((.,({({.,......).)))})))))))..((((.....})))},,...}}...............({.((((.....)))))).,....)))))))))))),((((,..{(((((.((((......)))).)))))))))).,(((,...,)))..((((((.....))))))))))..)))).)).)))).)))))....((((((....)))))).)))))).}...,.)))))))}.,)))))).{((...))).,(((((((((((((.((....((((((((.,...(((((.((({.........)))).))))).,))))))))...(({..((((((((((..((...,{{((((.....,)))}.||||..{{|..|,.}))|...(((((.(((.....(({,{(.,......)},)))...,))))))))....))..)))),}))))).}}},..,((((((({{...))))))))){((((.......))))})).))))))....,.{((....}})......)))))))|{,,((((((.((((.((((...)))).)))).,)))),))}...........))).)))))).}))}{{{{{{....}))))).,.))))))))))))))))))...))))......{((((.(((((......)))))))))}..))))))))....