Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001414311.1
Sequence Length
1879 nt
GC Content
0.6142
ACUCCCACUUCCUGAGCUCCGCCAUGGGAGCCCUGGAGGCCCGGCCUGGCCGCUCCCGGCCCUGGGGUGCACAUCGGCCCUGAGUCCCGUCCCAGGCUCUGGGCUCGGGCAGCCGCCGCCACCGCUGCCCAGGACGUCGGGCCUCCUGCCUUCCUCCCAGGCCCCCACGUUGCUGGCCGCCUGGCCGAGUGGCCGCCAUGCUCCUGCCUUGGGCCACCUCUGCCCCCGGCCUGGCCUGGGGGCCUCUGGUGCUGGGCCUCUUCGGGCUCCUGGCAGCAUCGCAGCCCCAGGCGGUGCCUCCAUAUGCGUCGGAGAACCAGACCUGCAGGGACCAGGAAAAGGAAUACUAUGAGCCCCAGCACCGCAUCUGCUGCUCCCGCUGCCCGCCAGGCACCUAUGUCUCAGCUAAAUGUAGCCGCAUCCGGGACACAGUUUGUGCCACAUGUGCCGAGAAUUCCUACAACGAGCACUGGAACUACCUGACCAUCUGCCAGCUGUGCCGCCCCUGUGACCCAGUGAUGGGCCUCGAGGAGAUUGCCCCCUGCACAAGCAAACGGAAGACCCAGUGCCGCUGCCAGCCGGGAAUGUUCUGUGCUGCCUGGGCCCUCGAGUGUACACACUGCGAGCUACUUUCUGACUGCCCGCCUGGCACUGAAGCCGAGCUCAAAGAUGAAGUUGGGAAGGGUAACAACCACUGCGUCCCCUGCAAGGCCGGGCACUUCCAGAAUACCUCCUCCCCCAGCGCCCGCUGCCAGCCCCACACCAGGUGUGAGAACCAAGGUCUGGUGGAGGCAGCUCCAGGCACUGCCCAGUCCGACACAACCUGCAAAAAUCCAUUAGAGCCACUGCCCCCAGAGAUGUCAGGAACCAUGCUGAUGCUGGCCGUUCUGCUGCCACUGGCCUUCUUUCUGCUCCUUGCCACCGUCUUCUCCUGCAUCUGGAAGAGCCACCCUUCUCUCUGCAGGAAACUGGGUACCAAUGGCAUUCAUGUCACCGGCGGGUCUAUGACUAUCACUGGCAACAUCUACAUCUACAAUGGACCAGUACUGGGGGGACCACCGGGUCCUGGAGACCUCCCAGCUACCCCCGAACCUCCAUACCCCAUUCCCGAAGAGGGGGACCCUGGCCCUCCCGGGCUCUCUACACCCCACCAGGAAGAUGGCAAGGCUUGGCACCUAGCGGAGACAGAGCACUGUGGUGCCACACCCUCUAACAGGGGCCCAAGGAACCAAUUUAUCACCCAUGACUGACUGAGUCUGAGAAAAGGCAGAAGAAGGGGGGCACAAGGGCACCUUCUCCCUUGAGGCUGCCCUGCCCACGUGGGAUUCACAGGGGCCUGAGUAGGGCCCGGGGAAGCAGAGCCCUAAGGGAUUAAGGCUCAGACACCUCUGAGAGCAGGUGGGCACUGGCUGGGUACGGUGCCCUCCACAGGACUCUCCCUACUGCCUGAGCAAACCUGAGGCCUCCCGGCAGACCCACCCACCCCCUGGGGCUGCUCAGCCUCAGGCACGGACAGGGCACAUGAUACCAACUGCUGCCCACUACGGCACGCCGCACCGGAGCACGGCACCGAGGGAGCCGCCACACGGUCACCUGCAAGGACGUCACGGGCCCCUCUAAAGGAUUCGUGGUGCUCAUCCCCAAGCUUCAGAGACCCUUUGGGGUUCCACACUUCACGUGGACUGAGGUAGACCCUGCAUGAAGAUGAAAUUAUAGGGAGGACGCUCCUUCCCUCCCCUCCUAGAGGAGAGGAAAGGGAGUCAUUAACAACUAGGGGGUUGGGUAGGAUUCCUAGGUAUGGGGAAGAGUUUUGGAAGGGGAGGAAAAUGGCAAGUGUAUUUAUAUUGUAACCACAUGCAAAUAAAAAGAAUGGGACCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-761.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -795.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 405.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((((.((((((.((((..(((((((.(((((((((((((((..((((((((((((((((.(((....(((((.(((((........))))).))))).(((((((.(......).)))))))..(((((.((((((..............))))))..)))))...((((....))))((((((((.....((....))....))))).))))))))))))...)))).))))))..)))).)))))))))))..))))))))))).(((((((........)))))))((((.........))))..((.(.((((((((((((((....((.....))......((((((....(((((...((((..(((....(((((((.........((((..(((.((((((((....(((.(((((...(((.((((.((((((.............)).))))(((..........))).........)))).)))..))))).)))((((.((.(((((((((.....((((.(.(((((((((..(((..(...((((...)))).)..)))....)))).))))).)...))))))))))).)).))))))))).))))))))))))......))))))).....))).))))....)))))..))))))...(((....))).))).)).)))))).)))).))....((((...(((((((((..((((((.(((((((((..(((((.(((.(((......)))..))).))).)).))))))....((((((((((((((.......((((((...(((((.((((.((..((((((((..((.((((((........))))))))..((.((((.(((((..(((..((((((..((((((.(((.(((((((((((((((...(((((.......)))))...))))))).(((((...(((.((......((((..((((.(((((...))))..).))))..)))).........)).))).))))).((((((((......((((((.((((.....((((...(((((..........................)))))...))))..)))).))))))......)))).))))))))))))...))).(((((((..((((.(......).)))))))))))...........))))))..)))))))))..........((.((((.....))))))......))))).)))).))(((((...(((((.((((......)))).))))))))))..(((.....)))..((((((.....))))))))))..)))).)).)))).)))))....((((((....)))))).)))))).......))))))))..)))))).(((...)))..(((((((((((((.((....((((((((.....(((((.((((.........)))).)))))..))))))))...(((..((((((((((..((....((((((......)))).))....(((.....)))....(((((.(((.....(((..(........)..)))....))))))))....))..)))).)))))).)))....(((((((((...)))))))))(((((.......))))))).))))))......(((....)))......)))))))(((.(.((((.((((.((((...)))).)))).))))).)))...........))).)))))).))))......)))))..)))))))))).))))))))))......(((..((...(((((.(((((......))))))))))....))..).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((.(((....{({{{(((,.{(((((((.(((((((((((((((,,({{{{|||||{{((((.(((....(((((.(((((,...,,,,|}}}),))))}.(((((((.(......}.))))))),||||{|,|||||,,,||},.,}},,{{|||{||{{|,||,.,|(((({...|||,((((((((.,.,.((....))...})))))},)),)))}}))),,.)))},)))))),.}})).)))))))))))..)))))))|||}.(((((((........))))))){{||,...,.,,,))))..((.(.((((((((((((((....,{.....}}......((((((....(((((...((((..(((....(((((((......{{.{(((..,({.((((((((....(((.(((((...(((.((((.((((((,,.....,.....}}.}}}},||..............,.,,}},.)))).)))..))))).))){(((.((.(((((((((.....((((...(({,,{(({..((({{.,{{(,({{{.,,,}...})})}}..),))})))))})}..))))))))))).)).))))))))).))))),)}))))}.,...))))))).....))).))))....)))))..))))))...({{....})).))).)))))))))},))),)){((((((((.......((((((((,,,,....((((((..(((((.(((.(((......)))..))).))).)).))))))....((((((((((((((.{...{.((((((...(((((.((((.((..((((((((..,,.,(((((........)))))}}|(((.((...)).))),....((((((((((((((((((((,..{((((((((((((...(((((.......)))))...))))))).(((((,,.(((.((,.....((((..((((.{((((...))))..).))))..))))......,,,}}.))),))))).((((((((......((((((.((((.....((((...(((((..........................)))))...))))..)))).))))))......)))).)))))))))))))))))..(((((((.,({({.,......).)))})))))))..((((.....})))},,...}}...............({.((((.....)))))).,....)))))))))))),((((,..{(((((.((((......)))).)))))))))).,(((,...,)))..((((((.....))))))))))..)))).)).)))).)))))....((((((....)))))).)))))).,...,.)))))))}.,)))))).{{(,.,{(((((((((((.((((({,{....{(({,,(({....|||,,.(((({{{{{{{{{{{||{||,,,.})))}}}|}...(({..((((((((((..((...,{{((((.....,)))}.||{|..{{{..,,.}))}...(((((.(((.....(({,{(.,......)},)))...,))))))))....))..)))),}))))).}}},,..(((((((.{{{{{,,,,))))|((((.......))))}))))))).,.{{{{{{{(....}}}......)))))||{{,.{{((((.((((.((((...)))).)))).,)))),))}........,,,)))))})))))})).,},})))))))))))},)))))))))).))))))))...))).)))))}.{((((.(((((......)))))))))}..))))))))....
Back