Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001414312.1
Sequence Length
1905 nt
GC Content
0.6147
ACUCCCACUUCCUGAGCUCCGCCAUGGGAGCCCUGGAGGCCCGGCCUGGCCGCUCCCGGCCCUGGGGUGCACAUCGGCCCUGAGUCCCGUCCCAGGCUCUGGGCUCGGGCAGCCGCCGCCACCGCUGCCCAGGACGUCGGGCCUCCUGCCUUCCUCCCAGGCCCCCACGUUGCUGGCCGCCUGGCCGAGUGGCCGCCAUGCUCCUGCCUUGGGCCACCUCUGCCCCCGGCCUGGCCUGGGGGCCUCUGGUGCUGGGCCUCUUCGGGCUCCUGGCAGCAUCGCAGCCCCAGGCGGUGCCUCCAUAUGCGUCGGAGAACCAGACCUGCAGGGACCAGGAAAAGGAAUACUAUGAGCCCCAGCACCGCAUCUGCUGCUCCCGCUGCCCGCCAGGCACCUAUGUCUCAGCUAAAUGUAGCCGCAUCCGGGACACAGUUUGUGCCACAUGUGCCGAGAAUUCCUACAACGAGCACUGGAACUACCUGACCAUCUGCCAGCUGUGCCGCCCCUGUGACCCAGUGAUGGGCCUCGAGGAGAUUGCCCCCUGCACAAGCAAACGGAAGACCCAGUGCCGCUGCCAGCCGGGAAUGUUCUGUGCUGCCUGGGCCCUCGAGUGUACACACUGCGAGCUACUUUCUGACUGCCCGCCUGGCACUGAAGCCGAGCUCAAAGAUGAAGUUGGGAAGGGUAACAACCACUGCGUCCCCUGCAAGGCCGGGCACUUCCAGAAUACCUCCUCCCCCAGCGCCCGCUGCCAGCCCCACACCAGGUGUGAGAACCAAGGUCUGGUGGAGGCAGCUCCAGGCACUGCCCAGUCCGACACAACCUGCAAAAAUCCAUUAGAGCCACUGCCCCCAGAGAUGUCAGGAACCAUGCUGAUGCUGGCCGUUCUGCUGCCACUGGCCUUCUUUCUGCUCCUUGCCACCGUCUUCUCCUGCAUCUGGAAGAGCCACCCUUCUCUCUGCAGGAAACUGGGAUCGCUGCUCAAGAGGCGUCCGCAGGUACCAAUGGCAUUCAUGUCACCGGCGGGUCUAUGACUAUCACUGGCAACAUCUACAUCUACAAUGGACCAGUACUGGGGGGACCACCGGGUCCUGGAGACCUCCCAGCUACCCCCGAACCUCCAUACCCCAUUCCCGAAGAGGGGGACCCUGGCCCUCCCGGGCUCUCUACACCCCACCAGGAAGAUGGCAAGGCUUGGCACCUAGCGGAGACAGAGCACUGUGGUGCCACACCCUCUAACAGGGGCCCAAGGAACCAAUUUAUCACCCAUGACUGACUGAGUCUGAGAAAAGGCAGAAGAAGGGGGGCACAAGGGCACCUUCUCCCUUGAGGCUGCCCUGCCCACGUGGGAUUCACAGGGGCCUGAGUAGGGCCCGGGGAAGCAGAGCCCUAAGGGAUUAAGGCUCAGACACCUCUGAGAGCAGGUGGGCACUGGCUGGGUACGGUGCCCUCCACAGGACUCUCCCUACUGCCUGAGCAAACCUGAGGCCUCCCGGCAGACCCACCCACCCCCUGGGGCUGCUCAGCCUCAGGCACGGACAGGGCACAUGAUACCAACUGCUGCCCACUACGGCACGCCGCACCGGAGCACGGCACCGAGGGAGCCGCCACACGGUCACCUGCAAGGACGUCACGGGCCCCUCUAAAGGAUUCGUGGUGCUCAUCCCCAAGCUUCAGAGACCCUUUGGGGUUCCACACUUCACGUGGACUGAGGUAGACCCUGCAUGAAGAUGAAAUUAUAGGGAGGACGCUCCUUCCCUCCCCUCCUAGAGGAGAGGAAAGGGAGUCAUUAACAACUAGGGGGUUGGGUAGGAUUCCUAGGUAUGGGGAAGAGUUUUGGAAGGGGAGGAAAAUGGCAAGUGUAUUUAUAUUGUAACCACAUGCAAAUAAAAAGAAUGGGACCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-770.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -804.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 426.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((((.((((((.((((..(((((((.(((((((((((((((..((((((((((((((((.(((....(((((.(((((........))))).))))).(((((((.(......).)))))))..(((((.((((((..............))))))..)))))...((((....))))((((((((.....((....))....))))).))))))))))))...)))).))))))..)))).)))))))))))..))))))))))).(((((((........)))))))((((.........))))..((.(.((((((((((((((....((.....))......((((((....(((((...((((..(((....(((((((.........((((..(((.((((((((....(((.(((((...(((.((((.((((((.............)).))))(((..........))).........)))).)))..))))).)))((((.((.(((((((((.....((((.(.(((((((((..(((..(...((((...)))).)..)))....)))).))))).)...))))))))))).)).))))))))).))))))))))))......))))))).....))).))))....)))))..))))))...(((....))).))).)).)))))).)))).))....((((...(((((((((..((((((.(((((((((..(((((.(((.(((......)))..))).))).)).))))))....((((((((((((((.......((((((...(((((.((((.((..((((((((..((.((((((........))))))))..((.((((.(((((..(((..((((((..((((((.(((.(((((((((((((((...(((((.......)))))...)))))))..((((((.((((........))))))).)))...((..(((((....)))))..))..((((...))))...(((((...(((...........)))..))))).((((((((......((((((.((((.....((((...(((((..........................)))))...))))..)))).))))))......)))).))))))))))))...))).(((((((..((((.(......).)))))))))))...........))))))..)))))))))..........((.((((.....))))))......))))).)))).))(((((...(((((.((((......)))).))))))))))..(((.....)))..((((((.....))))))))))..)))).)).)))).)))))....((((((....)))))).)))))).......))))))))..)))))).(((...)))..(((((((((((((.((....((((((((.....(((((.((((.........)))).)))))..))))))))...(((..((((((((((..((....((((((......)))).))....(((.....)))....(((((.(((.....(((..(........)..)))....))))))))....))..)))).)))))).)))....(((((((((...)))))))))(((((.......))))))).))))))......(((....)))......)))))))(((.(.((((.((((.((((...)))).)))).))))).)))...........))).)))))).))))......)))))..)))))))))).))))))))))......(((..((...(((((.(((((......))))))))))....))..).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((.(((....{({{{(((,.{(((((((.(((((((((((((((,,({{{{|||||{{((((.(((....(((((.(((((,...,,,,|}}}),))))}.(((((((.(......}.))))))),||||{|,|||||,,,||},.,}},,{{|||{||{{|,||,.,|(((({...|||,((((((((.,.,.((....))...})))))},)),)))}}))),,.)))},)))))),.}})).)))))))))))..)))))))|||}.(((((((........))))))){{||,...,.,,,))))..((.(.((((((((((((((....,{.....}}......((((((....(((((...((((..(((....(((((((......{{.{(((..,({.((((((((....(((.(((((...(((.((((.((((((,,.....,.....}}.}}}},||..............,.,,}},.)))).)))..))))).))){(((.((.(((((((((.....((((...(({,,{(({..((({{.,{{(,({{{.,,,}...})})}}..),))})))))})}..))))))))))).)).))))))))).))))),)}))))}.,...))))))).....))).))))....)))))..))))))...({{....})).))).)))))))))},))),)){((((((((.......((((((((,,,,....((((((..(((((.(((.(((......)))..))).))).)).))))))....((((((((((((((.{...{.((((((...(((((.((((.((..((((((((..,,.,(((((........)))))}}|(((.((...)).))),....((((((((((((((((((((,..{((((((((((((...(((((.......)))))...)))))))..((((((.((((........))))))).)))...((..(((({....})))),,}}..((((,,,}}}}...,{{({...|,|...........})))}))})}.((((((((......((((((.((((.....((((...(((((..........................)))))...))))..)))).))))))......)))).)))))))))))))))))..(((((((.,({({.,......).)))})))))))..((((.....})))},,...}}...............({.((((.....)))))).,....)))))))))))),((((,..{(((((.((((......)))).)))))))))).,(((,...,)))..((((((.....))))))))))..)))).)).)))).)))))....((((((....)))))).)))))).,...,.)))))))}.,)))))).{{(,.,{(((((((((((.((((({,{....{(({,,(({....|||,,.(((({{{{{{{{{{{||{||,,,.})))}}}|}...(({..((((((((((..((...,{{((((.....,)))}.||{|..{{{..,,.}))}...(((((.(((.....(({,{(.,......)},)))...,))))))))....))..)))),}))))).}}},,..(((((((.{{{{{,,,,))))|((((.......))))}))))))).,.{{{{{{{(....}}}......)))))||{{,.{{((((.((((.((((...)))).)))).,)))),))}........,,,)))))})))))})).,},})))))))))))},)))))))))).))))))))...))).)))))}.{((((.(((((......)))))))))}..))))))))....
Back