Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001414355.1

Sequence Length

940 nt

GC Content

0.3862

AGUCCCUGCAUUGCGCGCGACCCGGCGGCGGGACAGGCUUGCUGCUUCCUCCUCCUCGGCCUCACCAUUCCAGACCAAAAUUGAAAAAAUGGUUGACCUCACCCAGGUAAUGGAUGAUGAAGUAUUCAUGGCUUUUGCAUCCUAUGCAACAAUUAUUCUUUCAAAAAUGAUGCUUAUGAGUACUGCAACUGCAUUCUAUAGAUUGACAAGAAAGGUAAGAAAUUUGGAGGUUUUUGCCAAUCCAGAAGACUGUGUAGCAUUUGGCAAAGGAGAAAAUGCCAAGAAGUAUCUUCGAACAGAUGACAGAGUAGAACGUGUACGCAGAGCCCACCUGAAUGACCUUGAAAAUAUUAUUCCAUUUCUUGGAAUUGGCCUCCUGUAUUCCUUGAGUGGUCCCGACCCCUCUACAGCCAUCCUGCACUUCAGACUAUUUGUCGGAGCACGGAUCUACCACACCAUUGCAUAUUUGACACCCCUUCCCCAGCCAAAUAGAGCUUUGAGUUUUUUUGUUGGAUAUGGAGUUACUCUUUCCAUGGCUUACAGGUUGCUGAAAAGUAAAUUGUACCUGUAAAGAAAAUCAUACAACUCAGCAUCCAGUUGGCUUUUUAAGAAUUCUGUACUUCCAAUUUAUAAUGAAUACUUUCUUAGAUUUUAGGUAGGAGGGGAGCAGAGGAAUUAUGAACUGGGGUAAACCCAUUUUGAAUAUUAGCAUUGCCAAUAUCCUGUAUUCUUGUUUUACAUUUGGAUUAGAAAUUUAACAUAGUAAUUCUUAAGUCUUUUGUCUGAUUUUUAAAGUACUUUCUUAUAAAUUUGGAUCAUGUUAUGAUUUGUAACAUUCACACAACACCUCACUUUUGAAUCUAUAAAAGAAUUGCACGUAUGAGAAACCUAUAUUUCAAUACUGCUGAAACAGACAUGAAAUAAAGAAUUUAAAGAAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-209.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -230.01

Frequency: 0.0000

Diversity: 230.91

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((......((.(((......))))))))))(((((((.((((((.((.(((...((((..........(((((............)))))..........))))...))).)).))))))..)).)))))((((((...))))))...(((((((((.........(((...........)))(((((((((((((((((.(.(((..((((......(((((((((....)))..))))))....(((((..((((((.....(((((...(((......))))))))...)))))).((((((((((((.(...((((..............................((((.....))))((((((...((((((((...((((((.....(((((.........(((((((...((.(((.....))).))))).)))).........(((......((((.(.(((((((.((((((((...(((((..((((.....(((..(((((((((.......))))))...((((((((((((....))))......)))))))).....)))..)))))))))).))...)))))).((((((((....(((.(((...........)))))).)))))))).....))..))))))).)))))......)))....)))))....)))))).))))).)))....))))))...))))...).)))))))).))))((((..(((((((....((((......(((((........)))))......))))......))))))).))))(((((((.....)))))))..)))))..))))..))).).)))))))...)))).)))).)).........((.(((((((...(((......)))...))))))).)).....)))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((.{(...{(,({{.....,)))))))))){(((({{.((((((.((.(((...((((..........(((((...,,.....,.)))))..........))))...))).)).))))))..}}.))))}((((((...))))))...(((((((((.,....,,.,{({{{{|.||,,{{{{{,{{{{(((((((((((.(.(((..((((......(((((((((....)))..))))))....(((((..,,{((((({..........})))}}|,,||||||}}...|}}}}}.((((((((((((.(,,,((((.......,,,..,,..............,,((((.....))))|(((((...((((((((...((((((.....(((((....{{....((((((.{(((.(((.....)))}))),,.||.....,,....,..||{,....}}.}.{(((((({((((((((...(((({.,(((||,..,|{{,,{{(((((((.......))))))|.{((((((((((((....}}}}......}))))))},,...,}}..}}}}}))))).})..,)))))).{{{{(({{,,|.{{{.,{,.,,,.......}}},,,.}))))))).....)),.))))))).)))},)),....})....)))))....)))))).)))))},))....)))))}...)))),,.,.)))))))).))))((((..(((((({....((({.,,...{((((........)))))...,,.))))......})))))).)))}(((((((.....)))))))..))))}..))))..))).).)))))))}..})))})))),})}}}}}....((.(((((((...(((......)))...))))))).))..,,.})))))))}