Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001414357.1

Sequence Length

1022 nt

GC Content

0.3806

AUUCUGGACCCUGAACAGGAGGGGACAUCGUGACAAAGCAAAUUGUCUGGUAUCAUGAAUUUGGAACACCGUAAGUGAUCUUUACUGAGGGUUACAUUCUGUCAUUGUCAGCCUUUUAAGGAGGCCUUGCCACCAGCGCAGGGGAGGUGAAGUCUAAGGGAAGAUUCCAGACCAAAAUUGAAAAAAUGGUUGACCUCACCCAGGUAAUGGAUGAUGAAGUAUUCAUGGCUUUUGCAUCCUAUGCAACAAUUAUUCUUUCAAAAAUGAUGCUUAUGAGUACUGCAACUGCAUUCUAUAGAUUGACAAGAAAGGUUUUUGCCAAUCCAGAAGACUGUGUAGCAUUUGGCAAAGGAGAAAAUGCCAAGAAGUAUCUUCGAACAGAUGACAGAGUAGAACGUGUACGCAGAGCCCACCUGAAUGACCUUGAAAAUAUUAUUCCAUUUCUUGGAAUUGGCCUCCUGUAUUCCUUGAGUGGUCCCGACCCCUCUACAGCCAUCCUGCACUUCAGACUAUUUGUCGGAGCACGGAUCUACCACACCAUUGCAUAUUUGACACCCCUUCCCCAGCCAAAUAGAGCUUUGAGUUUUUUUGUUGGAUAUGGAGUUACUCUUUCCAUGGCUUACAGGUUGCUGAAAAGUAAAUUGUACCUGUAAAGAAAAUCAUACAACUCAGCAUCCAGUUGGCUUUUUAAGAAUUCUGUACUUCCAAUUUAUAAUGAAUACUUUCUUAGAUUUUAGGUAGGAGGGGAGCAGAGGAAUUAUGAACUGGGGUAAACCCAUUUUGAAUAUUAGCAUUGCCAAUAUCCUGUAUUCUUGUUUUACAUUUGGAUUAGAAAUUUAACAUAGUAAUUCUUAAGUCUUUUGUCUGAUUUUUAAAGUACUUUCUUAUAAAUUUGGAUCAUGUUAUGAUUUGUAACAUUCACACAACACCUCACUUUUGAAUCUAUAAAAGAAUUGCACGUAUGAGAAACCUAUAUUUCAAUACUGCUGAAACAGACAUGAAAUAAAGAAUUUAAAGAAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-232.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -258.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 296.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((..((((.......))))..).....(((((......)))))((((.(((......)))...))))...(((((((((...)))))))))(((((((((((((..((((((...)))))).....(((((..((.((((((((.((((((..((((...)))))))).................)).))))).)))..))..))).)).((.((((((((((((..((((((...))))))..((((((........)))))))).)))))))))).)).(((((((((...(((((.((((((...)))))).)))))....)))..))))))...((((((..........))))))((((...))))..))).))))))))))...(((((((....(((......((((((................((((.....))))((((((...((((((((...((((((.....(((((.........(((((((...((.(((.....))).))))).)))).........(((......((((.(.(((((((.((((((((...(((((..((((.....(((..(((((((((.......))))))...((((((((((((....))))......)))))))).....)))..)))))))))).))...)))))).((((((((....(((.(((...........)))))).)))))))).....))..))))))).)))))......)))....)))))....)))))).))))).)))....))))))((((((((.........))))...))))...(((((((....((((......(((((........)))))......))))......)))))))(((((((...)))))))....))))))........))).((((((......))))))...))))))).........((.(((((((...(((......)))...))))))).)).......)))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

...(((((..((((...(((((((.....(((.((({{{{,.,,||.(((({,{{......||{..,,||,...(((((((({...}))))))))((((((((((((({.((((({...}))))).,{{{(((((..((.((((((((.{{((((..,(({...})))}|||({...,,.....,.}}})).))))).)))..))..))).}}.,{.((((((((((((..((((((...))))))..((((((........))))))))},))))))))).}}.(((((((((...(((((.((((({...}))))).))))).,..)))..))))))...{{||||..........}}))}}{{{{...))))}.})}}))))))))))...,|||||.,,{{(,{.,,,.,,}..,,..............((((((.....))))))||||,,,||||{......(((.(({....})).)))}}}}}},{((((({.,{((.(((.....)))}))))).)))}.)))}}.}}.,}))}...}})).))))))))))((((({(({.{(((((...}))))}})}))))).(((((((.......))))))}.,((((((((((((....))))......)))))))).,.............))))..)))))..,,||{(((,,(((((((.,...((((((((((((.(({{((({,.,{{{{..{{{{{{{(((|||,.{,|,(({{{{{{{{{{.((((.....)))).}},{,{((({.({...)).})}}},}|||{|||||,|||}}}..,,|||{{||,,,,,,,....,}}}}}))}}..}}}}}}}}}))))..)}})))))).,}}})))))))}}}))){{((((({(,...{||},,}}............,,,{{{{{|,.,...}}})))....(((.(((({{((........)))),})))))).....}}))}}))).,,,.))))))),,))),...