Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001414362.1

Sequence Length

1521 nt

GC Content

0.3544

AGUCCCUGCAUUGCGCGCGACCCGGCGGCGGGACAGGCUUGCUGCUUCCUCCUCCUCGGCCUCACCAUUCCAGACCAAAAUUGAAAAAAUGGUUGACCUCACCCAGGUAAUGGAUGAUGAAGUAUUCAUGGCUUUUGCAUCCUAUGCAACAAUUAUUCUUUCAAAAAUGAUGCUUAUGAGUACUGCAACUGCAUUCUAUAGAUUGACAAGAAAGGUUUUUGCCAAUCCAGAAGACUGUGUAGCAUUUGGCAAAGGAGAAAAUGCCAAGAAGUAUCUUCGAACAGAUGACAGAGUAGAACGUGUACGCAGGGCACAGGAGAUCUUAGGCCCAGAAAGGCAGAUUCAGAAGAACCUACAUGUAAAUGAGACUGGAGUGGAAAUGAGAAUGGCAGGAAAUGCAUGGAAACAGACUUGUAACUGUCUCAUGGCCUGGUCGUCCAAAUCCCAGAGAAUCAAACAAACCCUGAGCAUUUAUCUUGCCUCUUCUAUAUAAAGUUUAACUCGGCAUAACCAAUUGCUGAUGAAGAAGAAAUGUUUCCUUGUAGAAGCAAACCAGUGAAUAAUUGAAGAAAAAAUUUAUCUUUUCAACAUCUAAUGAGUUAAUGGAUUCAAGCAAAGAUUAUCCACGGCUGUUAACAACACAAAAAGACAAUCGGAAAUUAGCUAUUACUGCGGGAAGUACCCAAUACCAUCUAUGAAACUGUGUGGACAAAAACACUGACAAAAAUCUCCACGAAUCUCUAAUUUUGAAUACAAAUUUAAAGAAAAUGCAAAGGAUUAAAAUAGACCAUGAUGAAGUCAGAAAAAUUCAGACAGAGAAAAAUGCUCCAGGACCAGAAACCCAUUUCUUCCGCAAAAGCUUCCAGGUAGAGAUUGACUGACCGAGAGAACAGAGACAUAGAGAGAACCUAGAGAUUAAAAGAAACUUGAGCGAUUUGUCAGCAUUCAGUUGCAACGUAUGGAUGUGAUUUGAAUUCUAAUUUAAAAACCAAAGUAGAAAGUGGUAAACAAUUGGGGAAAUGUGAACAAUGAUAGAAUAUUUAAUAUUAAUGAAAUAUGUUAAAUAUUUUCAGAUAUGAUAAUGGCAUUGAGUAUGUAAAAAAGAGCCUGUUUUUAAAGAAAUACCUCUGAAAUACAGAUGAUAUAAUAUCAUCUGUAUAUUAGAUGAUAUUAUAUAUAUCAGUAUCAUCAGAAUAAAGUAAGGUUAGCAUGAAUUGUUAAUUGUUGACACUGUGCAAUAGGUACGUGGAUAAUUACUAUACUGUUCUCAUUCCUUUUAUUUAUGUUUGAAAUGUUCUAAAAUUAAAAGUUAAAGCAUAGAGUGUAAAGUUGAGCAAAUUCCUCCAAGACCUAAAUAUAGCUUAUCAAAACUUACAUUAAUUAGAUGCUGACUGUUGAGCUAAUACUUUUUUUUAAUGAUGUGUGCUUCAGUUUAUUGCACUUUUCAAAUACUCCAGUUUUUUGUGUGCGUGUGUUUUUUAAAUUUUAUUAUUAUUAAAGUUUUAGGGUACAUGUGCACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-339.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -370.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 493.23

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...........((((((.((((((((.(.(((((((((..((((.((((((((((.....(((((((((((((.......((((((.((((((((((((.....))))...(((((..(((((.......)))))..))))).......)))))))).))))))........(((.(((((.((((..(((((((((...(((((.((((((...)))))).)))))....)))..))))))((((((.....(((((...(((......))))))))...))))))...(.(((.......))).).((((..(((....)))..))))......))))))))).)))...((.(((....))))).)))))))))...))))...)).)))).......)))).))).)..))..))))))).).)))((((((((........................(((((((((((.((((...((((((.((...........((((((........)))))))).))))))..((((((......))))))...((((.....))))..(((((........)))))(((.((....)))))..(((((.............)))))(((.((((.............)))).))).......((.......))(((.....))).....((((.(((...(((((((((....................)))))...(((.(((.((((....)))).))).))).................))))..)))))))..(((.(((...))).))).)))).))))))).))))...........((((((.((.............)).)))))).))).)))))((((((((.(..((((.(((((((...((((((((((((((....(((.....(((((((((.((((..........((((((((((((((((((.(((((.........(((((.((..((((((...((((((.((.(((((...((((((((((((((((.........)))))))))))).(((....)))....(((.((.............)).)))((((((....))))))..(((((.((((.(((((((((((((((((((.....))))))))))))))).)))).))))..))))).........((((((((.....)))))))).....(((.((((.....)))))))........))))..))))).)))))))).......))))))..)).)))))..........)))))...)))))).......(((((........................))))))))))..))))))))))).)))))))))......))).....)))))))))))((...((((...........))))...)).....)))..))))))).))))..).))))))))((((((((.......))))))))..)))).).))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{{({((({..((((((.{{{{,((((({(((,,,,.|}}}}})}}{,,,|{((({..{{(((({(((((({{{{(,...,{,....|,|||||{{{{{,,.,,))))..}))|}),,||((((((((((((..{(((({...}))))}..|{{{{{...,,,..}})))}))|}))))))))|{{..{{({{((((...(((((.((((({...}))))).))))).},,)}},,}||}}}{,,{{|||..,||||....|||,,....||||||}}....})))},,...}}....}})))).)))))||,}{{(.,.{||,..|||......)))}}}}},..|}},.,||.{{{....,,|{(((((((({({,,,((((({{((((((({((((.,{|...||{..,,||..}}}|(((.{((..(((....)))....)}})))}.....,,,,..|}||.))))},.}))))))((((((.,,...........((((((........))))))}).))))))..((((((......))))))...((((.....}}||,.(({{{........))))),........{(((((....)))))}......{((({((({(({,((((.............||||.,||....,,.{{..,,.,,}}(((.....))).....{((({((,..,{,((((,{{,.....,,|{{{{{,,,{{({{,,....((((((..(((({{{....)})))})}..........{{.||......,.}).,,,,,..(((.((,...})).))).|||,....,,))}..(({..((((,....}))))})){{....)),{{..{|{||,|.....)),}))..}}}.,||,,..,,}}}}||,....,.|||}||,,,,,,,,....,{,..}}}|||||{((((((((({{.(.....),)))}}|||}}}|{(({{({,....{{{{...,,,,...})))....}}}}|||,..,{{,,,,{,.,,,.,(((((((((((((.........)))))))))))))|||....}}}....{({,{|....,,,,.....,,.|}}{{{{{{....,}}}},..(((((.((((.(((((((((((((((((((.....))))))))))))))).)))).))))..))))).....,..,,||(((((.....))))}}))))),}}}|.||{{.,,,})),))))))))))).......,)))))))))))......,{{{((((|,{{{,{,.,,..........}}.})))))}|((((((({{(((((({...,.....,,,,........{{||||{.{{..,,|||||||.....)))),))},}}.}}}))),.,,.,}}})))},,,||.,,,|||,,}}},,..,}))))}},}},..,)))))))))))|{{{{||{{|{||||||},((((((((.......)))))))).}))))))})))))))}.