Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001414363.1
Sequence Length
832 nt
GC Content
0.3930
AGUCCCUGCAUUGCGCGCGACCCGGCGGCGGGACAGGCUUGCUGCUUCCUCCUCCUCGGCCUCACCAUUCCAGACCAAAAUUGAAAAAAUGGUUGACCUCACCCAGGUAAUGGAUGAUGAAGUUUUUGCCAAUCCAGAAGACUGUGUAGCAUUUGGCAAAGGAGAAAAUGCCAAGAAGUAUCUUCGAACAGAUGACAGAGUAGAACGUGUACGCAGAGCCCACCUGAAUGACCUUGAAAAUAUUAUUCCAUUUCUUGGAAUUGGCCUCCUGUAUUCCUUGAGUGGUCCCGACCCCUCUACAGCCAUCCUGCACUUCAGACUAUUUGUCGGAGCACGGAUCUACCACACCAUUGCAUAUUUGACACCCCUUCCCCAGCCAAAUAGAGCUUUGAGUUUUUUUGUUGGAUAUGGAGUUACUCUUUCCAUGGCUUACAGGUUGCUGAAAAGUAAAUUGUACCUGUAAAGAAAAUCAUACAACUCAGCAUCCAGUUGGCUUUUUAAGAAUUCUGUACUUCCAAUUUAUAAUGAAUACUUUCUUAGAUUUUAGGUAGGAGGGGAGCAGAGGAAUUAUGAACUGGGGUAAACCCAUUUUGAAUAUUAGCAUUGCCAAUAUCCUGUAUUCUUGUUUUACAUUUGGAUUAGAAAUUUAACAUAGUAAUUCUUAAGUCUUUUGUCUGAUUUUUAAAGUACUUUCUUAUAAAUUUGGAUCAUGUUAUGAUUUGUAACAUUCACACAACACCUCACUUUUGAAUCUAUAAAAGAAUUGCACGUAUGAGAAACCUAUAUUUCAAUACUGCUGAAACAGACAUGAAAUAAAGAAUUUAAAGAAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-180.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -199.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 260.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((......((.(((......)))))))))).(((.....(((((.((.(((...((((..........(((((............)))))..........))))...))).)).)))))....)))((((((((....((((.((((.((((((..........))))))((((...))))....(((..((((.(((((.(((((.((((((......(((((((..............((((((.....))))))((((....((((......(((.(((....))).))))))))))).....)).)))))....)))).))..)))))..))))).....(((......((((.(.(((((((.((((((((...(((((..((((.....(((..(((((((((.......))))))...((((((((((((....))))......)))))))).....)))..)))))))))).))...)))))).((((((((....(((.(((...........)))))).)))))))).....))..))))))).)))))......)))...((((.....))))......(((((.((...)).))))).))))..))))))).)))))))))))).................((((((((((((((((((((.((((..(((......)))......(((....(((((((.....))))))).....))).......((((((......))))))....(((.((((((((........)))).))))))).))))))))))......)))).)))).))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.{{...{(,({{......)))))))))).(((.....(((((.((.(((...((((..........(((((...,,.....,.)))))..........))))...))).)).)))))....))),{{{{{{{..{{((({{.,{{{((((({..,,,,....|}}}}}{,,||,||}}}...,|||}}|{{{,(((((,((,({,,{(((.,.....,,|..,,..............,{((((.....))))||((((...{(((((((...((((((.....(((((,,,.|{.,.,{{((({.,{((.(((.....)))))))}}.||.,...}.....,..||{,...,}}.|.,(((((({({((((((...(((({..{||||,,,,|||}}|,(((((((.......))))))}.{((((((((((((....}}}}......}))))))}.,...,,}..}}}}}))))).})..,)))))).{{{((({{,,|.{{{.,{,.,,........}}},...}))))))).....)),.))))))).))))})),....}}....)))))....)))))).)))))},})....))))}}.,.}))),,,},})))}))).})))}}}|.........,,,,,}}.((((((((((((((((((((.{{({,,{{(......}}}..,...,{{{,..(((((((.....))))))),,.............{{{{{|......,}})))....(((.((((((((........)))),})))))).}}},))))))......))))}}))),}})))}..
Back