Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001414373.1

Sequence Length

834 nt

GC Content

0.3621

AUUCUGGACCCUGAACAGGAGGGGACAUCGUGACAAAGCAAAUUGUCUGGUAUCAUGAAUUUGGAACACCAUUCCAGACCAAAAUUGAAAAAAUGGUUGACCUCACCCAGGUAAUGGAUGAUGAAGUAUUCAUGGCUUUUGCAUCCUAUGCAACAAUUAUUCUUUCAAAAAUGAUGCUUAUGAGUACUGCAACUGCAUUCUAUAGAUUGACAAGAAAGAGCCCACCUGAAUGACCUUGAAAAUAUUAUUCCAUUUCUUGGAAUUGGCCUCCUGUAUUCCUUGAGUGGUCCCGACCCCUCUACAGCCAUCCUGCACUUCAGACUAUUUGUCGGAGCACGGAUCUACCACACCAUUGCAUAUUUGACACCCCUUCCCCAGCCAAAUAGAGCUUUGAGUUUUUUUGUUGGAUAUGGAGUUACUCUUUCCAUGGCUUACAGGUUGCUGAAAAGUAAAUUGUACCUGUAAAGAAAAUCAUACAACUCAGCAUCCAGUUGGCUUUUUAAGAAUUCUGUACUUCCAAUUUAUAAUGAAUACUUUCUUAGAUUUUAGGUAGGAGGGGAGCAGAGGAAUUAUGAACUGGGGUAAACCCAUUUUGAAUAUUAGCAUUGCCAAUAUCCUGUAUUCUUGUUUUACAUUUGGAUUAGAAAUUUAACAUAGUAAUUCUUAAGUCUUUUGUCUGAUUUUUAAAGUACUUUCUUAUAAAUUUGGAUCAUGUUAUGAUUUGUAACAUUCACACAACACCUCACUUUUGAAUCUAUAAAAGAAUUGCACGUAUGAGAAACCUAUAUUUCAAUACUGCUGAAACAGACAUGAAAUAAAGAAUUUAAAGAAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-180.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -196.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 230.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((..((((.......))))..).....(((((......))))).((((((((...(((((((.....)))))))......((((((.((((((((((((.....))))...(((((..(((((.......)))))..))))).......)))))))).))))))..)))))))).....(((((((((.....((.((((((((..(((((..(((......((((((................((((.....))))((((((...((((((((...((((((.....(((((.........(((((((...((.(((.....))).))))).)))).........(((......((((.(.(((((((.((((((((...(((((..((((.....(((..(((((((((.......))))))...((((((((((((....))))......)))))))).....)))..)))))))))).))...)))))).((((((((....(((.(((...........)))))).)))))))).....))..))))))).)))))......)))....)))))....)))))).))))).)))....))))))((((((((.........))))...))))...(((((((....((((......(((((........)))))......))))......)))))))(((((((...)))))))....))))))........)))..))))))))))))).))...))))).)))).......((.(((((((...(((......)))...))))))).)).......)))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((..((((.......))))..),,,,.(((((......})))),|(({((({...{((((((.....))))))}......{(((({.{((((((({(((.....}}}}..,(((((..(((((,,,,,..})}}},,||}}}.,,,,,.)))))))}.}))))}..)))))))}.,|,,|||||{{{{,{{{{(((((((((((.,{((({..(((......((((((..............,,((((.....))))|{((((...((((((((...((((((.....(((((....{{....((((((.{(((.(((.....)))}))),,.||,....,,....,..||{,....}}.}.{(((((({((((((((...(((({..{{|||,,.,|||,||,(((((((.......))))))}.{((((((((((((....}}}}......}))))))}.,...,,}..}}}}}))))).})..,)))))).{{{{{({{,,|.,{{.,{,.,,,.,,....}}}},,.}))}))))....,)),.))))))).)))},)),....})....)))))....)))))).)))))},))....)))))}{(((((((.........))))...)))},,.((((({{,...((({......(((((........)))))...,,.))))...,,.}}}}}}}{{{{{({.,,}}))))},,,.))))))........))).,))})})))))))}..})))})))).))}},.|....((.(((((((...(((......)))...))))))).)).......)))))..