Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001414513.1
Sequence Length
2844 nt
GC Content
0.6006
GCUCUGGGUUGUGGGAGUUGGGGAGCUGCUCCGGCUUCGGCGCGGAGGGGCGGCGGCCGGGGAGGCGGCGGCGGCGGCAGGAUUCCCAGGAGCCAUGUUGUCAGAAGUCCUACUGGUGUCUGCUCCGGGGAAAGUCAUCCUUCAUGGAGAACAUGCCGUGGUACAUGGCAAGGUAGCACUGGCUGUAUCCUUGAACUUGAGAACAUUCCUCCGGCUUCAACCCCACAGCAAUGGGAAAGUGGACCUCAGCUUACCCAACAUUGGUAUCAAGCGGGCCUGGGAUGUGGCCAGGCUUCAGUCACUGGACACAAGCUUUCUGGAGCAAGGUGAUGUCACAACACCCACCUCAGAGCAAGUGGAGAAGCUAAAGGAGGUUGCAGGCUUGCCUGACGACUGUGCUGUCACCGAGCGCCUGGCUGUGCUGGCCUUUCUUUACUUAUACCUGUCCAUCUGCCGGAAGCAGAGGGCCCUGCCGAGCCUGGAUAUCGUAGUGUGGUCGGAGCUGCCCCCCGGGGCGGGCUUGGGCUCCAGCGCCGCCUACUCGGUGUGUCUGGCAGCAGCCCUCCUGACUGUGUGCGAGGAGAUCCCAAACCCGCUGAAGGACGGGGAUUGCGUCAACAGGUGGACCAAGGAGGAUUUGGAGCUAAUUAACAAGUGGGCCUUCCAAGGGGAGAGAAUGAUUCACGGGAACCCCUCCGGAGUGGACAAUGCUGUCAGCACCUGGGGAGGAGCCCUCCGAUACCAUCAAGGGAAGAUUUCAUCCUUAAAGAGGUCGCCAGCUCUCCAGAUCCUGCUGACCAACACCAAAGUCCCUCGCAAUACCAGGGCCCUUGUGGCUGGCGUCAGAAACAGGCUGCUCAAGUUCCCAGAGAUCGUGGCCCCCCUCCUGACCUCAAUAGAUGCCAUCUCCCUGGAGUGUGAGCGCGUGCUGGGAGAGAUGGGGGAAGCCCCAGCCCCGGAGCAGUACCUCGUGCUGGAAGAGCUCAUUGACAUGAACCAGCACCAUCUGAAUGCCCUCGGCGUGGGCCACGCCUCUCUGGACCAGCUCUGCCAGGUGACCAGGGCCCGCGGACUUCACAGCAAGCUGACUGGCGCAGGCGGUGGUGGCUGUGGCAUCACACUCCUCAAGCCAGGUAUCCCGGGGGGCUGGAGCAGCCAGAAGUGGAGGCCACGAAGCAGGCCCUGACCAGCUGUGGCUUUGACUGCUUGGAAACCAGCAUCGGUGCCCCCGGCGUCUCCAUCCACUCAGCCACCUCCCUGGACAGCCGAGUCCAGCAAGCCCUGGAUGGCCUCUGAGAGGAGCCCACGACACUGCAGCCCCACCCAGAUGCCCCUUUCUGGAUUAUUCUGGGGGCUGCAGUUCGACUCUGUGCUGGCCAGCGAGCGCCCAGCUCCUGACACUGCUGGAGAGGCCCCAGCCGCUUGGCGAUGCCAGCCAAGCUCUGCAGUCCCAGCGGUGGGACCUAGGGAGGCAUGGUCUGCCCUCUGCAUCCUCUGGAGCCAGCCGAGCAGGAGGCCUAGGAGGGUCCUCUGAGACUCCAGACCUGAGGCGAGAAGGGCUGCUUCCCUGAAGCUCCCACAGUCCCAUCUGCUUCAGGCCCCCGCCUUGGCCUGUGUUCUUCCUGGCCGCCUGGGUCCAAUGCUCAGGUGCUGGGGCCUGGUUCCCGGAGAAGUGUGCCUUCUCUCUCCCUUUUCAGGGACCGCCCCCUGUCUCUCAGGGCCAGGCCUCUCCCUCCUCCAGGAAGCCUUCCCCUACCCCUUGUCGCCCCUCCCUCCCAGAGCACCUGCUGUCUGGGUGGCUCACUCAGCACUUGGUGUGGCCUUCCCUUCUACCUAGCGGGAUGGGGCUCCCCCAGGGGCUGUCCCGGAGGCGGUGGGCCUGGUUAAAUAAGGCAGGGUUUAUAUGCACUUUCUUCCGAUCUGUACCUGAGAGGUUUGUGGAAAAGAUGGCAAAUGGGGAAUAAAAAGAUUUUGUGUCAACAGUAGAGACUCCAGGCCACCAGCACCUCCCUCUGUCCCUGUCCCCUCUCCAGCUGUUUCCUCCAUGGAGCUCUUCAGCAAUGGAGGGAAAUAGGGUUUGGGGUCACUUUGUUGUGCGUCUUGGGGAUGAGGUGGCUUUUCCCAGAUGGCCCUUGCUGGAGAGGGACUGGGACACGGCUCUCAGUCCAUCAGCACAACUCUAGGCUGCUGCUGCGGAGGGAGAAGUUGAGCUUCCUAGCUCCAGAAUCACAAGCACCCACGAGAGCACAGACCUGUGUAAGACAGGAAAGCAGAACCUGCCAUCGCUCCUGGGGCGCGCCUUCCUUUCUGAAAUGAACUGGCUGGAUGGAGAAAACAGACUCAAAUGUUCUGGCCCGGGUGCCUGGCACUCCCCACCCCCGCCCCCCACCGGCCCUAUUUGAACUUUAUAUUGCAGUCAGCUUGGUGCUUUCCGAAAUGCCAUUAGCCAUCAGGAAACCCUUGUAGUUGGUGCCUUGCCAGCCAGAACCUCUGGGACCCACGGACCUGCAAAGAGGCCGAGUGGAAAGGUGGGGGCCGGCGCAGGGAUUUCAGGAUGAGGUGAAAGCGAUUCAGUGCGCGUCUGCCCUUGGCCACUAGGGGGCAGCUGGCGGCCUUCCCUGCUGUUGUCUUCCUGCAGGGUGAGAGGAGCAGGAGCCGAGCUCCACCCCCACGCCAGCCUUGGGCCCGGCCUGGGAUCACUGCUGGGAACGUGAGAGUGAAGGGAGGACGCCUACCCCAGCUUAACUUGUAGAAAUGGCCCCAGAUCACUGAUGGCUGUUCCCUGCCCCUUCCCUUCAAAACACAACGCAUAAAGCAGUAAUACUAAUUAAUACUGAACGCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1207.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1255.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 711.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((.((((((......(((((.((((.(((....))).))))((((((((.(((.(((((((((.(((.(((((((((.(((....)))))..((((((((........((((.(((((((((((((((.((..((.((((.(((..(((.((((((.(((........))).))).)))))).))).))))...))..)).)))).)))).......((((......))))..))))))).))))..((((.......))))....(((((((((.(((((.(((..(((((((...((.......))....)))))))..))).))))).........(((((..(((..........)))....)))))..)))))))))))))))))..))))))).)))(((((......)))))..(((((((((((((.(((...(((((((((.....)))))((((.((((((.((....((((((.((((.((.(((.((((...((((((.....))))))...)))).))))))))))))))))).))))))..))))((((..(.....)..))))(((((((..((((((...)).)))).((((((...((.((((.....((.(((((((((((..........(((.(((((((...(((((..(((...(((..(((..((.((((((.(((((((....))))..))))))))).))..))).......((.....)))))...))).)))))...))))..))).)))))))))))))).))......))))...))....)))))).((.((((((....(((((((((........((..((((......(((((((.((((((((..((..((....))..))...((((((((((((..(((....)))..))))).)))))))(((....))).(((..((.(((.......(((((((......((((....)))).)))))))........)))))..)))..))))))))..))))))).((((((((.((.((((.(((((((.((((.(((...((.(((((((((((.....(((((.(((((..(((......))).......((((((((.((((((.(((((...)))))...(((.((((((((..(((.((......)).))))))))))).)))(((.((..(((......)))...)).))).((((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((......)))).(((.((((....)))).)))(((.(((((((((((..(((((........))))).........)))))))))))))))))).).))))..(((.((((.....))))))).(((((((((...(((..(((..(((((((.......))))))).)))..))))))))))))....)))))))))..)))(((.(((((((((.....((((.((((.((..(((((((((.(((.(((...((((......))))((((((((.(((.((((((((((...)))))......)).))).)))))))))))..))).))).))))........)))))..)).)))).))))......((((((((((((((((((((((((((((.....))))))).(((((....))))).....((((((((.....((((((((((...((.(((((.(((((((..........(((.(..(((((((((.((((((((....))..)))))).((((((((........)))).))))................)))).)))))..)...))))))).))).))))).)).)))))))))).....))))))))..(((.(((..(((.(((((......((((...))))...))))).)))..))).))))))))............((.((.......)).)).))))))).))))))))).....((((((.(((((.((((((((..((((((((((...(((....))).))))))))))..(((((((((((((((((((((.(........).)))))))))))....)))))...))))).))))))))))))).)))))).((((...))))...((((((........).))))).))))))))))))....(((((....)))))(((((......((.(((.((.((((.....(((((.....)))))...((((...))))....)))).))))).))........))))).......)))).))))))))))...(((((......).)))).)))))))))))))).....))))).))))).((....)).....................))))))))))).))......(((.(((..(((.(((((..((((.((((((.((((((.(((((((..(((((...)))))...((((((.(((......)))))..))))...))))))))))))))))))).))))..)))).).)))..))).)))))).))))...)))).))).)))).)).)).)))))).(((....((((((.((.((.(((....))).)).)).)))))).))))))).))......)))))))))..))))))))..))))))).....))))...))).))))))))))))).))))).)))).)))...........(((((((.(((....)))..)))))))..)))))))))))))......)))))).))...)))............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(((((((((((((((((((((((((,(((....}}).})(((((({.((((((((((((((({(({({(((((,.((....(((((.((..{(((({..(((((((..((((.(((((((((((((((.((..((.((((.(((..(((.((((((.(((........))).))).)))))).))).))))...))..)).)))).)))).......((((......))))..))))))).))))..{({(,,....,)))}....(((((((((((((((.(((..(((((((...{({....},,}.,..)))))))..))).))))),{{.,,,.,,{,((((.((((((...,,({((......)|)}.,..}))))))))}.},,.}}}.})),......((((((((.{.(((((.........|||,...(((((...{{((((((..((({(((((((((.,,.({{.({(({{{{,{({({((({(({(((((((((..,)),}}}),.,}}|||},|,|))))}}}}.,))))),}},))}|{{{|,,,.,|}}.}}{{{(((((((.((({{{...,(({,,...)).,}))}}}},.,,,....((((.....((.(((((((((((..........(((.(((((((...{(({||,((,...,||..(((..((.((((((.(((((((....))))..))))))))).))..))),{{....,,.....}))}...}}}}.)))))...)))),,))).)))))))))))))).))......))))...}}})))))),.}}}))))))))))))..))))),..})}.))))).|.....}}...(((((((.((((((((..,...,{....|,..||,.,((((((((((((.,(({...,))}..))))).)))))))(((...,))).(({..((.(((.......(((((((......{{,..,...},,.)))))))....,...)))})..)))).))))))))..))))))).))))).).)))))))).))))))))))))))))))}))))}.((((((((((,{,((.((.((((((((((((..............)))}((.,.(((((((((((((.{{..((((.(((.((((((((..{((.((......)).))))))))))).))).,})))...,}.)).})))}.))))))).),..)).......))))))))|)))}}..,.))),}))}})))..))))))).(((..(((.((((({,(({.(((.(((((((((((..(((((....,,..,}})).....,,}})))))))))))))).{{{{{{((((({(((.((((.....))))))).(((((((((...(((..(((..(((((((.......))))))).)))..))))))))))))((,.{((((({{(((.{{..,,}))}}))}.))).}}}}.|))|))},|}||}}}|,,,..,,.))|)))))).)))..))),.((((((((.(((.((((((((((...)))))......)).))).))))))))))),}}))))).,.))).,}}.})))))))))))))|((({.....))))|((((((((((((((({(((((((((((.....))))))).(((((....))))).....((((((((.....((((((((((...((.(((((.((({{{,........,{{{{.{..(((((((((.((((((((....)),.}))))).((({((({{{,....}))}),))))................)))).)))))......)))))}).))).))))).)).)))))))))).....))))))))..,{{.(((.,(((.(((((,,,,..{{{{...))))...))))).))}..))).}}}))))},.........,,{{.{(.......},.)).))))))).)))))))))}))}}|(((((.((((((((((((((..((((((((((...(((....))).))))))))))..(((((((((((((((((((((.(........).)))))))))))....))))}..,))))).))))))))))))).))))),((((((((..(((..(((((({.{{...}).)).))))).)))..))),,))))}))))))))))))).....))))...}))),.,,||||.......(((({..{|.,((({.(((({{{..(((((({.,.(((((((.(((({{...(((((((((...((((((((.,||||....(((((......)}}))){||,((||||}.})),)}),}},((((((((..(((((((((({..............{{(({{||,||,,{(,{,{{{{{,,..,({..,,,}|,||,.}||||.||,,||.{(((((.,,.,|||,,{((((...)))))...,|,,,)}||))))}}}.))))).))))...))))))))))))).)))..))))))))).)))))).,,((,.....{{|,((((((.(((((.({,.,..(((({.((({..((({,,|,{{((((.((.((.{((....))}.)).)).)))))),)))))))),}.)))}(((((((((..((,.(((,...,))).,))..)))))...)))).,.)).))))).}))))),|||....}},,.....||||....,)))))))....,))))))).))),.})))...)))),,))...})))).,,|......(((((.{,.....,,.)))))...,,...
Back