Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001414515.1

Sequence Length

2741 nt

GC Content

0.6023

GCUCUGGGUUGUGGGAGUUGGGGAGCUGCUCCGGCUUCGGCGCGGAGGGGCGGCGGCCGGGGAGGCGGCGGCGGCGGCAGGUAGCACUGGCUGUAUCCUUGAACUUGAGAACAUUCCUCCGGCUUCAACCCCACAGCAAUGGGAAAGUGGACCUCAGCUUACCCAACAUUGGUAUCAAGCGGGCCUGGGAUGUGGCCAGGCUUCAGUCACUGGACACAAGCUUUCUGGAGCAAGGUGAUGUCACAACACCCACCUCAGAGCAAGUGGAGAAGCUAAAGGAGGUUGCAGGCUUGCCUGACGACUGUGCUGUCACCGAGCGCCUGGCUGUGCUGGCCUUUCUUUACUUAUACCUGUCCAUCUGCCGGAAGCAGAGGGCCCUGCCGAGCCUGGAUAUCGUAGUGUGGUCGGAGCUGCCCCCCGGGGCGGGCUUGGGCUCCAGCGCCGCCUACUCGGUGUGUCUGGCAGCAGCCCUCCUGACUGUGUGCGAGGAGAUCCCAAACCCGCUGAAGGACGGGGAUUGCGUCAACAGGUGGACCAAGGAGGAUUUGGAGCUAAUUAACAAGUGGGCCUUCCAAGGGGAGAGAAUGAUUCACGGGAACCCCUCCGGAGUGGACAAUGCUGUCAGCACCUGGGGAGGAGCCCUCCGAUACCAUCAAGGGAAGAUUUCAUCCUUAAAGAGGUCGCCAGCUCUCCAGAUCCUGCUGACCAACACCAAAGUCCCUCGCAAUACCAGGGCCCUUGUGGCUGGCGUCAGAAACAGGCUGCUCAAGUUCCCAGAGAUCGUGGCCCCCCUCCUGACCUCAAUAGAUGCCAUCUCCCUGGAGUGUGAGCGCGUGCUGGGAGAGAUGGGGGAAGCCCCAGCCCCGGAGCAGUACCUCGUGCUGGAAGAGCUCAUUGACAUGAACCAGCACCAUCUGAAUGCCCUCGGCGUGGGCCACGCCUCUCUGGACCAGCUCUGCCAGGUGACCAGGGCCCGCGGACUUCACAGCAAGCUGACUGGCGCAGGCGGUGGUGGCUGUGGCAUCACACUCCUCAAGCCAGGGCUGGAGCAGCCAGAAGUGGAGGCCACGAAGCAGGCCCUGACCAGCUGUGGCUUUGACUGCUUGGAAACCAGCAUCGGUGCCCCCGGCGUCUCCAUCCACUCAGCCACCUCCCUGGACAGCCGAGUCCAGCAAGCCCUGGAUGGCCUCUGAGAGGAGCCCACGACACUGCAGCCCCACCCAGAUGCCCCUUUCUGGAUUAUUCUGGGGGCUGCAGUUCGACUCUGUGCUGGCCAGCGAGCGCCCAGCUCCUGACACUGCUGGAGAGGCCCCAGCCGCUUGGCGAUGCCAGCCAAGCUCUGCAGUCCCAGCGGUGGGACCUAGGGAGGCAUGGUCUGCCCUCUGCAUCCUCUGGAGCCAGCCGAGCAGGAGGCCUAGGAGGGUCCUCUGAGACUCCAGACCUGAGGCGAGAAGGGCUGCUUCCCUGAAGCUCCCACAGUCCCAUCUGCUUCAGGCCCCCGCCUUGGCCUGUGUUCUUCCUGGCCGCCUGGGUCCAAUGCUCAGGUGCUGGGGCCUGGUUCCCGGAGAAGUGUGCCUUCUCUCUCCCUUUUCAGGGACCGCCCCCUGUCUCUCAGGGCCAGGCCUCUCCCUCCUCCAGGAAGCCUUCCCCUACCCCUUGUCGCCCCUCCCUCCCAGAGCACCUGCUGUCUGGGUGGCUCACUCAGCACUUGGUGUGGCCUUCCCUUCUACCUAGCGGGAUGGGGCUCCCCCAGGGGCUGUCCCGGAGGCGGUGGGCCUGGUUAAAUAAGGCAGGGUUUAUAUGCACUUUCUUCCGAUCUGUACCUGAGAGGUUUGUGGAAAAGAUGGCAAAUGGGGAAUAAAAAGAUUUUGUGUCAACAGUAGAGACUCCAGGCCACCAGCACCUCCCUCUGUCCCUGUCCCCUCUCCAGCUGUUUCCUCCAUGGAGCUCUUCAGCAAUGGAGGGAAAUAGGGUUUGGGGUCACUUUGUUGUGCGUCUUGGGGAUGAGGUGGCUUUUCCCAGAUGGCCCUUGCUGGAGAGGGACUGGGACACGGCUCUCAGUCCAUCAGCACAACUCUAGGCUGCUGCUGCGGAGGGAGAAGUUGAGCUUCCUAGCUCCAGAAUCACAAGCACCCACGAGAGCACAGACCUGUGUAAGACAGGAAAGCAGAACCUGCCAUCGCUCCUGGGGCGCGCCUUCCUUUCUGAAAUGAACUGGCUGGAUGGAGAAAACAGACUCAAAUGUUCUGGCCCGGGUGCCUGGCACUCCCCACCCCCGCCCCCCACCGGCCCUAUUUGAACUUUAUAUUGCAGUCAGCUUGGUGCUUUCCGAAAUGCCAUUAGCCAUCAGGAAACCCUUGUAGUUGGUGCCUUGCCAGCCAGAACCUCUGGGACCCACGGACCUGCAAAGAGGCCGAGUGGAAAGGUGGGGGCCGGCGCAGGGAUUUCAGGAUGAGGUGAAAGCGAUUCAGUGCGCGUCUGCCCUUGGCCACUAGGGGGCAGCUGGCGGCCUUCCCUGCUGUUGUCUUCCUGCAGGGUGAGAGGAGCAGGAGCCGAGCUCCACCCCCACGCCAGCCUUGGGCCCGGCCUGGGAUCACUGCUGGGAACGUGAGAGUGAAGGGAGGACGCCUACCCCAGCUUAACUUGUAGAAAUGGCCCCAGAUCACUGAUGGCUGUUCCCUGCCCCUUCCCUUCAAAACACAACGCAUAAAGCAGUAAUACUAAUUAAUACUGAACGCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1165.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1212.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 604.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((..(((((((((((((..((((((..(((..(((((((((((((((((.((((((((((.(((((.((((.(.((..((((((((((....(((......)))....((((...(((.((((..(((((((..((((.((((........)))).))))....(((..(((...(((((((...(((((((..(((((((((.(((.......((((...((((....(((((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((......))))....)))))))))).(((......))).((..((((((((((.(((((....................((((.(((((.....)))))((((((((....((((((((((((.((((.((.(((.((((...((((((.....))))))...)))).))))))))))))))).((((((..(((((((((((...((((((((((.((((((....((......))...)))))).........((((.....((.(((((((((((..........(((.(((((((...(((((..(((...(((..(((..((.((((((.(((((((....))))..))))))))).))..))).......((.....)))))...))).)))))...))))..))).)))))))))))))).))......))))......)))))).))))))))).....).)))))..))))))..(((((((.....((..(((((((.((((((((..((..((....))..))...((((((((((((..(((....)))..))))).)))))))(((....))).(((..((.(((.......(((((((......((((....)))).)))))))........)))))..)))..))))))))..))))))))))))).)))))))))...))))))))..))))....))))))))))...))))).)).)))))))..))))))))))).))))..))))))))))))))))..(((....))).)))))))...))))))))))))))))))))..))))..))).))))..))))..))))))..))).)))).)).........))).))))))))).).)))..((((((......))))))..((((...)))).)))).(((.(((((((((((..(((((........))))).........)))))))))))))).)))))))))))))))).))).)))))))))).)))...))))))((((((((((.(((((((.......)))))))......((((((....))))))(((((((.(((.((.....))..))).))).)))).(((((..(((((..(((((.(((.(((...((((......))))((((((((.(((.((((((((((...)))))......)).))).)))))))))))..))).))).))))).)))))...))))).((((((((.....)))))))))))))))))).((((((((...(((((((.(((((((.((((...((((((.....((((((((.....((((((((((...((.(((((.(((((((..........(((.(..(((((((((.((((((((....))..)))))).((((((((........)))).))))................)))).)))))..)...))))))).))).))))).)).)))))))))).....))))))))(((((.(((..(((.(((((......((((...))))...))))).)))..))).)))))..((((((...))))))(.(((((((((.((....(((((.(((((..((((((.((((((.(((((.((((((((..((((((((((...(((....))).))))))))))..(((((((((((((((((((((.(........).)))))))))))....)))))...))))).))))))))))))).)))))).(((((((..(((..(((((((.((...)).)).))))).)))..))).))))(((((....)))))..(((((.(..((.((((.(.((((.....(((((.....)))))...((((...))))....))))))))))).((((((...(((((((((...((((((((..((((....(((((......).))))(((.((...)).))).))))...((((((((..(((((((((((..............((((((.((..((((......))))..)).(((((((.((.(((....))).)).)))))))((.((....(((((...)))))....)).))..)))))))).))))).))))...))))))))))))).)))..))))))))).))))))...).)))))((((.((...........))))))))))))..))))).))))))).))))))))).))))))).)))).))))))))))(((((...)))))...((((.(((.(((...)))..))).))))..)))).))))))))(((....((((((((((..((........)).......((((.(((((((.(((....)))..)))))))..))))..))))))))))...)))...((......(((((.((.....)).)))))...))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

{({.((.(((((((((((((((..((((((..(((..{((((((((({{{((((.{(((((((((.(((((.((((.(.((..((((((((((..,,({{......|||.....,,|||,(((.((((..(((((((..((((.((((......,.)))).))))....((({.,((...(((((((...(((((((..(((((((((.((((......,{{{...,(({...,(((((((((((.(({(((((((((.((((((.....((((......))))....)))))))))).{{(,,,,,,|||,((..{((((((((.(.(((((..........,,,...(((((...{{((((((..((({(((((((((.,,.(({.({(({{{(,{({({((({(({(((((((((..,}),}}}),.,}}|||},|,|))))}}}}.,))))),}}}))}|{{{|,,,.,||}.}}{{{(((((((.((({{{...,(({,,...)).,}))}}}},.,,,....((((.....((.(((((((((((..........(((.(((((((...{(({||,((,...,||..(((..((.((((((.(((((((....))))..))))))))).))..))),{{....,,.....}))}...}}}}.)))))...)))),,))).)))))))))))))).))......))))...}}})))))),.}}}))))))))))))..))))),..})}.))))).|,...,}},..(((((((.((((((((..,...,{....|,..||,.,((((((((((((.,(({...,))}..))))).)))))))(((...,))).(({..((.(((.......(((((((......{{,..,...},,.)))))))....,...)))})..)))).))))))))..))))))).))))).).)))))))).,..))(({.(({.......|.|,..}))))}.}}))),)}})))))))..))))))))))).)),)...,})))))))))))))..(((....))).)))))))...))))))))))))))))))))..))))..))}.)))...))))..))))))..))).)))).)).........))).))))))))).).))),.((((((......)))))),,{(((,..}})),)))).(((.(((((((((((..(((((....,,..,}})).....,,}})))))))))))))).)))))))))))))})),})).))))))))).......(((((.{.,.,,))))).(((((((.......))))))){({,,.{(((((((((((({{,,(((((,((((.....)))))))}},.||{{{{{({(((((,,(((((.,(((((.(((.(((...((((......))))((((((((.(((.((((((((((...)))))......)).))).)))))))))))..))).))).))))).)))))..,|||||,{(({((((,,...}}}}}||||||||||||||||||||||||,,{..{{.|(((((((.((((...((((||.....((((((((.....((((((((((...((.(((((.((({{{,........,{{{{.{..(((((((((.((((((((....)),.}))))).((({((({{{,....}))}),))))................)))).)))))......)))))}).))).))))).)).)))))))))).....))))))))..{{{.(((.,(((.(((((,,,,..{{{{...))))...})))).))}..))).}}))}},{{{{{....,})}}}{.(((((((((.((....(((((.(((((.,((((((,((((((.((((((((((((((..((((((((((...(((....))).))))))))))..(((((((((((((((((((((.(........).)))))))))))....))))}..,))))).))))))))))))).)))))}.{((({{(||{{{..((((({,.{{...}},)).})})).)))}})))..||,(((((....)))))..{{{{{.,..((.((((.(.((((.....(((((.....)))))...((((...))))....))))})))))).((((((...(((((((((...((((((((..{(,{....(({{{......)}}))}{,{.(({{{{,.,))}))),,,.((((((((..(((((((((((..............(((((({(.{{..((.{.{((((....,({.....)}.,}..)))}},}),.}}.|{{{((,...,}}}}}|((({...)))))....,,..)),}))))))).))))).))))...))))))))))))).)))..))))))))).))))))...|,|}}}},,{{}||..,{{((({{,|,,.}},)))))}}))))).))))))).))))))))).}}})))).)))).))))))))))(((((...)))))..,||{{,{((,(({...)))..))).)))).,))))))))))},},}}))),((((((((((..((........)).......((((.(((((((.(((....)))..)))))))..))))..))))))))))...)))))).))...}}|((((.,,.....,,.))))}........