Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001463.4
Sequence Length
2637 nt
GC Content
0.4414
ACUUGCAGCGGGGGAGGCGGAGACGGCGGAGCGGGCCUUUUGGCGUCCACUGCGCGGCUGCACCCUGCCCCAUCCUGCCGGGAUCAUGGUCUGCGGCAGCCCGGGAGGGAUGCUGCUGCUGCGGGCCGGGCUGCUUGCCCUGGCUGCUCUCUGCCUGCUCCGGGUGCCCGGGGCUCGGGCUGCAGCCUGUGAGCCCGUCCGCAUCCCCCUGUGCAAGUCCCUGCCCUGGAACAUGACUAAGAUGCCCAACCACCUGCACCACAGCACUCAGGCCAACGCCAUCCUGGCCAUCGAGCAGUUCGAAGGUCUGCUGGGCACCCACUGCAGCCCCGAUCUGCUCUUCUUCCUCUGUGCCAUGUACGCGCCCAUCUGCACCAUUGACUUCCAGCACGAGCCCAUCAAGCCCUGUAAGUCUGUGUGCGAGCGGGCCCGGCAGGGCUGUGAGCCCAUACUCAUCAAGUACCGCCACUCGUGGCCGGAGAACCUGGCCUGCGAGGAGCUGCCAGUGUACGACAGGGGCGUGUGCAUCUCUCCCGAGGCCAUCGUUACUGCGGACGGAGCUGAUUUUCCUAUGGAUUCUAGUAACGGAAACUGUAGAGGGGCAAGCAGUGAACGCUGUAAAUGUAAGCCUAUUAGAGCUACACAGAAGACCUAUUUCCGGAACAAUUACAACUAUGUCAUUCGGGCUAAAGUUAAAGAGAUAAAGACUAAGUGCCAUGAUGUGACUGCAGUAGUGGAGGUGAAGGAGAUUCUAAAGUCCUCUCUGGUAAACAUUCCACGGGACACUGUCAACCUCUAUACCAGCUCUGGCUGCCUCUGCCCUCCACUUAAUGUUAAUGAGGAAUAUAUCAUCAUGGGCUAUGAAGAUGAGGAACGUUCCAGAUUACUCUUGGUGGAAGGCUCUAUAGCUGAGAAGUGGAAGGAUCGACUCGGUAAAAAAGUUAAGCGCUGGGAUAUGAAGCUUCGUCAUCUUGGACUCAGUAAAAGUGAUUCUAGCAAUAGUGAUUCCACUCAGAGUCAGAAGUCUGGCAGGAACUCGAACCCCCGGCAAGCACGCAACUAAAUCCCGAAAUACAAAAAGUAACACAGUGGACUUCCUAUUAAGACUUACUUGCAUUGCUGGACUAGCAAAGGAAAAUUGCACUAUUGCACAUCAUAUUCUAUUGUUUACUAUAAAAAUCAUGUGAUAACUGAUUAUUACUUCUGUUUCUCUUUUGGUUUCUGCUUCUCUCUUCUCUCAACCCCUUUGUAAUGGUUUGGGGGCAGACUCUUAAGUAUAUUGUGAGUUUUCUAUUUCACUAAUCAUGAGAAAAACUGUUCUUUUGCAAUAAUAAUAAAUUAAACAUGCUGUUACCAGAGCCUCUUUGCUGGAGUCUCCAGAUGUUAAUUUACUUUCUGCACCCCAAUUGGGAAUGCAAUAUUGGAUGAAAAGAGAGGUUUCUGGUAUUCACAGAAAGCUAGAUAUGCCUUAAAACAUACUCUGCCGAUCUAAUUACAGCCUUAUUUUUGUAUGCCUUUUGGGCAUUCUCCUCAUGCUUAGAAAGUUCCAAAUGUUUAUAAAGGUAAAAUGGCAGUUUGAAGUCAAAUGUCACAUAGGCAAAGCAAUCAAGCACCAGGAAGUGUUUAUGAGGAAACAACACCCAAGAUGAAUUAUUUUUGAGACUGUCAGGAAGUAAAAUAAAUAGGAGCUUAAGAAAGAACAUUUUGCCUGAUUGAGAAGCACAACUGAAACCAGUAGCCGCUGGGGUGUUAAUGGUAGCAUUCUUCUUUUGGCAAUACAUUUGAUUUGUUCAUGAAUAUAUUAAUCAGCAUUAGAGAAAUGAAUUAUAACUAGACAUCUGCUGUUAUCACCAUAGUUUUGUUUAAUUUGCUUCCUUUUAAAUAAACCCAUUGGUGAAAGUCUUUUUUUUUCUCUUCUUUUAAAAUAAAUCAGAAUUGCCGUAUUGACCAGGAAAAGAUUAUGUAUGCACGUGCACCAGGGUUAGUUUUUAAAAGUACAUGGCUCCAUAAAAAUGCUGUAGAUUACAGAGUGAUAAAAUAUGCAGGUUUUUUUGUUUUUGUUUUUUCUGUUGUGUGUGUGUCUGUAUUUGUGUACAUGUGUGUCCUUGCACUCACACCCAAGGUGGAUUAAAAUACAGGCCUGCAAACUGGCCUGCACUUUAUCAUUUGGAUUUGUGCUGCUUAAUGCUCAGCGAAAAAUGUCUAGUAAAAUGAAUUAUGGUUGUCAGGAGAGAGGUUAUUUCGACUUUUGAACCAAUUGCACAUUUCUCAUUACCCAAGCUGUGGUGAGAUCCCAGGGGCUGUGGUGAACAAAUGAUGCUUUUAUAGAUGGUCCCUAGCUUACAAUGAUUCAAUUUACAAUGCUUCAAUUUAACAAUUUGUUGACUUACAAUGGGUUUAUCAGGAUGUAACCCAAUGCAUUUCAACUUACGAUAUUUUCAGUUUCGAAUGGGUUUAUCCAGAUGUAACCCCAUCGUAAAUGGCGGAGCAUCUGUACUUCCUUCCUCUGGCAGAGUUCCUUAGAGCCUGUGCCAAUUACUUGAAAGUUUCAUUCUCUGCCAUUUACAUGUGUGCUAUUAGUAGAACCAAAUUUCUAAGCUGUGGCGUGCUGAAAAUAAAAUGCUUAUGAAGCAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-782.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -834.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 745.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((..((((((.((((.....((((.(.(.(((....))).).).))))(((((.(((((((.(((....((((((((((....)))).))))))...))))))).))).))))).((((((((((((((..((((.(((........))).(((((((....)))))))..)))).))))))))...)))))))))).))))))..)))))))....((...(((.(((...(((((.((...........(((((((((.(((.(((((.........)))))...((((((.(((..((.(((((((....)))..)))))).))).)))))).....(((((((....(((((((((((.((.((((.((.(((((.(((..(...........)..))).))))).))))))))..))))..(((((((((...))))).((((.....))))..((..(((((((((((.....)))))).)))))..)))))).)))))))))))))).((((((((((((((.((.(((((((((..((((((((..(((((.....((((((.((((......)))).))))))(((((((.((((((((((...((((((((.(((....((((((((.((.((.(((.((((((...((..((((.(((..(((((((((((...((((...........))))....))).))).)))))...))).))))..))...))))))......(((((...(((........))).)))))................(((((...((((((....(((.((((((....((.(((..(((((...(((((.(.(....).).))))).....)))))..)))))....)))))).))).........((((((((((((.((((...)))).....(((.(((((.((((((((((.............((((.(((.......))).))))((((((((((((((..(((((........)))))..)))).))......((((((((((.........................(((((...(((((.....))))).....)))))))).)))))))....((((.......))))))))))))...)))))))))).)))))))).....(((((.((....)))))))....))))))))))))...((((((((((((((((((.(((((((..((........)).))))))).)))..............(((((........))))).(((((.(..((((..((((((((((((((((.(((((.........((((((((((((((((((((.(((((...)))))................((((.(((....)))..)))).............))))))).)))))))).....(((..(.((((((((........)))).)))).)..)))....))))).))))).)))).)))..(((((((((.......)))))))))(((((((...(((((((..........(((((((((.........((((.....))))..((......))..((((((..((((((..((........))....))))))..))))))))))))))).........))))))))))))))..)))))))))))))..)))))))))))))).....))))))))))))))))))))).))..)))))))..)))......)))..))))))))...)))))))..((((((......(((.((((((((..((..((((..((((..((((..(((((((......(((((..(((((((...((((((((..(((((..(((((...(((........(((.(((((....((((...((....))...))))....))))).)))........).))...))))))))))....)))))))).....(((...........)))))))))))))))))))))).....))))))))..))))..))..)))))))).)))..)))))).(((((....)))))))).)))))))((((......(((((.(((..((((...((((((........))))))...))))))))))))....)))).((.....)))))))......))))).))).)))))....))))..)).)))))))((((.............))))...))))))).(((((((((.......))))))))).....))))))))))))..........)))))))...))).)))...)).....................(((((((..((((((...))))))........(((((((((.(((((.((((((......(((((((...((.....))))))..)))))))))))))).)))).)))))....(((((((((((((.......((((.(......(((((.(((((....))).)).))))).......).))))......)))))))))))))..(((((((((...(((((......)))))....))))))))).................)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((..((((((.(((({...{(((({(,(,(((....))).,,}.||||(((((.(((((((.(((....((((((((((....)))).))))))...))))))).))).))))).||||(((((((,,,..||||.|||..,.,,,,))).(((((((....))))))).,||||,}||}}}}),.,)))))))))).))))))..)))))))....((...(((.(((...(((((.((...........(((((((((.(((.(((((.........)))))...((((((.(((..((.(((({((....))}..)))))).))).)))))).....(((((((....(((((((((((.{{{((({{({.(((((.(((,..{.,,...,,..}},})).))))),}}))))),}.))))..((({(((({...})))).{(({.....)))}..((..(((((((((((.....)))))).)))))..)))))).)))))))))))))).(((((({(((((((.((,((((((((({{{((((.((((((((..,,{{({{({{.,{{{......)))).,|||||((({{,..((((({...,||||.,{(((..(((....{|{|,}||,,{{,{{{...((((((...((..{(((.(((..(((((((((((...((((...........))))....))).))).)))))...})).)))}..))...))))))))}...||{||}}.{||}..}}}},,}),))},)})))),..))))))),.)))))))}.}))}....(((.((((((....(,{(((..(((((...(((((.(.,....,.}.))))).....)))))..)))))....)))))).))),{{,{{{{.(((((({(((((.{{{{...}}}}.....{(,,(((((.((((((((((.{,,..{{{....{,||},{{}|...,,}}},}}},(((((((((,{(((..{{{{{,{,.....)))))..))}}.,}......{((((({(({.{,..........,,....,,....{{{{,...{((((....,}}}}}..}..}}})}))).)))))))....|||{.,.....,}|)})))))))...)))))))))).)))))))).,,,.{((((.((....))))))).}},)))))})))))).,{((((({{((((((((,((.(((((({.,({,,...,..)),}}))))).|||.,..,,,,....,,(((((.,......})))).{{{{(.{,{{{{,,.((((((({{{{{,,,,.,,............{((({(((((((((((((({.(((({...)))))..,,...,{{|,....((((.(((....)))..))))....,}},,....)))))))}}})))))).....|||,.|||{||{{{|..,.....}}}}.))))},..}}}....||||}.||||,.}}))||||.{({((((({{.......}})}}}))}|{{{{||,,,{{{{|||,,,,,.....((((((((({....,,,,||||.....})}}..{{..,,{{||,{,.{{,.}|||||,|,.{{........})|,,,|,,..,..|||}}||}}}}}))),,,,.,...,}}}})}))))))}..)))))))))}))).}}))}},))))))))..,,,))))||||{|||{}||||(((((..{{((((((((((((.((((((((((((,(((((((((((..{((,..........,.....(((((((.{((..,,{({.{({{,...,,})}},((((((..{.(((((((((...........))))))))),,...)))))}..},...,}}.})))))).,,},,..)))))))))))......)))))).)))))).))))..}))}.})).)}}))))),||||||{{,{,,,..||.,,.}}))},........,)))))))}..||||||||||{{{,..,||||||,..}}}))}}})}}},,}}}}}},||||||{|||,{((({..,.))))).|,{{|,...,)))).}}|||({|,||||||.,{{|...((((((........)))))),}.))))))}}}}}},,,,}||||||,....)),})))}......,}},}))}..})))...,))))}.)).)))))))(((,...{{{,...,}}))))...})))))).(((((((((.......))))))))).....))))))))))))..........)))))))...))).)))...)).....................(((((((..,{{{{,...||||||....,,.{((((((((,.,,{||.||||||.,|.,,{||,||....,.{{{{{{{{||...|,|||||}||||,,.,,,),))}))}}},(((((((((((((.{.....(((({.......(((((.(((((....)))}}).))))).......),))))...},.)))))))))))))..,..{(((((.{{(((((......))))}.,}})))))}.))}}}}}}}},,,}},...)))))))....
Back