Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001517.5
Sequence Length
1712 nt
GC Content
0.5683
ACUCCUCCCCUUACCUCCCUUCUCUUCUGAAUUCUCCAUUCUGGGCUCUUGCCUGUGAAAUCUUUCUUUGCUUUCCCCAUCUUUUCCUCGCAUUUUUUCACCAUCUUUCCCUCAAUCUCCAGGAGCCAAUGCGAGACUUUGGCUCCGAUUAAGCGACGGCCCGAGACUCGGGGUGCGCGAGGAGGAUCGACAGAGUGGUGAUGGAGAGCACCCCUUCAAGGGGACUGAACCGAGUACACCUACAAUGCAGGAAUCUGCAGGAAUUCUUAGGGGGCCUGAGCCCUGGGGUAUUGGACCGAUUGUAUGGGCACCCUGCCACAUGUCUGGCUGUCUUCAGGGAGCUCCCAUCCUUGGCUAAGAACUGGGUGAUGCGGAUGCUCUUUCUGGAGCAGCCUUUGCCACAGGCUGCUGUAGCUCUGUGGGUAAAGAAGGAAUUCAGCAAGGCUCAGGAGGAAAGUACAGGGCUGCUGAGCGGCCUCCGGAUCUGGCACACACAGCUGCUCCCAGGCGGGCUCCAGGGCCUCAUCCUCAACCCCAUUUUCCGCCAGAACCUCCGCAUUGCCCUUCUGGGUGGGGGGAAGGCCUGGUCUGAUGACACAAGUCAGCUGGGACCAGACAAGCAUGCCCGGGACGUUCCCUCCCUUGACAAGUACGCCGAGGAGCGAUGGGAGGUGGUCUUGCACUUCAUGGUGGGCUCCCCCAGUGCAGCUGUCAGCCAGGACUUGGCUCAGCUCCUCAGCCAGGCUGGGCUCAUGAAGAGUACUGAACCUGGAGAGCCGCCCUGCAUUACUUCCGCUGGCUUCCAGUUCCUGUUGCUGGACACCCCGGCUCAGCUCUGGUACUUUAUGUUGCAGUAUUUGCAGACAGCCCAGAGCCGGGGCAUGGACCUGGUAGAGAUUCUCUCCUUCCUCUUCCAGCUCAGCUUCUCUACUCUGGGCAAGGAUUACUCUGUGGAAGGUAUGAGUGAUUCUCUGUUGAACUUCCUGCAACAUCUGCGUGAGUUUGGGCUUGUUUUCCAGAGGAAGAGGAAAUCUCGGCGUUACUACCCCACACGCCUGGCCAUCAAUCUCUCAUCAGGUGUCUCUGGAGCUGGGGGCACUGUGCAUCAGCCAGGUUUCAUUGUCGUGGAAACCAAUUACCGACUGUAUGCCUACACGGAGUCGGAGCUGCAGAUUGCCCUCAUUGCCCUCUUCUCUGAGAUGCUCUAUCGGUUCCCCAACAUGGUGGUGGCGCAGGUGACCCGGGAGAGUGUGCAGCAGGCAAUCGCCAGUGGCAUCACAGCCCAGCAGAUAAUCCAUUUCCUAAGGACAAGAGCCCACCCAGUGAUGCUCAAACAGACACCUGUGCUGCCCCCCACCAUCACCGACCAGAUCCGGCUCUGGGAGCUGGAAAGGGACAGACUCCGGUUCACUGAGGGUGUCCUGUAUAACCAGUUCCUGUCGCAAGUGGACUUUGAGCUGCUGCUGGCCCACGCGCGGGAGCUGGGCGUGCUCGUGUUCGAGAACUCGGCCAAGCGGCUCAUGGUGGUGACCCCGGCCGGGCACAGCGACGUCAAGCGCUUUUGGAAGCGGCAGAAACAUAGCUCCUGAGAGCGCGGGACUUGGACACGGACCUCGGCGGGCGGGACUGGGCGGGGCGGGGCAUCAGAACUCAGGUGUUUUUUAUUUACGCGUCAGGGCUUUUCUUGUUUAAUAAAGUUAUGAUAGCUAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-679.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -707.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 488.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........(((((((((.((....(((.(((.(((.((((((((.(((((...((((.(((((((((((...(((((..........((.((((.(((((((((.((((((...(((..((((((((.........))))))))......(((.((.(((((...))))).))))))))))))...)).))).)))))).)))).)).(((((...)))))(((......)))...((((...(((((....)))))........))))((((....)))))))))....((((.......(((((((...)))).)))))))(((((.(((((((((((((((((((((((.......))))).)))).))).)))))..)))))))))))....((((((((((...)))).))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).))).)))((((((...)))))).........(((.......)))(((((..((((.(((.((((((((..(((....((((((......((((((.(........)...)))))))))))))))))))(((((((..((((....))))....)))))))............((((...))))...))))...))).))))..))))))).)))))))))....(((((....((.((....)))))))))(((((((((((.((.(((((((.((...)).))))))))).))))((.(((((((.((((..((((.(..(((((((((.(((.(((((((.((((((.(((((.(((((((.....(((((((.....(((..((.....))..)))(((((((.(((((.(((((((((((...(((((((((((((((((....((((((((((((.((((((..........))))))..(((((((((............)))))))))((((..((((..((((.(((.((.....)))))))))...))))..)))))))))))))).....(((((...........))))).)).....))))))).)))))))(((((.((((..(((((((.((.(((.((((..((((((.........)))))).....((((((.(.((....)).).)))))).)))).....)))...)).)))))))..)))))))))......(((((........((((((((((((((((((....(((...((((((.((.(((....))).)).))).)))..))).........(((.........)))...((((.(((...)))..)))).......)))))))))))))....))))).))))))))..)))))))))))(((((((...((((((..(((.(.....).)))..))))))......))))))))))))))))))).(((.(((((((((..((((((((((.(((...))).)))))((((....)))).....)))))))))))))).)))((.....)))))))))..)))))))(((..((((((((((.(((............))).))))))))))..)))..))).)))))....))).))))))).))))))))))))..).)))).......((((.........)))).)))).))))))).))..............)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..........,{(((((((.((.,,,(((.(({.(((.((((((((.(((((...((((.(((((((((((...((((,....,,,,,.((.((((.(((((((((,({,{((..{((({.((((((((.,.....,.))))))))......(((.((.(((((...))))).))))),,))))),..)).)))})))))).)))).)).(((((...))))){((......))}...{{,,...{((((....)))))}},,....},}|((((....)))))))))....{{,,......,(((((({...}))).))))}),(((((.(((((((((((((((((((((((.......))))).)))).))).))))}..)))))))))))....((((((((((...)))).))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).})).}}|(((((({{,{||(({,,,{{..,,{{{.....,||||({||,..(({({{{|..,((({,...,||....{||{{,...,,|(|{{{{,{,,,.{..,|{,,}}}})))))))}))}}))}(((((((..((((....))))..,.)))))))...,}},.}})}((((...}))),,|||||....,,.}}})}}))))})).))))))))}....((((,...,((.((,...)))))))))|((((((((((,{{.(((((((.((...}}.))))))))).)))|({.(((((({.((({..((((.(..(((((((((.{{{.(((((((.(((((({(((((,({{((((,....((((((,,,(({({((,.,....((((((({...,}|||||}}|{||||||}{((((,..(((.(((({((((..{,,,...,{{||||{||,|{||{|..,,....,,)))))).{(((((((((.,{{.....}},))))))))))|||,.{{{,.,,|||||}},|,}}}}.)))}}||||,,,.,,.{||,,||||||}|||,,,,,.((,((..,,,|{|,..,(((((((,,,,,,........,}}|||||{{{.((((..(((((((.((.(((,({((..((((((,,....,,,)))))).....((((((.(.((....)).).)))))).)}))},,}.)))...)).)))))))..)))}))))},))}}}}}||.,,,......,|||||||||{||||||....|||,..((((((.((.(((....))).)).))).))).}))}.,.,,},..}||.}}}||,..)))...||||,|{(...}}}..)))).....,.}))))))))))}},|,{||{|{{{{{{.{{{,.{|{|{{,,.{{(((((((...((((((..(((.(.....).)))..))))))......))))))}}|||||{..,|||,|,.{((((((({,,{(((((({((.{{|..,))),)))))((((....)))).....)))))})))))))}|)))}))),}}}})))))))..)})))))(((..((((((((((.(((............))).))))))))))..)))..))).,})},....))).))))))).))))))))))))..).))))....,,,||||,........}))),)))).})}}}}).}}........,,,..}))))))}....
Back