Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001552.3

Sequence Length

2205 nt

GC Content

0.6263

AGCCGCUCAGCCCCCUGCCCCUCGCCGCCCGCCGCCUGCCUGGGCCGGGCCGAGGAUGCGGCGCAGCGCCUCGGCGGCCAGGCUUGCUCCCCUCCGGCACGCCUGCUAACUUCCCCCGCUACGUCCCCGUUCGCCCGCCGGGCCGCCCCGUCUCCCCGCGCCCUCCGGGUCGGGUCCUCCAGGAGCGCCAGGCGCUGCCGCCGUGUGCCCUCCGCCGCUCGCCCGCGCGCCCGCGCUCCCCGCCUGCGCCCAGCGCCCCGCGCCCGCGCCCAGUCCUCGGGCGGUCAUGCUGCCCCUCUGCCUCGUGGCCGCCCUGCUGCUGGCCGCCGGGCCCGGGCCGAGCCUGGGCGACGAAGCCAUCCACUGCCCGCCCUGCUCCGAGGAGAAGCUGGCGCGCUGCCGCCCCCCCGUGGGCUGCGAGGAGCUGGUGCGAGAGCCGGGCUGCGGCUGUUGCGCCACUUGCGCCCUGGGCUUGGGGAUGCCCUGCGGGGUGUACACCCCCCGUUGCGGCUCGGGCCUGCGCUGCUACCCGCCCCGAGGGGUGGAGAAGCCCCUGCACACACUGAUGCACGGGCAAGGCGUGUGCAUGGAGCUGGCGGAGAUCGAGGCCAUCCAGGAAAGCCUGCAGCCCUCUGACAAGGACGAGGGUGACCACCCCAACAACAGCUUCAGCCCCUGUAGCGCCCAUGACCGCAGGUGCCUGCAGAAGCACUUCGCCAAAAUUCGAGACCGGAGCACCAGUGGGGGCAAGAUGAAGGUCAAUGGGGCGCCCCGGGAGGAUGCCCGGCCUGUGCCCCAGGGCUCCUGCCAGAGCGAGCUGCACCGGGCGCUGGAGCGGCUGGCCGCUUCACAGAGCCGCACCCACGAGGACCUCUACAUCAUCCCCAUCCCCAACUGCGACCGCAACGGCAACUUCCACCCCAAGCAGUGUCACCCAGCUCUGGAUGGGCAGCGUGGCAAGUGCUGGUGUGUGGACCGGAAGACGGGGGUGAAGCUUCCGGGGGGCCUGGAGCCAAAGGGGGAGCUGGACUGCCACCAGCUGGCUGACAGCUUUCGAGAGUGAGGCCUGCCAGCAGGCCAGGGACUCAGCGUCCCCUGCUACUCCUGUGCUCUGGAGGCUGCAGAGCUGACCCAGAGUGGAGUCUGAGUCUGAGUCCUGUCUCUGCCUGCGGCCCAGAAGUUUCCCUCAAAUGCGCGUGUGCACGUGUGCGUGUGCGUGCGUGUGUGUGUGUUUGUGAGCAUGGGUGUGCCCUUGGGGUAAGCCAGAGCCUGGGGUGUUCUCUUUGGUGUUACACAGCCCAAGAGGACUGAGACUGGCACUUAGCCCAAGAGGUCUGAGCCCUGGUGUGUUUCCAGAUCGAUCCUGGAUUCACUCACUCACUCAUUCCUUCACUCAUCCAGCCACCUAAAAACAUUUACUGACCAUGUACUACGUGCCAGCUCUAGUUUUCAGCCUUGGGAGGUUUUAUUCUGACUUCCUCUGAUUUUGGCAUGUGGAGACACUCCUAUAAGGAGAGUUCAAGCCUGUGGGAGUAGAAAAAUCUCAUUCCCAGAGUCAGAGGAGAAGAGACAUGUACCUUGACCAUCGUCCUUCCUCUCAAGCUAGCCAGAGGGUGGGAGCCUAAGGAAGCGUGGGGUAGCAGAUGGAGUAAUGGUCACGAGGUCCAGACCCACUCCCAAAGCUCAGACUUGCCAGGCUCCCUUUCUCUUCUUCCCCAGGUCCUUCCUUUAGGUCUGGUUGUUGCACCAUCUGCUUGGUUGGCUGGCAGCUGAGAGCCCUGCUGUGGGAGAGCGAAGGGGGUCAAAGGAAGACUUGAAGCACAGAGGGCUAGGGAGGUGGGGUACAUUUCUCUGAGCAGUCAGGGUGGGAAGAAAGAAUGCAAGAGUGGACUGAAUGUGCCUAAUGGAGAAGACCCACGUGCUAGGGGAUGAGGGGCUUCCUGGGUCCUGUUCCCUACCCCAUUUGUGGUCACAGCCAUGAAGUCACCGGGAUGAACCUAUCCUUCCAGUGGCUCGCUCCCUGUAGCUCUGCCUCCCUCUCCAUAUCUCCUUCCCCUACACCUCCCUCCCCACACCUCCCUACUCCCCUGGGCAUCUUCUGGCUUGACUGGAUGGAAGGAGACUUAGGAACCUACCAGUUGGCCAUGAUGUCUUUUCUUCUUUUUCUUUUUUUUAACAAAACAGAACAAAACCAAAAAAUGUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-958.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -993.59

Frequency: 0.0000

Diversity: 492.20

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((.(((.((.(((((..(((((..((((....))))))))))))))..))((.(((((.(((((((((.(((((.((((.......)))).)))))....((((((((((((((....)))..((((...)))).((((.(((((.((((.(((((.(((.(((((.....((.(((((.((((.(.(((((.((((((.((((((.((..((..(((((((.((.((((.((...((((...))))((((.(((((((.(((((....(((((((((((..((......))..)))))))))))....))))).)).))))).))))..((((..(((((....((.......))...))))).)))))).))))..)).))))))).))..((((((((.((((.(((((....((((((((.(((((.....))))).)))))))))))))))))))))...))))..))...)))))).))))))........)))))..).))))))))).)))))))))).)))))))))...(((((.(((((((.((..(((....))).)).))))))).)).)))(((((((...(((((....((((....))))..((((((..........))))))................))))).((..((((((.((((.((....)))).))))))))..)).))))))).......))))).)).))...)))))))).))).....((((..((((((((.(((((......)))))...)))))))).)))).))))).))).).))))).))))).))).))))))))((..(((((...(.((((((.((....)).........((((((((.((.....(((.(.(((((.(((((.(((((((((((..(((.((......)).)))..))))....)))).))))))))...))))).))))..)).))))))))(((((((((((.((..((((....((((((.(((((..(.((.((.((((((.....((((((....).)))))..)))))).))...)).).))))).))))))....)))).)).)))))))))))(((((((.(((.((((.(........).)))).)))..).)))))).)))))).).))))).........(((((((((((((((....)))))))))))))))(((.(((((((((.((.((((((.(..((((((.((((((((...((.(...((((((((.(((........))).))))))))).)).)))))..))).))))))(((..((((...(((.(((..(((((.......)))))..))))))....))))..)))...).)))))))))))....)))))).)))..........(((((((((((.........((((....((((((((.......))))))))))))..))))))))))).(((.(((((...))))).))).....((.((((((((((....))).))))))).))..((((((((((((((((...((((((((....((((((((((((.(((((((((((((.((((((((..(((((..((((.(.......(((((...((((..........)))).)))))...).))))..))).)))))))))).))))))......(((((.(((......)))))))).......((((......)))).)))))))...))))))(((......))).....)))))))))).)))).(((...((.((.(((.(((.(((((((((((((.......((((((....)))))).((((((..((((((..((((.(((......(((.((.((((....((((((.(((.((((((((.((((.((....)).))))))))))))...))).)).))))....))))..)).))).((((((....))))))..(((.((((.((.....)))))))))..))))))).))).))).)))))).............))).))))))))))..)))))).)).)).)))((((.((((((..(((((....))).....))..))))))))))...))))))))))))))))((((.((((.....)))).)))).....))............

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((,(({.((.(((((..(((((..((((....))))))))))))))..))((.(((((.(((((((((.(((((.((((.......)))).))))),,..((((((((((({((....}}}..((((...)))).(({(,(((((.((((.(((((.(((.(((((.....((.(((({{((((.(.(((((.((((((.({((((.{{.,{,..(((((((.((.((((.((...((((...))))((((.(((((((.(((((....(((((((((((..((......))..)))))))))))....))))).))}})))).))))..((((..(((((....,(.......,}...))))).)))))).))))..)).))))))).||..((((((((.((((.(((((....((((((((.(((((.....))))).)))))))))))))))))))))...))))..))...)))))).)))))).....,..)))))..).))))))))).)))))))))).))))))))).,.{(({(,(((((((.((..(((....))).)).))))))).)).))|(((((((...(((((....((((....))))..||||||.,........|,||||....,}}}........}}}}}.{(..(((((({(((,.{{....}}))}))})))))..)).))))))).......))))).)).))...)))))))).))).....((((..((((((((.(((((......)))))...)))))))).})}}.))))).))).).))))).))))).)))}})))))))((,.(({{({{{({,,(((({.{,,{,{|..,,,....((((((((.((.,,..,(({,.,,|||.{((,..,,(((((((({.{((,{(({{{.,.||{|,,..,)))}.,.))))})},)))))}.),))))}}})}..)).)))))))){|{{{{{((((,((,,(({(,,..((({(({(({((,{(.{{.,{,(((({{.,.|||||{{{..,,||},|||{{|,,,,)}))}}.||{{{}}}}}.))))}}....||||.}},))))}))}}||{{{{|||,{{{,(({{.|,|,,,.,,).))))})))}.).))))})})},)))})}),,)),,}}}....{{(((((((((((((....))))))))))))))}|||}|{{||||||}||.((((((.(,.((((((.((((((((...((.{,..((((((((.(({{,.....,))),))))))))}.)).)))))..))).))))))(((..((((...,{(.(((..(((((.......)))))..))),)}....))))..)))...,.}}}}}}))))),,..,,||||,|}}.,....,||.(((((((((((.........((((....((((((((.......))))))))))))..))))))))))).{({.(((((...))))).}}}...,.((.((((((((((....))).))))))).)).,{(((((((((((((((...((((((((....(((((((((((..(((((((((((((.((((((((..({(((..((((.,.,.....(((((...((((.......,..)))).)))))...,,))))..))).)})))))))).)))))}......(((((.(((......)))))))).....,,({{{......))))}))))}}|,{{|,,,}}|{{.}}},,}}))))).))))))))))}}}))..,,...((.((.(((.(((.(((((((((((((.......((((((....)))))).((((((..((((((..((((.(((......{,(,,,.{{((,,..((((((.(((.((((((((.{(((,((....)),))))))))))))...))).)).))))....}}}},.||{|||.((((,(,...,,))})}}}.))}||},{||,,..,,})).,.,..))))))).))).))).)))))).............))).))))))))))..))}))).)).)).,|{((({.((((((..(((((....))).....))..)))))))))))..)))))))))))))))}{(((.((({.....)))).))))......,....,,,)},..