Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001636.4
Sequence Length
1451 nt
GC Content
0.6072
CCUUUCGGUCCAGGCGGCGGCAGGGCUGAGCCAGCGACGCCCUCCAUUCACUCUCCGCGCCCGUUCUCCGGCUGUCCUCCCGUUCCGCUGCCCGCCCUGCCACCAUGACGGAACAGGCCAUCUCCUUCGCCAAAGACUUCUUGGCCGGAGGCAUCGCCGCCGCCAUCUCCAAGACGGCCGUGGCUCCGAUCGAGCGGGUCAAGCUGCUGCUGCAGGUCCAGCACGCCAGCAAGCAGAUCGCCGCCGACAAGCAGUACAAGGGCAUCGUGGACUGCAUUGUCCGCAUCCCCAAGGAGCAGGGCGUGCUGUCCUUCUGGAGGGGCAACCUUGCCAACGUCAUUCGCUACUUCCCCACUCAAGCCCUCAACUUCGCCUUCAAGGAUAAGUACAAGCAGAUCUUCCUGGGGGGCGUGGACAAGCACACGCAGUUCUGGAGGUACUUUGCGGGCAACCUGGCCUCCGGCGGUGCGGCCGGCGCGACCUCCCUCUGCUUCGUGUACCCGCUGGAUUUCGCCAGAACCCGCCUGGCAGCGGACGUGGGAAAGUCAGGCACAGAGCGCGAGUUCCGAGGCCUGGGAGACUGCCUGGUGAAGAUCACCAAGUCCGACGGCAUCCGGGGCCUGUACCAGGGCUUCAGUGUCUCCGUGCAGGGCAUCAUCAUCUACCGGGCGGCCUACUUCGGCGUGUACGAUACGGCCAAGGGCAUGCUCCCCGACCCCAAGAACACGCACAUCGUGGUGAGCUGGAUGAUCGCGCAGACCGUGACGGCCGUGGCCGGCGUGGUGUCCUACCCCUUCGACACGGUGCGGCGGCGCAUGAUGAUGCAGUCCGGGCGCAAAGGAGCUGACAUCAUGUACACGGGCACCGUCGACUGUUGGAGGAAGAUCUUCAGAGAUGAGGGGGGCAAGGCCUUCUUCAAGGGUGCGUGGUCCAACGUCCUGCGGGGCAUGGGGGGCGCCUUCGUGCUGGUCCUGUACGACGAGCUCAAGAAGGUGAUCUAAGGGCCGCGGCCUCCUCCACACACACACACACACCAGGGGAACCAAGAGAACCACGUAGAAUCCUCAACCGUGCGGACCAUCAACCUUCGAGAAAUUCCAGUUGUCUUUUUCCCAGCCGCAUCCUGCCUGUAGAUGGCCGGGGAAGGCUCUAGAAAAGGGGCGCAUUGCGAUCCAACCAUCGGCAGCCGAUUCCGUGUCUUGAUCACGGGGUGGGAGGGAACCGUGGCGUCCCUGCGUGGGGCCCAUGGGUGAGACACUCCAGUACUGAGACCUAGAGUCCAGAUGCUUGUAGGAGCCAAGUCGUGUUCUAAGUAUUUAUUUAAAACAAAAGAAUCACGUUUUCCCAUUUGUACUUCAGCGCUAGCCCCUGUUUUGCACAGCCGAGUACUGGCGAGUAUGUUCUAUGUUGGGCCUCCUGCUGCAAAACAAUAAACAGAGGACGCAGAGGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-563.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -589.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 279.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((((....((.(((((.((((((((...(((....(((...(((..((((((((........)))((.(((((.(((((((((...((...))...)).).)))))).(((((......((......)).....))))))))))))..(((((.(((.(((...))).))).)))))...((((.(((((((((.((((((((((......))))).).))))(((((((((((.((((....(((((.((.(.....).)).))))).((((((((.(((((.(((((....((((((((((((..((((((((((....))))..........(((.............)))...........))))))))))).)))))..)).....))))).))))).)))))))).....((((.(.((((((((......((((...)))))))))))).).))))..))))))))......)))))))..)).))))))).))))..(((((.......))))).))))).))))))..))).)))..((((((((((((((.((((((.(((...((((((((((...))))))........))))))).))))))(((.(.((((((.((.(((((.((((.(((.....(((((((..((((.(((..(((.(((((((...)))).)))))))))..((((((((.((((.....(((.(((...)))))).((.(((((((((((((..((.(((((((((((((((.(((.(((((..........)))))...))).))))((((((((...((((((.........))).))).)))))))).)))))...)))))).((.((((((......)))))))).((((((((((...)))))))))).)).)))))))))....)))).))))))..))))))))((((((..(((.(((......))).)))....)))))).........(((((((..((((((.(((..............((((((..((((.(((((((..((....))...)))).(((...((.........))...))).))).))))))))))((((...(((.(((.......))).)))...))))........((..(((...)))..))....(((((...)))))((((((.......)))))))))))))))..)))))))..(((.....))))))).))))))).....))).)))).))))))).)))))).).))).....)))))....))))))))).(((((......(((((...........))))).......)))))))))).)).)))))((((((((((((..(((..((((((((......)).))))))..)))))).))))))))).........))))..)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..((((.....((((((((((((...))))...((((..(((..,.....,.((((.((.(({{((((((.,(((((.(((((((((.({(((({,.,,.....))..))))}...,,(({{{(((((,{....}))))),)))))....(((((.(((.(((...))).))).)))))...{(((.((((((({,.((((((((((......))))).),}))){((((((((({{((((....(((({.({.{{....}.)}.})))).((((((((.(((((.(((((....((((((((((((..((((((((((....))))...,......{{{.............))}...........))))))))))),}))))..))....,))))).))))).)))))))),,.,.((((.{.((((((((......((((...})}})))))))).).)))),.))))))))......))))))}..)).))))))).)))},,|,..},....))..))))))))),,})))}{{{.((((..,..(((((((({....((((((.(((...((((((((((...))))))........)))}))).)))))),.....((((((.((.(((((.((((.(((..{{.(((((((..((((.(((,.{((.((({(((...}))))}))))))))..((((((((.((((.....(((.(((...)))))).((.(((((((((((((..((,(((((((((((((((.(((,(((((..........))))).,,})).))))((((((((...((((((.........))).))).)))))))).)))))...))))),.|{.{{{(((|....|))))},,,.((((((((((...)))))))))).}),)))))))))....)))).))))))..))))))))((((((..(((.(((......))).)))....)))))).......,.(((((((..((((((.(((..............{(((((..((((.(((((((,.((....}}.,.}))).(({...{{.......},,....))).))).))))})))))((((...(((.(((.......))).)))...))))........{({,(((...))).}))....(((((...))))){(((((.......)))))))))))))))..))))))).,(((.....))))))).)))))))}}..,})).)))).))))))).)))))){{{{((({...|{{|{,....,},)))))}}}}}}},.......(({{{.{{{....,..))}...}}}))}}}),.))))).}..)))),}}}}.))))))))).)).)))).}...,....)))..))))..))))))))...............))))..)))))..
Back