Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001665.4

Sequence Length

1295 nt

GC Content

0.6000

ACUUCCUUCUCGAGCCCGGAGCCGCUGCCGCCGCCCCCAGCUCCCCCGCCUCGGGGAGGGCACCAGGUCACUGCAGCCAGAGGGGUCCAGAAGAGAGAGGAGGCACUGCCUCCACUACAGCAACUGCACCCACGAUGCAGAGCAUCAAGUGCGUGGUGGUGGGUGAUGGGGCUGUGGGCAAGACGUGCCUGCUCAUCUGCUACACAACUAACGCUUUCCCCAAAGAGUACAUCCCCACCGUGUUCGACAAUUACAGCGCGCAGAGCGCAGUUGACGGGCGCACAGUGAACCUGAACCUGUGGGACACUGCGGGCCAGGAGGAGUAUGACCGCCUCCGUACACUCUCCUACCCUCAGACCAACGUUUUCGUCAUCUGUUUCUCCAUUGCCAGUCCGCCGUCCUAUGAGAACGUGCGGCACAAGUGGCAUCCAGAGGUGUGCCACCACUGCCCUGAUGUGCCCAUCCUGCUGGUGGGCACCAAGAAGGACCUGAGAGCCCAGCCUGACACCCUACGGCGCCUCAAGGAGCAGGGCCAGGCGCCCAUCACACCGCAGCAGGGCCAGGCACUGGCCAAGCAGAUCCACGCUGUGCGCUACCUCGAAUGCUCAGCCCUGCAACAGGAUGGUGUCAAGGAAGUGUUCGCCGAGGCUGUCCGGGCUGUGCUCAACCCCACGCCGAUCAAGCGUGGGCGGUCCUGCAUCCUCUUGUGACCCUGGCACUUGGCUUGGAGGCUGCCCCUGCCCUCCCCCCACCAGUUGUGCCUUGGUGCCUUGUCCGCCUCAGCUGUGCCUUAAGGACUAAUUCUGGCACCCCUUUCCAGGGGGUUCCCUGAAUGCCUUUUUCUCUGAGUGCCUUUUUCUCCUUAAGGAGGCCUGCAGAGAAAGGGGCUUUGGGCUCUGCCCCCCUCUGCUUGGGAACACUGGGUAUUCUCAUGAGCUCAUCCAAGCCAAGGUUGGACCCCUCCCCAAGAGGCCAACCCAGUGCCCCCUCCCAUUUUCCGCUACUGACCAGUUCAUCCAGCUUUCCACACAGUUGUUGCUGCCUAUUGUGGUGCCGCCUCAGGUUAGGGGCUCUCAGCCAUCUCUAACCUCUGCCCUCGCUGCUCUUGGAAUUGCGCCCCCAAGAUGCUCUCUCCCUUCUCCAAUGAGGGAGCCACAGAAUCCUGAGAAGGUGAAUGUGCCCUAACCUGCUCCUCUGUGCCUAGGCCUUACGCAUUUGCUGACUGACUCAGCCCCCAUGCUUCUGGGGACCUUUCCUACCCCCAUCAGCAUCAAUAAAACCUCCUGUCUCCAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-505.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -524.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 247.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......(((((((((..((((..(((((.(..(((....(((((((((...))))).))))....)))..).))))).((((((((((((((...((.((((((...))))))..((((((..(((((.......))))).((((((((.(((.(.(((((((.(..(((((.(.(((((((..(((...((......))..)))..))...(((((......)))))...........(((((((.(((((...((((.....))))))))).))))))).(((((..((.........))..))))).(((..((((((.(((((........))))).).))))).))).((((...(((....)))..))))..((((((..(((((((((..(((..((((((..((((((((...(((((((((...)).)))))))...))))((...(((((((.((....)))))))))..)).((((((...((((.((((((((((.(((.(((((......(((((..((((((((((((..(........)..))))...)).))))))..))...))).......(((((.(((.((.(((.((..((((...)))).))))))).))).))))).)))))))).))).))))))).))))...(((((((.......))))))).))))))))))..)))))))))..))).)).)))).)))))).)))))).)))))..)))))))).)..))))))))))).............))))))((....)).))..)))))).))))))))...((((((..((((((.(((((((((((((((.((((((((......)))))))))).)))))))))))))))))))....)))))))))))))))))))(((((((.......(((((((............((((((...((((.....))))))))))((((((...............)).))))...))))))).(((((........))))).(((.(((((....(((((.....((((((((((((..(((.((.((((.....((((........((((((((..........)))))).))...(((((((.......)))))))...)))).....)))).)))))..)).)))))))))).......)))))))))).....)))...(((((.....)))))....(((((..(((((...........)))))..))))).................)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

......{((((((((..((((..(((((.{..(((....(((((((((...))))).))))....)))..}.))))).((((((((((((((..,{{.((((((...)))))).,|,{{{{..(((((,....}.))))).((((((((.(((,(,(((((((.(..(((((.(.(((((,,..((({{{(,{{{.{{||..,,,......,{(({{......})|}}...........(((({|{.,,,,,..,||||,....)})))),))}))))))).(((((..((.,.......))..}}))).(((..((((((.(((((........))))).,,))))).))).((((...(((....)))..))))..{(((((..((((((,,({{(((.,((((((..((((((((...(((((((((...)).)))))))...))))((...(((((((,({....)))))))))..}).((((((...((((.((((((((((.(((.(((((,,....||{((..((((((((((((..{........|..))))...)).))))))..||...,,,..,}},.(((((.(((.(,.(((.{{..((((...)))).))))))).))).))))).)))))))).)))},)))))).))))...(((((((.......))))))).))))))))))..)))))})))..}))}))}}))).)))))}.)))))).))))).,)))))))).}..)))))))))))...{,,,......|}}}}}|,....)),),..)))))).)))))))}...((((((..((((((.(((((((((((((((.((((((((......)))))))))).)))))))))))))))))))....)))))))))}))))))))}(((((((........{({(((......}}}...((((((...((({.....))))))))))((((((...............)).))))...||},,,..{{(({........))))).,||,|{{{{...,||{{{.{...((((((((((((..((,{((.((((.....((((........((((((((..........)))))).))...((((({{{......)))))))...)))).....)))).)))))..)}.)))))))))).......)})))})))).....}},...(((((.....)))))....(((((..(((((...........)))))..)))))..............,..}))))))