Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001924.4

Sequence Length

1352 nt

GC Content

0.5074

AGUGGCUGGUAGGCAGUGGCUGGGAGGCAGCGGCCCAAUUAGUGUCGUGCGGCCCGUGGCGAGGCGAGGUCCGGGGAGCGAGCGAGCAAGCAAGGCGGGAGGGGUGGCCGGAGCUGCGGCGGCUGGCACAGGAGGAGGAGCCCGGGCGGGCGAGGGGCGGCCGGAGAGCGCCAGGGCCUGAGCUGCCGGAGCGGCGCCUGUGAGUGAGUGCAGAAAGCAGGCGCCCGCGCGCUAGCCGUGGCAGGAGCAGCCCGCACGCCGCGCUCUCUCCCUGGGCGACCUGCAGUUUGCAAUAUGACUUUGGAGGAAUUCUCGGCUGGAGAGCAGAAGACCGAAAGGAUGGAUAAGGUGGGGGAUGCCCUGGAGGAAGUGCUCAGCAAAGCCCUGAGUCAGCGCACGAUCACUGUCGGGGUGUACGAAGCGGCCAAGCUGCUCAACGUCGACCCCGAUAACGUGGUGUUGUGCCUGCUGGCGGCGGACGAGGACGACGACAGAGAUGUGGCUCUGCAGAUCCACUUCACCCUGAUCCAGGCGUUUUGCUGCGAGAACGACAUCAACAUCCUGCGCGUCAGCAACCCGGGCCGGCUGGCGGAGCUCCUGCUCUUGGAGACCGACGCUGGCCCCGCGGCGAGCGAGGGCGCCGAGCAGCCCCCGGACCUGCACUGCGUGCUGGUGACGAAUCCACAUUCAUCUCAAUGGAAGGAUCCUGCCUUAAGUCAACUUAUUUGUUUUUGCCGGGAAAGUCGCUACAUGGAUCAAUGGGUUCCAGUGAUUAAUCUCCCUGAACGGUGAUGGCAUCUGAAUGAAAAUAACUGAACCAAAUUGCACUGAAGUUUUUGAAAUACCUUUGUAGUUACUCAAGCAGUUACUCCCUACACUGAUGCAAGGAUUACAGAAACUGAUGCCAAGGGGCUGAGUGAGUUCAACUACAUGUUCUGGGGGCCCGGAGAUAGAUGACUUUGCAGAUGGAAAGAGGUGAAAAUGAAGAAGGAAGCUGUGUUGAAACAGAAAAAUAAGUCAAAAGGAACAAAAAUUACAAAGAACCAUGCAGGAAGGAAAACUAUGUAUUAAUUUAGAAUGGUUGAGUUACAUUAAAAUAAACCAAAUAUGUUAAAGUUUAAGUGUGCAGCCAUAGUUUGGGUAUUUUUGGUUUAUAUGCCCUCAAGUAAAAGAAAAGCCGAAAGGGUUAAUCAUAUUUGAAAACCAUAUUUUAUUGUAUUUUGAUGAGAUAUUAAAUUCUCAAAGUUUUAUUAUAAAUUCUACUAAGUUAUUUUAUGACAUGAAAAGUUAUUUAUGCUAUAAAUUUUUUGAAACACAAUACCUACAAUAAACUGGUAUGAAUAAUUGCAUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-450.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -477.56

Frequency: 0.0000

Diversity: 361.50

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((.(((((((.((((((((((((..(((.((((.(.....).)))))))..)))..)))......((((((((((.((..((......))..(((.(......).)))((((((.((.((((((((......((.(..((...((((.((.(((((((..(((...((((((.(((...(((.((....(((((((((((...((....))....))))))).))))))))).))).))))....))...)))..))))(((((.(((((..(((((.(((.((.((((...(((..((((.(.(...((((..(((....)))))))..)).)))).)))..)))).)).))).))))).))))).))))).(((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((..(((.((((((...))))))...)))..)))))))))..)))..)))))))..))))))((..((.(.(((...(..(((((......)))))..).))).).))..)).....)))).))))))))).((........)).....))))).)))).))..)))..)))))))).)).))))))(((((..((.(.((..((((.(((....))).))))..))).))))))))))))))))))).)))))).))))))).)).....((..((((((((...(((....)))(((...((((((.....(((((((...(((((..(((((((....(((((....))))).)))))))...(((((.((((((((.(((((((...................((........)).((((((((.(((.(((((((((..(((.....)))......))))).......))))))).)))))))))))))))..(((((.....)))))...))).))))).))))))))))))))))))))))).)))........))))))))..)).....((((..((((.((((((..........(((((((...((((...............(((((...((.....)).))))).........(((((((...((((((.((((.(((.......)))...)))).))))))))))))).....((((((...........))))))(((((((...((..((((.....))))..)).))))))).............)))).)))))))((((........))))...)))))).))))..)))).....(((((...))))).(((..((((((((((((((.................................))))))))))))))...)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((.(((((((.((((((((((((..(({,(((({{.....).)))))))..))),.}}}...||.((((((((((.((..((..,,..}}..(((.(......).)))((((((.((.((((((((.{.((.(.(((.(((((((.(((.((({(((({{(((...((((((.(((,,.{((,((,,..({(((((((((...((....))....))))))))))))))))),))).))))....))..,)))..})))|).))).))))))))))..}||.|{,{({{,....,,,||{{.{,{,..{{|||.(((....)))}},,..||,.,|||,||..,.,,,|(,((|,||}}}||{||,..{|.|{(((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((..(((.((((((...))))))...)))..))))))))}..))))},})))))..)))))){{,{(,.(,(({.,.(..(((((......)))))..).))}.),))..)),,.,.)))).))))))))}.}}}.,)..}.))..}})))),)}}})}.})..})),,)))))))).)).))))))|{{{{{{((.(.((..((((.(((....))).))))..))).))))))})))))))))))).)))))).))))))).))...,,{...((((((((...,,,...,|||(((...((((((....,(((((({...(((((..(((((({...,((({(....}),))))))))))...(((((.((((((((.{((((((....,..............{,.....,.....((((((((.{{{.{({{(((({{.{{{,,..,|||......,,....,,.,}}))))))}.))))))))))))))}..{||{|...,.)))))..,))),})))).))))))))))))))))))))))).)))},,.....)))))))}..}}.....,{{,.{((({.{,,,||}}.........||{.,,,,..,...,..,,,,..,....{((({...,{.....}}.}}}}}..,,,,,,.(((((((...((((((.(({(.{({.......)}}...)))),))))))))))))).....((((((...........))))))(((((((...((..((((.....))))..)).))))))).....,...|||,|||||,}}}},{((((........))))}..||||}}.,}}},,}}},.,,.,||||,,{{|||,|{{((,.,{{{{||||||{||,,,,,,,.|||.......,......,,,.,,..})))))}}}}}}}).,.)}.