Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001960.7
Sequence Length
985 nt
GC Content
0.6030
CUCCCUUUCAUCAGUCUUCCCGCGUCCGCCGAUUCCUCCUCCUUGGUCGCCGCGUCCUUGGCUGGCGUCAGAAAAAUGGCUACAAACUUCCUAGCACAUGAGAAGAUCUGGUUCGACAAGUUCAAAUAUGACGACGCAGAAAGGAGAUUCUACGAGCAGAUGAACGGGCCUGUGGCAGGUGCCUCCCGCCAGGAGAACGGCGCCAGCGUGAUCCUCCGUGACAUUGCGAGAGCCAGAGAGAACAUCCAGAAAUCCCUGGCUGGAAGCUCAGGCCCCGGGGCCUCCAGCGGCACCAGCGGAGACCACGGUGAGCUCGUCGUCCGGAUUGCCAGUCUGGAAGUGGAGAACCAGAGUCUGCGUGGCGUGGUACAGGAGCUGCAGCAGGCCAUCUCCAAGCUGGAGGCCCGGCUGAACGUGCUGGAGAAGAGCUCGCCUGGCCACCGGGCCACGGCCCCACAGACCCAGCACGUAUCUCCCAUGCGCCAAGUGGAGCCCCCAGCCAAGAAGCCAGCCACACCAGCAGAGGAUGACGAGGAUGAUGACAUUGACCUGUUUGGCAGUGACAAUGAGGAGGAGGACAAGGAGGCGGCACAGCUGCGGGAGGAGCGGCUACGGCAGUACGCGGAGAAGAAGGCCAAGAAGCCUGCACUGGUGGCCAAGUCCUCCAUCCUGCUGGAUGUCAAGCCUUGGGAUGAUGAGACGGACAUGGCCCAGCUGGAGGCCUGUGUGCGCUCUAUCCAGCUGGACGGGCUGGUCUGGGGGGCUUCCAAGCUGGUGCCCGUGGGCUACGGUAUCCGGAAGCUACAGAUUCAGUGUGUGGUGGAGGACGACAAGGUGGGGACAGACUUGCUGGAGGAGGAGAUCACCAAGUUUGAGGAGCACGUGCAGAGUGUCGAUAUCGCAGCUUUCAACAAGAUCUGAAGCCUGAGUGUGUGUACGUGCGCGCGUGCGUGAGGCCCUGCCACGAUUAAAGACUGAGACCGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-400.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -417.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 142.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((..((.((((((((.(((((((.(((((.((((((((((((((.(((((.(((((((((((((((.......((((......(((((........).)))).((((..(((.((.((....)).)).)))..))))..((((..(((......))).....(.(((((...))))).))))).)))).......)))))))))....((((((.(..(((((..(..((((((.((..(((((.(..(((((((.((((..(((..(((....(((((((((((..((((.(.((...)).))))).........((((((((...))))))))..((((((....(.(((((((((((...........))))).))))))).)))))).)))))))))))(((((.(((((((((.(........((((((((....))))).)))........))))))))))..((((...((.....))))))....))))).....))))))....))))))).))))..)..)))))...........)).))))))..)..)))))..).)))))))))))).)))))...)))).)))))))).)).).)))).).)))))).......((((.....(((......)))))))..(((((((((((((((((((.(..(((.((.(((((.((((.....((((((((((((((((((((.......(((...((((((.....))))))...))))))))))).)))))).).)))))..)).)).))))).)).)))..).)))))))).).)))))))))).....(((((((.((((((((...((........))..))))))))....((((((((.(..(((..(((((.(((.(((((........))))).))).).))))..)))..)))))))))......))))))).......))))))))))..)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((..((.((((((((((((((((.((((,.(((((((((({(((.(((((.(((((((((((((((.......((((,,....{{{{,,,,,.,,,}.}}}},((({.{(((.,,.{({{.....||.},,..))}|..,|||.,||}.}},}})}}}....(.(((((...))))).)||||.}}}},,,,...)))))))))....((((((.(..(((((..(..((((((.((..(((((.(..((((((,{((((..(((..(((....(((((((((((,((,,{.{{({,,,|,.}|||}..||,....((((((({...})))))))..{{{{{{.,,.{.(((((((((((.{.......,.))))).))))))}.)))))}.)))))))))))(((((.(((((((((.{........((((((((....))))).)))........})))))))))..{{{(,.{{,..,..}}))))....))))).....))))))....))))))).))))..)..)))))...........)).))))))..)..)))))..).)))))))))))).)))))...)))}.)))))))).)).,.)))).).)))))).)},...((((,....(((......)))))))..((((((((((({(((((((.(..(((.((.(((((.{{{(.....((((((((((((((((((({.......((({,.((((((.....))))))..,))))))))))),,))))).)))})))..)).)}.))))).)).)))..).)))))))}.).)))))))))).....(((((((.((((((((.{{(,........))}.))))))))....((((((((.{.,(((..((({(.(((,(((((........))))).))).).))))..))},.,))))))))......))))))).......,}))))))))..)).
Back