Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002022.3

Sequence Length

2303 nt

GC Content

0.4160

ACACAACUUUUUUUCCUUAGUCUGUAUACUUUCUGCUGUCACUAGCAUAACAGAAAAGACGAAUGGCUUUUGUUUUAAACUGAGGGCACUUUUACAAAAGUCAUCUUUCCAUUUAUUUUUCUUUCAGAAAAAAGAAUUUGGGUUUUGAGCUUUUUUAAAAAAAAAAGACAAACACUUUCCUUGACUUUGAGAAAUAAUUUAAGUCAAAGAAUCUGCUCUAUGCUAACCAAGAGAUAGAGCACAGCAAAGAUCUGCCAGCCCCAGGCCUCUACCUAGUGGCCUGGAAAUUCAAGUAUUCUUAUUGGUGGAGGCCAUUUGUUUCUGAUUAGAAGCUGUCUAAACCUCCUACUCCUCAACUCAAAGGAAAACACAGAGCAUACCAUGGCCAAGAAAGUUGCAGUGAUUGGAGCUGGUGUGAGUGGCCUCUCCUCCAUCAAAUGCUGUGUGGAUGAGGACCUGGAGCCCACCUGCUUUGAGAGAAGUGAUGACAUUGGGGGAUUAUGGAAGUUUACUGAAUCUUCCAAAGAUGGGAUGACCAGGGUCUAUAAGUCAUUAGUGACAAAUGUCUGUAAGGAAAUGUCAUGUUACAGUGACUUCCCUUUCCACGAAGAUUAUCCUAAUUUCAUGAACCAUGAAAAAUUUUGGGACUAUCUCCAAGAAUUUGCUGAGCACUUUGACCUCCUGAAAUACAUUCAGUUUAAGACCACUGUGUGCAGCAUAACGAAGCGUCCAGACUUCUCCGAAACUGGUCAGUGGGAUGUUGUCACAGAGACAGAGGGCAAGCAAAAUAGAGCUGUCUUUGAUGCUGUUAUGGUUUGCACUGGACAUUUCCUGAAUCCCCAUUUACCUUUGGAAGCCUUUCCUGGAAUUCAUAAGUUUAAAGGUCAGAUCCUGCAUAGUCAAGAGUACAAGAUCCCAGAAGGCUUUCAGGGCAAACGCGUCUUGGUGAUUGGUCUUGGGAACACUGGAGGAGACAUUGCUGUGGAACUCAGUCGAACGGCAGCUCAGGUACUUCUCAGUACUAGAACUGGUACCUGGGUUCUUGGGCGCUCUUCAGAUUGGGGCUAUCCUUAUAAUAUGAUGGUUACAAGAAGAUGCUGUAGUUUUAUUGCACAAGUUCUGCCUUCACGUUUUCUAAACUGGAUUCAAGAAAGGAAGUUGAAUAAGAGAUUUAAUCAUGAGGAUUAUGGAUUAAGUAUUACCAAAGGGAAAAAAGCAAAAUUCAUUGUGAAUGAUGAGCUGCCAAACUGUAUCCUCUGUGGGGCAAUCACUAUGAAAACCAGCGUGAUUGAAUUUACAGAAACCUCUGCUGUCUUUGAAGAUGGGACAGUGGAAGAAAACAUUGAUGUUGUGAUCUUCACUACAGGAUAUACAUUUUCUUUUCCAUUUUUUGAAGAACCUCUUAAAAGCCUCUGUACAAAGAAGAUAUUUCUAUACAAGCAAGUCUUUCCCUUAAACCUAGAGAGAGCGACAUUAGCCAUCAUCGGCCUUAUCGGCCUUAAAGGAUCCAUCUUAUCAGGCACAGAGCUCCAAGCACGAUGGGUCACAAGAGUAUUCAAAGGACUCUGUAAGAUACCUCCAUCCCAAAAAUUGAUGAUGGAGGCUACUGAAAAGGAACAGCUCAUUAAAAGGGGAGUGUUUAAAGACACCAGCAAAGACAAAUUUGACUACAUUGCCUACAUGGAUGAUAUCGCUGCCUGCAUAGGCACAAAGCCCAGCAUCCCACUUCUGUUCCUCAAGGAUCCCAGACUAGCUUGGGAAGUUUUCUUUGGACCAUGUACUCCUUAUCAGUACCGCCUCAUGGGCCCUGGAAAAUGGGAUGGAGCCAGAAAUGCCAUCCUGACCCAGUGGGACAGAACAUUGAAACCUUUAAAAACUCGAAUUGUCCCUGAUUCCUCCAAGCCUGCCUCCAUGUCACAUUAUUUAAAAGCCUGGGGGGCACCUGUCCUACUUGCCUCUCUUCUACUUAUCUGUAAAUCUUCACUUUUCUUGAAAUUGGUGAGAGAUAAACUACAGGACAGAAUGUCCCCUUACCUAGUAAGUCUUUGGCGAGGAUGAACCUGAUUGUUACAAGGGUUACACAAAGUCAUGCUAAUUCUAUCUCCAAGUAUCUUGUGCAUCCCUCCUCUGCUCUCCAUCAUAACUGCUAUUAGCCAAAUUCAGGCCCAGUCAUCUCCUAUCUGAAUUAUUGUAUUAUCUUCUUCUUUGUUUUCAGUACCCUCUUUCUUGCCACCCUUUCCAAUGCAUCUUCUACCCUGCUACCUCAGUGAUUAUUCUAAAAUAAAUAUAUAUGAUAUGGUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-616.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -663.82

Frequency: 0.0000

Diversity: 607.67

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..............((...(((((((((..(((((.(((.....)))...)))))((((((((.....))))))))..(((((((..(((((....)))))...............((((((...))))))(((((...((((.((((((((((((....))))))).........(((.(((((((.((.......)).))))))).)))..((((((((.((.......)))))))))).((((((((((((((((..(((((((.((....)).)))))))......(((....))).))))))))((((((.((((((((.(((((.....))))).........((((........)))).....))))).)))..))))))((((....(((((((((((((((.((((.(.((((((((...(((((((.....)).))))).)))).))....))))))).))))).......((....)).((((((((((..(........)..))))))))))((((((((((((..((((((..((((((((.((((((....(((....))).......))))))))))))))..........(.((((..(((((((((((((...)))))))....))))))..)))).).......(((((.((((..((..((.(((((.....)))))....))..))..)))).)))))....(((((.....).))))...(((..((((.(((((.(.(((((....((((((((((((((((.....(.(((.(((...)))))).)....))))))...((((((((((((.....(((.(((((..(((((((((((...(((((((..........(((......)))..........))))......)))..)))))))))))((((......)))).))))).)))..(((((((.((((((((((((..(((.((((((((((((((..(((.(((((((((((....((((......))))))))))))))).)))..)).(((((...(((..((((((..........))))))..)))))))).)))).)))))))).)))...).))).)))))).)))))))))(((((.(((((((((((..(((((((.....)))))))..((((((((((((((.(((((......((((((((...(((...((((((......)))))).))).....(((((((((((((((.(((((((..((.....))..)))))))..))))))))....(((((((((((.......)))))))))))............(((.((((...)))).))))))))))....((((((..........))))))..........((...((((...((((.....)))).)))).)).....))))))))......((((((.(((.((((..(((.....((((.....))))......((((((((......(((.....)))........))))))))(((.((((.........)))))))......((((((((.(((...)))..)))))))).((((((.(((((.(((((((((....(((.(((((...........((((((......)))).))))))).))).....)))))....))))..(((((.((..(((((...(((.(((((((((((.(((....)))...))))..))..))))).)))..)))))..))))))).))))).))))))..((((...))))..)))..))))((((((...........))))))......((((((((((.......................(((((......))))).........(((((((..(.(.............).)..))))))).)))))))))))))))))))..))))))))))).))))))))))))))))))).))))).............)))))...)))))))((((.((.((.....))..)).)))).(((((......))).))((((...(((((.(..(((((.............)))))))))))...)))))))))).))))....)))))).))))).))))..))))))))).))))..)))))))).))))))))))...))))..))))))))))))).))))...)))))...............(((..........)))..)))))))((....)).........)))))).)))..))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

..........,,,.((,,.((((({{{,.,{({(({((,...,,))).,.}))}}|||{|({(,,{{{|||||,,,..{{{((({,,,|||{.},}})))}}},,..{{{({{(.(((((((...))))))).})},.|||{{,,{{{,(((((({....})))))).........{((.(((((((.((.......}),))))))).))}..((((((((.((......,,,))))))))..(({.....,|||,....(((((((.((....)).)))))))......,{{,,..},}.}}|||{{{((,,,,..((((((,..,||}}}}..,,,,..}}}}}.,,{{{{........)))),....|}|||||,,.,||||}|,({{{{{.{{{{.,,{{(((((,.(({({(,{,(((((({{{{{(({{,.....}).)}))).)))).)).{{{||,},,,.)))}}{(((({({{((,((((,{((((((,,.,({{{{..,.}..}},)))))),((((((((((((..((((((..{(((((((.((((((..,,{({....}}}...},}}))))))))))))))....,{,...{.((((..(((((((((((((...)))))))....))))))..)))),,..}},..(((((.((((..((..((.(((((.....)))))....})..))..)))).)))))....(((({.....|.))))...(({..((((.(((((.(.(((((.,..((((((((((((((((.....(.(((.{{{...}}}))).)....))))))...((((((((((((..,,{(({.{{{((,,((((((((((,.{(((,((({.....,....(((......)))..........}}}}....,,)})}))))))))))))|||(,,.,||,}},.})))},))},.,|})}|,.,{((((((((({.,(((.((((((((((((((..(((.(((((((((((....((((......}}))))))))))))),)))..)),(((((...(((.,((((((.,......}.))))))..)))))))}.)))).)))))))).)))...}}})).)))))).||{{(({..(((((.(((((((((((..(((((((.....)))))))..((((((((((((({{(((((......((((((((...(((...((((((.....,)))))).))}.....(((((((((((((((.(((((((..((.....))..)))))))..))))))))....(((((((((((.......))))))))))).}...,......{{{.((({...)))).}}))))))))....{{{{{{.......,,,}||||...,,,,.,,,{{...((((...(((({...,}))).)))).)}.....))))))))......{(((((.(((,.....,{(,.....((((.....}||}.....,(({{{{{{,,....|||.....|}|...,,...)))|||||{{.{((((.......,.)))))}}......((((((((.((,...,))..)))))))).((((((.(((((.(((((((((....(((.(((((...........{{((({......)))).}}))))).))).....)))))....))))..(((((.((..(((((...(((.(((((((((((.(((....)))...))))..))..))))).)))..)))))..))))))).))))).))))))..((({...))))..|||....,|((((((...,.....},)))))))}.,}}|(((((((((....,,{{.....,,,.......(((((,.....))))).........(((((((..(.,.............}.}..))))))}.)))))))))))))))))))..)))))))))))}}}))))))))))))))))).))))).,}))}..,,,..))))}..,))))))){(((.({.{|.....,}..)).)))).,,{{{......}}}.,,((((...((({{,(..{((((.............))))))))))).,.)))))))))).))))..,.)))))).))))).))))..))))))))).))))},}))}))))........,..,,,,}}})))),,)}},.))).}...,})))})}})}}))),.,})))))))},)}}}}..,.})},.})))}))|.,{{,{.....,,,,.}}}}}}.))},,)),...