Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002029.4
Sequence Length
1298 nt
GC Content
0.5208
ACUCUCCCCAGGAGACCCAGACCUAGAACUACCCAGAGCAAGACCACAGCUGGUGAACAGUCCAGGAGCAGACAAGAUGGAGACAAAUUCCUCUCUCCCCACGAACAUCUCUGGAGGGACACCUGCUGUAUCUGCUGGCUAUCUCUUCCUGGAUAUCAUCACUUAUCUGGUAUUUGCAGUCACCUUUGUCCUCGGGGUCCUGGGCAACGGGCUUGUGAUCUGGGUGGCUGGAUUCCGGAUGACACACACAGUCACCACCAUCAGUUACCUGAACCUGGCCGUGGCUGACUUCUGUUUCACCUCCACUUUGCCAUUCUUCAUGGUCAGGAAGGCCAUGGGAGGACAUUGGCCUUUCGGCUGGUUCCUGUGCAAAUUCGUCUUUACCAUAGUGGACAUCAACUUGUUCGGAAGUGUCUUCCUGAUCGCCCUCAUUGCUCUGGACCGCUGUGUUUGCGUCCUGCAUCCAGUCUGGACCCAGAACCACCGCACCGUGAGCCUGGCCAAGAAGGUGAUCAUUGGGCCCUGGGUGAUGGCUCUGCUCCUCACAUUGCCAGUUAUCAUUCGUGUGACUACAGUACCUGGUAAAACGGGGACAGUAGCCUGCACUUUUAACUUUUCGCCCUGGACCAACGACCCUAAAGAGAGGAUAAAUGUGGCCGUUGCCAUGUUGACGGUGAGAGGCAUCAUCCGGUUCAUCAUUGGCUUCAGCGCACCCAUGUCCAUCGUUGCUGUCAGUUAUGGGCUUAUUGCCACCAAGAUCCACAAGCAAGGCUUGAUUAAGUCCAGUCGUCCCUUACGGGUCCUCUCCUUUGUCGCAGCAGCCUUUUUUCUCUGCUGGUCCCCAUAUCAGGUGGUGGCCCUUAUAGCCACAGUCAGAAUCCGUGAGUUAUUGCAAGGCAUGUACAAAGAAAUUGGUAUUGCAGUGGAUGUGACAAGUGCCCUGGCCUUCUUCAACAGCUGCCUCAACCCCAUGCUCUAUGUCUUCAUGGGCCAGGACUUCCGGGAGAGGCUGAUCCACGCCCUUCCCGCCAGUCUGGAGAGGGCCCUGACCGAGGACUCAACCCAAACCAGUGACACAGCUACCAAUUCUACUUUACCUUCUGCAGAGGUGGAGUUACAGGCAAAGUGAGGAGGGAGCUGGGGGACACUUUCGAGCUCCCAGCUCCAGCUUCGUCUCACCUUGAGUUAGGCUGAGCCACAGGCAUUUCCUGCUUAUUUUAGGAUUACCCACUCAUCAGAAAAAAAAAAAAAAGCCUUUGUGUCCCCUGAUUUGGGGAGAAUAAACAGAUAUGAGUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-443.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -465.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 399.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((..(((.(((..((.(((.......(((((((((.((.((((((...((((((((((((.((.((((.((.((......(((((((..............)))))))....)))).)))))))))........))))))))).))))))))....)))).))))))))...))..)))...))).)))))))......(((((((((((.((((((.((...))((((((....(((((..((((((.......(((((((..((((.((((.(((........)))...))))...))))...)))).)))..(((((((((..(.....)..))))))))))).))))..))))).....))))))...((((((..((((.((((......(((((...)))))((((((((.((...(((..((..(((.((((.((.((.(((..((((...))))..))).))))..)))).)))..)).)))...)).)))))))).(((((..((((((..(((((((.(((((...(((((((.((((((....))))......)).)))))))...)))))))).))))..(((.((((.((((((.....((........)).....)))))).)))).)))((.(..((((((.(((((((((......))).)))..))).)).))))..).)).)))))).)))))..)))).))))..)))))).......)))))).)))).)))))))..(((((....))))).((((.((..(((.((((((((((((((((((((((((..........)))))((((.((((.....)))).))))...((((((((.(.......).))).)))))(.((..(((.((((.((....)).)))))))..)).).))))))))...((((((((......(((...((...........))....)))......))))))))(((..((((((.(((........))).))))))..)))..))))))))))))))..)).))))...((((((.(((.(((((((...........((((((((((.....))))))))))...((((((((((((.(((((((((((((.(........)))))))))))((((((...((((...))))..)))))).(((...)))....))).)))))))).((.....)).......................)))))))))))..))).)))))))))).(((((........)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((({..(((,(((..((.{{{.......(((((((((.{{.{(((((...(((((((((,(({,.{(({(,((.,,.....,{{(((((....{,.....,,.)))))))..,,,||}.}}}}})),)}...}}}.))))))))).))})))})....)))).)))))}}},..}}..}}}.,.})},}))))))...,..(((((((((((.((((((,{{,..||((((((.,.,{{((({,(({,((,((((....))))...|||{.||||}||{.....,,.}}},,.}}}|...||||,..,,,|,||||,{{((((((({{{.....)|,}))))))}}))})}}|,,|}|||,,,..,,|||,...{|||||.{((((.,,,,.}}},}(((((...))))){(((((((.((.{{({{,.((..(((.((((.{{.((.(((..(((|...,)))..))).))))..)))).))).,)).)))}},)).)))))))}.{(({{,,|(((((,.(((((((.(((((...(((((((.((({{{...,|}}}..,,.|}}.))))))}...)))))))).))))..{{{.,,{{.{{{{{|,,,,.||.,,,....}),....)))))).}}}|.|||((.{..||||||.{{{{||||{,.....))),))),,|||,}||||||..|,||,}}},,,.))}}..,)))).})))}})}))))||.....)))))).}))),,))))))..(((({,...}}))).{(((.((..(((.(((((((((((,((((((((((((..........))))}(({(,((((.....)))).))})...,{{(((((.{.......}.))).))}||({((,.(({.{(,{..,....},.)),)))),,)).,,)))))))}...{(((((((......(((,,.({...........))....)))......)))))))|(((..((((((.(((........))).))))))..))),.))))))))))))))..)).)))}...{((({{.(((.((((({{|,...,,,,,,((((({{({{.....))))))))))...,|||||,{{(((||{(((((((((((.(........)))))))))))|(((({.,.((({...})))..)))))),|{{...||}...,||||}}},,}}),||,....}}..,,....,,.............)}}},))))))..))).}))))))))).{{{{{........))}},
Back