Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002038.4

Sequence Length

812 nt

GC Content

0.5616

GUUUACUCGCUGCUGUGCCCAUCUAUCAGCAGGCUCCGGGCUGAAGAUUGCUUCUCUUCUCUCCUCCAAGGUCUAGUGACGGAGCCCGCGCGCGGCGCCACCAUGCGGCAGAAGGCGGUAUCGCUUUUCUUGUGCUACCUGCUGCUCUUCACUUGCAGUGGGGUGGAGGCAGGUAAGAAAAAGUGCUCGGAGAGCUCGGACAGCGGCUCCGGGUUCUGGAAGGCCCUGACCUUCAUGGCCGUCGGAGGAGGACUCGCAGUCGCCGGGCUGCCCGCGCUGGGCUUCACCGGCGCCGGCAUCGCGGCCAACUCGGUGGCUGCCUCGCUGAUGAGCUGGUCUGCGAUCCUGAAUGGGGGCGGCGUGCCCGCCGGGGGGCUAGUGGCCACGCUGCAGAGCCUCGGGGCUGGUGGCAGCAGCGUCGUCAUAGGUAAUAUUGGUGCCCUGAUGGGCUACGCCACCCACAAGUAUCUCGAUAGUGAGGAGGAUGAGGAGUAGCCAGCAGCUCCCAGAACCUCUUCUUCCUUCUUGGCCUAACUCUUCCAGUUAGGAUCUAGAACUUUGCCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGGUUCUCACUAUAUUGUCCAGGCUAGAGUGCAGUGGCUAUUCACAGAUGCGAACAUAGUACACUGCAGCCUCCAACUCCUAGCCUCAAGUGAUCCUCCUGUCUCAACCUCCCAAGUAGGAUUACAAGCAUGCGCCGACGAUGCCCAGAAUCCAGAACUUUGUCUAUCACUCUCCCCAACAACCUAGAUGUGAAAACAGAAUAAACUUCACCCAGAAAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-313.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -327.38

Frequency: 0.0000

Diversity: 207.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.((...(((((((..........((.(((((((((..(((((.......)))))..)))......(((....))))))))).)))))))))(((.......))).(((((((....)))))))...((((((((((((.(((((((((...))))))).)).))))))).......)))))..((((((...((((((.((.((.(((((((((..((((.(((...))).))))....(((.....)))(((((((((((((((((((((((((......)))))).)))....))))))....)))))))))).((((.(((......))).)))).((.....))(((.((((((((((.(((((.(((((((((.(((((((...(((.(.......).))).))))))).))))).........)))).))))).))))).))))).)))....((((((((.....(((((((.((.(((((........)))))))...))))))).((((.((((((((((((.....)))))))....................................((((((((((...(((((....((...(((((((((((((((((((((((.(....).))..))))).))))))........))).))))))))))))))....))))))))))....))))).))))......((....))))).)))))))))))))).)).))))))))....)))))).............(((....))))).)))))...............

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((..{,{({((((({{........,,|{.{((((((((..(((((.......}}}}).,}||,.....(((....))))))))).}}||||}}}||,.....|||||{(((((((....)))))))}}.,}}}((((((((.(,(((((((...))))))).)}.)))))))).,.....|,|,,,((((((...(((({|.{{.((.(((((((((..((((.(((...))).)))).,,{((({{{{,,|,(((((((((((((((((((((((((......))))))},))....))))))....)))))))))).,{(({(,{|.|,||}|}|}}}|{(({...,||(((.((((((((((.(((((.(((((((((.(((((((...(((.(......,).))).))))))).)))}}.......,,)))).))))).))))).))))).))).,,.,,.{{{{{.....|||((((,{{.(((({.,....,.)))))}}...))))))).{{{{,(({(((((((((.....))))))).,,.||},............................{(((((((((...(((((....((...(((((((((((((((((((((((.{....}.)),.})))).))))))}.......,)),})))))))))))))....)))))))))}....)))}}.))))......(({{.{|,,,.))))))))))))))).)).)}}})))}..,,|}}}}}..........,,,.||}|..}}}}}.,,,,}}}},,...}.},,,.