Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002045.4
Sequence Length
1498 nt
GC Content
0.4887
ACAGUUGCUGCUAACUGCCCUGGUGUGUGUGAGGGAGAGAGAGGGAGGGAGGGAGAGAGAGCGCGCUAGCGCGAGAGAGCGAGUGAGCAAGCGAGCAGAAAAGAGGUGGAGAGGGGGGGAAUAAGAAAGAGAGAGAAGGAAAGGAGAGAAGGCAGGAAGAAGGCAAGGGACGAGACAACCAUGCUGUGCUGUAUGAGAAGAACCAAACAGGUUGAAAAAAAUGAUGACGACCAAAAGAUUGAACAAGAUGGUAUCAAACCAGAAGAUAAAGCUCAUAAGGCCGCAACCAAAAUUCAGGCUAGCUUCCGUGGACACAUAACAAGGAAAAAGCUCAAAGGAGAGAAGAAGGAUGAUGUCCAAGCUGCUGAGGCUGAAGCUAAUAAGAAGGAUGAAGCCCCUGUUGCCGAUGGGGUGGAGAAGAAGGGAGAAGGCACCACUACUGCCGAAGCAGCCCCAGCCACUGGCUCCAAGCCUGAUGAGCCCGGCAAAGCAGGAGAAACUCCUUCCGAGGAGAAGAAGGGGGAGGGUGAUGCUGCCACAGAGCAGGCAGCCCCCCAGGCUCCUGCAUCCUCAGAGGAGAAGGCCGGCUCAGCUGAGACAGAAAGUGCCACUAAAGCUUCCACUGAUAACUCGCCGUCCUCCAAGGCUGAAGAUGCCCCAGCCAAGGAGGAGCCUAAACAAGCCGAUGUGCCUGCUGCUGUCACUGCUGCUGCUGCCACCACCCCUGCCGCAGAGGAUGCUGCUGCCAAGGCAACAGCCCAGCCUCCAACGGAGACUGGGGAGAGCAGCCAAGCUGAAGAGAACAUAGAAGCUGUAGAUGAAACCAAACCUAAGGAAAGUGCCCGGCAGGACGAGGGUAAAGAAGAGGAACCUGAGGCUGACCAAGAACAUGCCUGAACUCUAAGAAAUGGCUUUCCACAUCCCCACCCUCCCCUCUCCUGAGCCUGUCUCUCCCUACCCUCUUCUCAGCUCCACUCUGAAGUCCCUUCCUGUCCUGCUCACGUCUGUGAGUCUGUCCUUUCCCACCCACUAGCCCUCUUUCUCUCUGUGUGGCAAACAUUUAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAGGAAAGAUCCCAAGUCAAACAGUGUGGCUUAAACAUUUUUUGUUUCUUGGUGUUGUUAUGGCAAGUUUUUGGUAAUGAUGAUUCAAUCAUUUUGGGAAAUUCUUGCACUGUAUCCAAGUUAUUUGAUCUGGUGCGUGUGGCCCUGUGGGAGUCCACUUUCCUCUCUCUCUCUCUCUCUGUUCCAAGUGUGUGUGCAAUGUUCCGUUCAUCUGAGGAGUCCAAAAUAUCGAGUGAAUUCAAAAUCAUUUUUGUUUUCCUCCUUUUCAAUGUGAUGGAAUGAACAAAAAGGAAAAAAUUCAAAAAACCCAGUUUGUUUUAAAAAUAAAUAAAUAAAGCAAAUGUGCCAAUUAGCGUAAACUUGCGGCUCUAAGGCUCCUUUUUCAACCCGAAUAUUAAUAAAUCAUGAGAGUAAUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-464.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -492.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 330.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((..((.(((.(((.......(((((((((((((((((((((((((((((((.(.(((((.(.(.(((((.(.....(((.((..(((((...(((..(((.(((((((((...(((..(((.(((((((..(((.((((.((((((......(((.((..........)).)))((((((.((((((............(((((.............)))))................((((.....))))..........)))))).)).)))).......(((((.(((((.....(((((((((.............(((....))).........))).))))))....))).)).)))))........((((((.(...(.((((((((((.((((((.........((.((.((......)).)).))......))))))(((((.((((...)))).).)).)).)))))..))))).)...)))))))..((((((.....((((((((((..((((((........))))))....((((.((((.(.(((((((..(((........)))..))))).(((.((((.........))))...))).......((..((((((..(((((.........)))))..))))))))........(((..(((.(((((((..(.((((((((((.((.((.(((...((.(((..((((..((((.(((....))).))))....))))...)))))..)))))))))))))..((((..............))))..........((........))..))))).))))))))))..)))...)).))))).))))((((((........)).)))).........((..(((....)))..))..))))))))))))))))...)))))))))))))....)))))))..)))...)))....))))))))).)))..)))...)))))..)).))))))))).)...).))))))))))))))))))((((.....))))...................((......(((.(((((.((((.(((((.......))))).))))...))))).)))......)).(((((((.(.((((((......)))))).).)))))))...((((((.(((.((....)).))).))))))(((.(((((....)).))))))..)))))))))))))))))))....))).).))))..))...(((((((((((..((((((...((((((..((((((........)))))).)))))).))))))....))).))))))))....((((((((..................((((((((((............))))))))))..(((....((((((....))).)))....)))))))))))..........................))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((({{{(..{{,|{.,(((.,.....(((((((((((((((((((((((((((((((.(.(((((.(.(.({({(.{{,.{.{((.((..(((((...(((..(((.(((((((((...(((..(((.(((((((..(((.((({{((((((.....{(((.((..........)).)))|(((((.((((((...,,,{.....||||,..........,..}}|||,......,........|{{|.,,..)))}..........)))))).))}})),.......{((((.(((((.....(((((((((.............(((....}}),,.......))).)))))).,..))),}).)))))........((((((.,...(.((((((((((.((((((.........((.((.((......)).)).))....,.)))))){{{{,.((((,..,}}}.}.}),)),)))))..))))).)...}))))))..((((({....,((((((((((..((((((........)))))),((((((.((((.((((((((,{.((.(..((,{(((.((((.{.(((((..((((.(((....((({.....{,....,,{{..((((((..(((((.........)))))..))))))}}......})))....))),},}}}.))))).}.))))..))))))..}.,,,)).,,...)))))))).((((....(((....))}}}}),,.....)))).)))))).,.{((((...,{{,...........,..)))}}...,.....,........{{{{{{(((((..........)))).....{{{(.....,.(((({(........)}.))))...)))).......,))))))).......))))))))))))))))...)))))))))))))..}})})))))..)))...)))....))))))))).)))..)))...)))))..)).))))))))).}.}.}.)))))))))))))))))){(((.....}))}...................(({{{({..,({(((((,(({{.{{{{{,,,....}}})}.}))),,,||||}|||}.,,,}}})}||,{{{{.,.((((((......)))))).)}))),,))}}}||{{{({(,({(,{,,..,.))).))))))|,({(((((...,)).,.)))).,)))))))))))))))))))..,.})}.}.}})}..))}.,(((((((((((.{((((((...{{{{{{..((({((,..,,,,,}}}})),))}})),)))))),}}}})).)))))))),...{(((((((..................((((((((((............)))))))))),.(((....((((((....)))},))....))))))))))},.....................,,,.,,,,,},..
Back