Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002084.5

Sequence Length

1603 nt

GC Content

0.5565

AGACGGACGGUGGCCAGGGAUCAGGCAGCGGCUCAGGCGACCCUGAGUGUGCCCCCACCCCGCCAUGGCCCGGCUGCUGCAGGCGUCCUGCCUGCUUUCCCUGCUCCUGGCCGGCUUCGUCUCGCAGAGCCGGGGACAAGAGAAGUCGAAGAUGGACUGCCAUGGUGGCAUAAGUGGCACCAUUUACGAGUACGGAGCCCUCACCAUUGAUGGGGAGGAGUACAUCCCCUUCAAGCAGUAUGCUGGCAAAUACGUCCUCUUUGUCAACGUGGCCAGCUACUGAGGCCUGACGGGCCAGUACAUUGAACUGAAUGCACUACAGGAAGAGCUUGCACCAUUCGGUCUGGUCAUUCUGGGCUUUCCCUGCAACCAAUUUGGAAAACAGGAACCAGGAGAGAACUCAGAGAUCCUUCCUACCCUCAAGUAUGUCCGACCAGGUGGAGGCUUUGUCCCUAAUUUCCAGCUCUUUGAGAAAGGGGAUGUCAAUGGAGAGAAAGAGCAGAAAUUCUACACUUUCCUAAAGAACUCCUGUCCUCCCACCUCGGAGCUCCUGGGUACAUCUGACCGCCUCUUCUGGGAACCCAUGAAGGUUCACGACAUCCGCUGGAACUUUGAGAAGUUCCUGGUGGGGCCAGAUGGUAUACCCAUCAUGCGCUGGCACCACCGGACCACGGUCAGCAACGUCAAGAUGGACAUCCUGUCCUACAUGAGGCGGCAGGCAGCCCUGGGGGUCAAGAGGAAGUAACUGAAGGCCGUCUCAUCCCAUGUCCACCAUGUAGGGGAGGGACUUUGUUCAGGAAGAAAUCCGUGUCUCCAACCACACUAUCUACCCAUCACAGACCCCUUUCCUAUCACUCAAGGCCCCAGCCUGGCACAAAUGGAUGCAUACAGUUCUGUGUACUGCCAGGCAUGUGGGUGUGGGUGCAUGUGGGUGUUUACACACAUGCCUACAGGUAUGCGUGAUUGUGUGUGUGUGCAUGGGUGUACAGCCACGUGUCUACCUAUGUGUCUUUCUGGGAAUGUGUACCAUCUGUGUGCCUGCAGCUGUGUAGUGCUGGACAGUGACAACCCUUUCUCUCCAGUUCUCCACUCCAAUGAUAAUAGUUCACUUACACCUAAACCCAAAGGAAAAACCAGCUCUAGGUCCAAUUGUUCUGCUCUAACUGAUACCUCAACCUUGGGGCCAGCAUCUCCCACUGCCUCCAAAUAUUAGUAACUAUGACUGACGUCCCCAGAAGUUUCUGGGUCUACCACACUCCCCAACCCCCCACUCCUACUUCCUGAAGGGCCCUCCCAAGGCUACAUCCCCACCCCACAGUUCUCCCUGAGAGAGAUCAACCUCCCUGAGAUCAACCAAGGCAGAUGUGACAGCAAGGGCCACGGACCCCAUGGCAGGGGUGGCGUCUUCAUGAGGGAGGGGCCCAAAGCCCUUGUGGGCGGACCUCCCCUGAGCCUGUCUGAGGGGCCAGCCCUUAGUGCAUUCAGGCUAAGGCCCCUGGGCAGGGAUGCCACCCCUGCUCCUUCGGAGGACGUGCCCUCACCCCUCACUGGUCCACUGGCUUGAGACUCACCCCGUCUGCCCAGUAAAAGCCUUUCUGCAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-596.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -624.36

Frequency: 0.0000

Diversity: 367.73

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((..((((((((((((((((..((.((((((((....)))))).((((((.....((((((((((((((((.(((((((((....(((.(((............))).)))..))))).))))))))))).........((((.......)))).))))))))).....).))))).......(((((.((((..(((.(((((((((((((........)))))......(((((.((((((...(((((...........)))))))))))))))).(((((...)))))(((.((((......)))).)))......(((((((.((((....((((.((.(((((((((.((((((((...((....((.....))))...)))).)))).))))))....................))).)))))).)))).)))))))((((((..(((((((....))).)))))))))))))))))).)))..(((((((((....(((((.((((((.(((...(((.........((((.((.((((.((((...((((.(((((((......(((((......)))))..(((.(((((((((((((....))))))).))))))((..(((((.....)))))..))((((.....((((.....))))))))...))).....(((((...))))).....)))))))))))..)))).)))).))..))))..........)))...)))(((((((((........(((((((((((..(((((...((.(((.....((((........))))..))).))....))))).)))))))))))((((((..((((((((((((((...(((((.((.....)))))))....)))))))).)).)))).)))))))))).)))))...((((((((((...((.(....).))...))))))))))(((((((((.(((......))).))))))))).......)))))).))))).......((.(((((.(((((((.((.((((((.((.((......)).)).)))))).)).))).....(((.......)))......(((........))).......)))).))))).))....))))))))).(((((((........((((((.(((.........))).)))))).)))))))......(((....)))((((((....))))))........................)))))))))..(((.(((((((((.((((..............((((..(((.(((....((..(((.......)))..)).....))).))))))).......((((....).)))...(((((((((((((((((((.(.((((((..((....((((....)))))).)))))))))))(((((((.(((((((((((.............))))..))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))....))))))))).))..))))))).)))))........))))))))))((.(((.(((....))))))..)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((..((((((((((((((((..((.((((((((....)))))).((((({.....((((((((((((((((.(((((((((....(((.(((............))).)))..))))).))))))))))}.........((((.......)))),))))))))).....).))))).......(((((.((((.,,((,....|||{(((({(,.{.{(((((((({,,..(((((.((((((...(((((.,.....,...)))))))))))))))).(((((...)))))(((.((((......)))).)))...((((((((((.((((....((((.((.(((((((((.((((((((...((....{|.....}}))...)))).)))).))))))|,....,,.,.,......}.))).)))))).)))).))))))).})).....,{,{{.....,}),)})))))))))),..{((,(({..(((((((((....(((((.(((((({(((,{.{{,,..,,,,..((((.({.((((.((((...((((.(((((((...{{{(((({....,.}||||.|{,,..,{{{{(((((({....}))))))||||||,((||(((((.....}}))},|||{|||||.|||||{,....}}))}}}}...}||.....(((({...})))).....))))))))))}..)))).)))).))..))))........,.}||..,|,,{{{{{((((..,.,|,,{((((((((((..(((((...((.(((.....((((........))))..))).))....))))).))))))))))}{,{{{...((((((((((((((...(((((.({.....},)))))....)))))))).)).)))),)}))))})))|))))),..((((((((((..,((.{....},))...))))))))))|((((((((.(((......))).))))))))).}))},.}))))).))))).,,..,,{(.(((((.((((({(.((.((((((.((.({......}}.)).)))))).)).}},.....{{{.....,.,,,......(((........))).....,})))).))))).))..,,))))))))).,{(({,,,,{{,...,|||||.||{.........})),)}))),.,,|||||......{||,,..))}((((((....)))))).........)))})},........))))))))),.||,|((({{{{||.,{{(,{{{{{{..,........,.((({.,,,,(.({{......}}}.}}}))},,......))..))))))......,(((,.{,{..|||,..(((((((((((((((,{({.{.((({((,,{(,...((((....)))))).)))))))))),(((((((.(((((((((((.............))))..)))))))))))))))))))))))))))))}}}}.))})}.,}}))))),.}),))..))))))).)))))........))))))))))((.(((.{{,....}}})))..)).