Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002085.5

Sequence Length

851 nt

GC Content

0.6228

AUUGGUCGGCUGGACGAGGGGAGGAGCCGCUGGCUCCCAGCCCCGCCGCGAUGAGCCUCGGCCGCCUUUGCCGCCUACUGAAGCCGGCGCUGCUCUGUGGGGCUCUGGCCGCGCCUGGCCUGGCCGGGACCAUGUGCGCGUCCCGGGACGACUGGCGCUGUGCGCGCUCCAUGCACGAGUUUUCCGCCAAGGACAUCGACGGGCACAUGGUUAACCUGGACAAGUACCGGGGCUUCGUGUGCAUCGUCACCAACGUGGCCUCCCAGUGAGGCAAGACCGAAGUAAACUACACUCAGCUCGUCGACCUGCACGCCCGAUACGCUGAGUGUGGUUUGCGGAUCCUGGCCUUCCCGUGUAACCAGUUCGGGAAGCAGGAGCCAGGGAGUAACGAAGAGAUCAAAGAGUUCGCCGCGGGCUACAACGUCAAAUUCGAUAUGUUCAGCAAGAUCUGCGUGAACGGGGACGACGCCCACCCGCUGUGGAAGUGGAUGAAGAUCCAACCCAAGGGCAAGGGCAUCCUGGGAAAUGCCAUCAAGUGGAACUUCACCAAGUUCCUCAUCGACAAGAACGGCUGCGUGGUGAAGCGCUACGGACCCAUGGAGGAGCCCCUGGUGAUAGAGAAGGACCUGCCCCACUAUUUCUAGCUCCACAAGUGUGUGGCCCCGCCCGAGCCCCUGCCCACGCCCUUGGAGCCUUCCACCGGCACUCAUGACGGCCUGCCUGCAAACCUGCUGGUGGGGCAGACCCGAAAAUCCAGCGUGCACCCCGCCGGAGGAAGGUCCCAUGGCCUGCUGGGCUUGGCUCGGCGCCCCCACCCCUGGCUACCUUGUGGGAAUAAACAGACAAAUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-358.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -370.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 202.40

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((((((.((.(.(((((.((((..(((((...((......))...))))).))))..))))).)))))......)))))))..((.((((((((((.(((((((.(((((((..((((((((((..((((((((.((((.....)))).)).))))))(((((...((((.....(((.....)))....(((((((((((((....(((((.......)))))...)))))))).))))).....))))(((((.....))))).........((((((((((((((((..((((...........))))..))))))))))))))))((.(((((..(((((((...........)))))))))))).))..)))))..((((............))))..((((((.....(((((..........((((((((.....))).)))))(((.......)))....(((((((((((((((....)))))..((((((((..(((((..(((((....(((((((.(((((...((((((.(((((((.((.....))..((.(.(((((((...))))))).).))...)))))))...))))))((((((((...........)).))))))..)))))...)).)))))....))).))....)))))..))))))))...)))))).)))).....)))))....))))))...(((.(((((((((...((.(.........).))...))))))))))))..))))))..)))).))))))).)))).))).)))))...(((..((......))))).....)))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,(((((((((.{{.((((.((((((,..||||}}..,|}}},,,||...,}}}}.}})),|}},,||}|}}|,.,...})}))))|.,{.{{{({(((((.(((((((.(((((((..((((((((((..((((((({{((((.....)))).),,))))))(((({...{,{(.{,..(((.....)))....(((((((((((((....(((((.......)))))...)))))))).))))).....}}}}(((((.....))))).........((((((((((((((((..((((..,.....,..))))..))))))))))))))))({.(((((,,(((((((...........)))))))))))}.)).,))}}}..((({............)))}..((((((.....(((((..........((((((((.....))).))))){(({......})).,,,(((((((((((((((....)))))..((((((((..(((((..,((({....{|||{{,.({(((,{{({{{{|,|||||{{.{{.....}}..((,(.(({((((..,,||||||.|{},.{{}}|||||...|||}||((({{,.((......,,,.)),)),)))},)))}),.,),,)))))..,,)))})),,..)))))..))))))))...))))))}}))).....)))))....))))))...(((.(((((((((...{(.{{........).)),..))))))))))))..))))))..)))).))))))).)))).))).))))),,||||}||},.,,..}|))).....})}))},......