Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002104.3
Sequence Length
1506 nt
GC Content
0.4050
AGAAUCUUCUUCCUUCAUCACAGGAUCAACACAUUUCAUCUGGGCUUCUUAAAUCUAAAUCUUUAAAAUGACUAAGUUUUCUUCCUUUUCUCUGUUUUUCCUAAUAGUUGGGGCUUAUAUGACUCAUGUGUGUUUCAAUAUGGAAAUUAUUGGAGGGAAAGAAGUGUCACCUCAUUCCAGGCCAUUUAUGGCCUCCAUCCAGUAUGGCGGACAUCACGUUUGUGGAGGUGUUCUGAUUGAUCCACAGUGGGUGCUGACAGCAGCCCACUGCCAAUAUCGGUUUACCAAAGGCCAGUCUCCCACUGUGGUUUUAGGCGCACACUCUCUCUCAAAGAAUGAGGCCUCCAAACAAACACUGGAGAUCAAAAAAUUUAUACCAUUCUCAAGAGUUACAUCAGAUCCUCAAUCAAAUGAUAUCAUGCUGGUUAAGCUUCAAACAGCCGCAAAACUCAAUAAACAUGUCAAGAUGCUCCACAUAAGAUCCAAAACCUCUCUUAGAUCUGGAACCAAAUGCAAGGUUACUGGCUGGGGAGCCACCGAUCCAGAUUCAUUAAGACCUUCUGACACCCUGCGAGAAGUCACUGUUACUGUCCUAAGUCGAAAACUUUGCAACAGCCAAAGUUACUACAACGGCGACCCUUUUAUCACCAAAGACAUGGUCUGUGCAGGAGAUGCCAAAGGCCAGAAGGAUUCCUGUAAGGGUGACUCAGGGGGCCCCUUGAUCUGUAAAGGUGUCUUCCACGCUAUAGUCUCUGGAGGUCAUGAAUGUGGUGUUGCCACAAAGCCUGGAAUCUACACCCUGUUAACCAAGAAAUACCAGACUUGGAUCAAAAGCAACCUUGUCCCGCCUCAUACAAAUUAAGUUACAAAUAAUUUUAUUGGAUGCACUUGCUUCUUUUUUCCUAAUAUGCUCGCAGGUUAGAGUUGGGUGUAAGUAAAGCAGAGCACAUAUGGGGUCCAUUUUUGCACUUGUAAGUCAUUUUAUUAAGGAAUCAAGUUCUUUUUCACUUGUAUCACUGAUGUAUUUCUACCAUGCUGGUUUUAUUCUAAAUAAAAUUUAGAAGACUCUCUGUUUGUCUUUUAUCACAUGAAGUAAUAUCUGCCCCCAUUGCACCCACACUCGCCAAAGGGCAAUAAGGUCACUGAAUAAAACAGUAAUGGUACCACCUUCAACUAGGUGUAACUUCUGCUGGAUCAUCCUAAGUUGUUGGGUUGUUUUCUUUUCAUUGUUGUGAUAACAUUGAACAUGAGAUAGGCCCUUGCAACAAAUGUUUAAGGGUAUGAUACAUUAUUGUUAACUAUAGGCAUGAUCUUGCAGUGCAGAUCUCUAGAACUGCUUCAUCUCAUAUAAAUGAAACUUUAUGCCAGUUGAAUAGCAGCUCUCUAUUUCCCCACCACCCCCAUCCUCUGGCAACCCCAUUCUACUCUAAGCUUCUAUGAGUUUGUAUUUUUUAAAUAUAAAUCAUAAAUAUAAAUAUCCUAAUUCAAGCAAGCAGCUUAUACAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-381.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -413.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 317.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((.......)))).............(((((..(((((..................((((........((((.(((((((((..(((((.....((((((((.((((((...)))))).))))))))..)))))....))))))))).)))).))))....(((((((((.((((((((((((((...(.(((((((........(((((((((((((((((((.....((((((((((.((((...((((....)))).......((....))......))))..))))))))))..))))).))...(((..(((...)))..)))))))))..))))))....((((..................))))..(((((..(((((.......(((....)))......)))))..)))))....((((((((...((..(((....)))..)).)))((((..(((((...........)))))....))))(((........)))....)))))(((((.((((....(((((.((....(.(((((((((((((((((.((((((.((((((((......)))....((((((((....).))))))).....))))).)))(((((..............((((((..(((.....)))...))))))))))).))).))).))))))..)))))))))....)))))))....)))).))))).))))))).)...))))))))))))))(((((...)))))...)))))))))................)))))...)))))...(((....((((((...(((((...........(((.((((((....)))))).))))))))...))))))......)))..(((.(((.((..(((.(((((((((((..(((((((((((.....(((((((.....(((((....)))))......(((((..((..(((((........)))))..))..)))))......((((((((((.((((((((...........((((((((.........)))))))).................(((((.....((..........))....)))))...((....)))))))))))))).)))))).(((((......)))))......((((.(((((((((((.(((((.(((((..((((..((((.(((((...))))).))))...))))..)))))..)))))......((((.((((........)))).))))...)))).))))))).)))).((((.((....)).))))......((((....)))).......((((((..((((((.......))))................))..)))))))))))))....))))..)))).(((((.(((((((((...))))))))))))))..)))..))).)))))))).)))..))))).))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{....,..((((.......))))...,......|,.(((((..(((((..................,||,...|,,,,((((.{(((({(({..(((((..,,,{(((((((.((((((...)))))).)))))))),.)))))....})))))))),)))).|},.....(((((((((.{(((((((((((((...{.(((((((.....,..{(((({(((((((({((((..,,.((((((((((.((((...(({(....}}}|,......|{|...,,...})}))))..)))))))))).,))))).}},,.|{{..(((...}}}.,)))}}))|}|.,}}}}}..|,|||{..................)))}..|{|{{..{{{{({..,|..{{{..,|)},..,.,.|))))..))),}....(((((({{...{{..,,,....|}}..}}.))),{{,..,.(((((.,,........)).)))))|}|(((........)))}.,,)))))(((((.((((....(((({{((....(.(((((((((((((((((.(({(((.(((({,{({,....|||....((((((((....),})))))),,...))))).)))(((((..............{(((((..(((.....))),..))))))))))).))).))),})))))..)))))))),....)))))))....)))).))))).))))))).}...)))))))))))))|(((((...)))))...)))))))))..,,,....,......})))}...))))}...(((..{,((((((...{((((...........(((.((((({....)))))).))}))))}...))))))..,,..)))..{((.(((.((..(((.(((((((((((..,,,((((((((.....(((((((,,,..{(((({{,.|||||.,....{{{,{{{((..(((((........)))))..)}.,}||}}......((((((((({{((((((((...........((((((((.........))))))))......,..,,......(((((...{,((..........)}.,..)))))...,|....}})))))))))))),}))))).(((((......)))))......{(((.(((((((((({.(((((.(((((..((((..((((.(((({...})))).)))).,.))))..)))))..)))))....{,{(((.((((........)))).)))),..)))).))))))).))))}||||,,,...{||.||||{(((.{(..{{{{{|,,,...,}}}||,,||.}||,.|}}}}.,,},,,.....................,))),,)))))))....))))..)))).(((((.(((((((({...})))))))))))))..,,,..})),))}))))).)))..))))).))).....
Back