Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002116.8

Sequence Length

1535 nt

GC Content

0.5909

AGAUUCUCCCCAGACGCCGAGGAUGGCCGUCAUGGCGCCCCGAACCCUCCUCCUGCUACUCUCGGGGGCCCUGGCCCUGACCCAGACCUGGGCGGGCUCCCACUCCAUGAGGUAUUUCUUCACAUCCGUGUCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCUUCAUCGCCGUGGGCUACGUGGACGACACGCAGUUCGUGCGGUUCGACAGCGACGCCGCGAGCCAGAGGAUGGAGCCGCGGGCGCCGUGGAUAGAGCAGGAGGGGCCGGAGUAUUGGGACCAGGAGACACGGAAUGUGAAGGCCCAGUCACAGACUGACCGAGUGGACCUGGGGACCCUGCGCGGCUACUACAACCAGAGCGAGGCCGGUUCUCACACCAUCCAGAUAAUGUAUGGCUGCGACGUGGGGUCGGACGGGCGCUUCCUCCGCGGGUACCGGCAGGACGCCUACGACGGCAAGGAUUACAUCGCCCUGAACGAGGACCUGCGCUCUUGGACCGCGGCGGACAUGGCGGCUCAGAUCACCAAGCGCAAGUGGGAGGCGGCCCAUGAGGCGGAGCAGUUGAGAGCCUACCUGGAUGGCACGUGCGUGGAGUGGCUCCGCAGAUACCUGGAGAACGGGAAGGAGACGCUGCAGCGCACGGACCCCCCCAAGACACAUAUGACCCACCACCCCAUCUCUGACCAUGAGGCCACCCUGAGGUGCUGGGCCCUGGGCUUCUACCCUGCGGAGAUCACACUGACCUGGCAGCGGGAUGGGGAGGACCAGACCCAGGACACGGAGCUCGUGGAGACCAGGCCUGCAGGGGAUGGAACCUUCCAGAAGUGGGCGGCUGUGGUGGUGCCUUCUGGAGAGGAGCAGAGAUACACCUGCCAUGUGCAGCAUGAGGGUCUGCCCAAGCCCCUCACCCUGAGAUGGGAGCUGUCUUCCCAGCCCACCAUCCCCAUCGUGGGCAUCAUUGCUGGCCUGGUUCUCCUUGGAGCUGUGAUCACUGGAGCUGUGGUCGCUGCCGUGAUGUGGAGGAGGAAGAGCUCAGAUAGAAAAGGAGGGAGUUACACUCAGGCUGCAAGCAGUGACAGUGCCCAGGGCUCUGAUGUGUCCCUCACAGCUUGUAAAGUGUGAGACAGCUGCCUUGUGUGGGACUGAGAGGCAAGAGUUGUUCCUGCCCUUCCCUUUGUGACUUGAAGAACCCUGACUUUGUUUCUGCAAAGGCACCUGCAUGUGUCUGUGUUCGUGUAGGCAUAAUGUGAGGAGGUGGGGAGACCACCCCACCCCCAUGUCCACCAUGACCCUCUUCCCACGCUGACCUGUGCUCCCUCCCCAAUCAUCUUUCCUGUUCCAGAGAGGUGGGGCUGAGGUGUCUCCAUCUCUGUCUCAACUUCAUGGUGCACUGAGCUGUAACUUCUUCCUUCCCUAUUAAAAUUAGAACCUUAGUAUAAAUUUACUUUCUCAAAUUCUUGCCAUGAGAGGUUGAUGAGUUAAUUAAAGGAGAAGAUUCCUAAAAUUUGAGAGACAAAAUAAAUGGAAGACAUGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-621.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -647.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 303.67

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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