Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002176.4
Sequence Length
839 nt
GC Content
0.4172
AUUCUAACUGCAACCUUUCGAAGCCUUUGCUCUGGCACAACAGGUAGUAGGCGACACUGUUCGUGUUGUCAACAUGACCAACAAGUGUCUCCUCCAAAUUGCUCUCCUGUUGUGCUUCUCCACUACAGCUCUUUCCAUGAGCUACAACUUGCUUGGAUUCCUACAAAGAAGCAGCAAUUUUCAGUGUCAGAAGCUCCUGUGGCAAUUGAAUGGGAGGCUUGAAUACUGCCUCAAGGACAGGAUGAACUUUGACAUCCCUGAGGAGAUUAAGCAGCUGCAGCAGUUCCAGAAGGAGGACGCCGCAUUGACCAUCUAUGAGAUGCUCCAGAACAUCUUUGCUAUUUUCAGACAAGAUUCAUCUAGCACUGGCUGGAAUGAGACUAUUGUUGAGAACCUCCUGGCUAAUGUCUAUCAUCAGAUAAACCAUCUGAAGACAGUCCUGGAAGAAAAACUGGAGAAAGAAGAUUUCACCAGGGGAAAACUCAUGAGCAGUCUGCACCUGAAAAGAUAUUAUGGGAGGAUUCUGCAUUACCUGAAGGCCAAGGAGUACAGUCACUGUGCCUGGACCAUAGUCAGAGUGGAAAUCCUAAGGAACUUUUACUUCAUUAACAGACUUACAGGUUACCUCCGAAACUGAAGAUCUCCUAGCCUGUGCCUCUGGGACUGGACAAUUGCUUCAAGCAUUCUUCAACCAGCAGAUGCUGUUUAAGUGACUGAUGGCUAAUGUACUGCAUAUGAAAGGACACUAGAAGAUUUUGAAAUUUUUAUUAAAUUAUGAGUUAUUUUUAUUUAUUUAAAUUUUAUUUUGGAAAAUAAAUUAUUUUUGGUGCAAAAGUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-224.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -242.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 261.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.............((((((((((....((((..(((((((((((.((((((.(((((((((((((((...)))))))...)).)))))).))).......)))..)))))))))))..........(((((.......)))))....(((..(((........)))..))).(((((((((((((.(((((..(((((((.........)))))))((((((...((.(((((.((....((((........))))))))))))).)))))).((....))((((((...((((.....((((.((((((((((...))))).(((((....((((((...(((((((((((..((((((((((....))))).)))))....))))((((((((((((...((((((((.(((((((((.....))))))((((.((.(..((.......((((.((((.....)))).))))........))..).)).)))).....)))..)))))))).)))))).)))).))....))))))).))))))((((((...))))))))))).....))))).))))...))))..))))))...................(((((((((.....................)))))))))..))))).)))))).)))))))...))))..))))..(((.(((..(((.....)))..))).)))...((((...))))..)))))).(((((((((.(((((((((.....((((((.(((((.....)))))..)))))).....))))))))).........)))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,{{,..((,..(((((({,(((....}}},.(((((((((((.((((((.(((((((((((((((...}))))))...)),}))))).))).......)))..)))))))))))....,.....(((((.......))))).....,((((({,...........,}}}}||{{{{{(((((({((({(.,({{{{{{|||..,,,.}}}||||(({{{,...{{,||||,.{,.,,(((((........)))))}))}))))}}}}}||,{,{{{,,{(((((({{.{(((((,..((((.((((({{(((...}}}}}.(((((....{((((({,.,{((((({(((,.((((((((((....)))))},)))).,,.}}))||(((((((((({..((((((((.{{.((((((.....))))))||||.{{{{{{{........((((.((((.....)))).))))|,.....,}},.|.||,}}}),,...}}}..)))))))),)))))).)))).},....))))))),}))))}((((((...))))))))))).,...))))).))))...))))..|||,,,.....}},.......,...{((((((({..............,..,...))))))))))})))))}))))}|,}}}}}}},|,||||.,|,|,,.,(({({,..|||},,..}))}.,}),,))},.,|||.,,))},..)))))).}},)}))}|,,,,{{{,,({{.{{{{(((..{{((,,{{{{{{{||,,,{,{|||....,.,}},)))))))}.,}}}.))))))),),,..},,.
Back