Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002181.4

Sequence Length

2473 nt

GC Content

0.6603

ACUCGGCCCCGGGCUGCGCCGCAGACGGCAGCAGCUCCCGCUCCGCCCGAGCCGCCUGACCGCCGGGCCGGGGUGCUAACCGCGGGGCCCUGCAGCCCGCCGGCCCGGCCAGCCCAGCCCAGCCCGGCGGCCCGCAGCCCCGCCGCCCGCCGCCCCCCGCCGCCGCCGCGUUGCCAAAACAAACGGGCCGGCCUAUUUAUUGGCGGCCGGCGAGCCCGGCAGCUCAGAGUCGAGGCGCCGAGGGGGACAGCGCGCCGCCACCAGCUCGGGCCCUGGGCCCCCGCCCCGCACUUGAGUCCCGCCGGCCCUGGCCGCACCACGCCGCCCAUGGCGCCCCCGCCUGGAGCCCCCCGGAGCCACCCGGACGCCUGAGCCCCCGCAGCGCUCCCGUCGACGCGCCUGCCCAUCAGCCCACCAGGAGACCUCGCCCGCCGCUCCCCCGGGCUCCCCGGCCAUGUCUCCCGCCCGGCUCCGGCCCCGACUGCACUUCUGCCUGGUCCUGUUGCUGCUGCUGGUGGUGCCGGCGGCAUGGGGCUGCGGGCCGGGUCGGGUGGUGGGCAGCCGCCGGCGACCGCCACGCAAACUCGUGCCGCUCGCCUACAAGCAGUUCAGCCCCAAUGUGCCCGAGAAGACCCUGGGCGCCAGCGGACGCUAUGAAGGCAAGAUCGCUCGCAGCUCCGAGCGCUUCAAGGAGCUCACCCCCAAUUACAAUCCAGACAUCAUCUUCAAGGACGAGGAGAACACAGGCGCCGACCGCCUCAUGACCCAGCGCUGCAAGGACCGCCUGAACUCGCUGGCUAUCUCGGUGAUGAACCAGUGGCCCGGUGUGAAGCUGCGGGUGACCGAGGGCUGGGACGAGGACGGCCACCACUCAGAGGAGUCCCUGCAUUAUGAGGGCCGCGCGGUGGACAUCACCACAUCAGACCGCGACCGCAAUAAGUAUGGACUGCUGGCGCGCUUGGCAGUGGAGGCCGGCUUUGACUGGGUGUAUUACGAGUCAAAGGCCCACGUGCAUUGCUCCGUCAAGUCCGAGCACUCGGCCGCAGCCAAGACGGGCGGCUGCUUCCCUGCCGGAGCCCAGGUACGCCUGGAGAGUGGGGCGCGUGUGGCCUUGUCAGCCGUGAGGCCGGGAGACCGUGUGCUGGCCAUGGGGGAGGAUGGGAGCCCCACCUUCAGCGAUGUGCUCAUUUUCCUGGACCGCGAGCCUCACAGGCUGAGAGCCUUCCAGGUCAUCGAGACUCAGGACCCCCCACGCCGCCUGGCACUCACACCCGCUCACCUGCUCUUUACGGCUGACAAUCACACGGAGCCGGCAGCCCGCUUCCGGGCCACAUUUGCCAGCCACGUGCAGCCUGGCCAGUACGUGCUGGUGGCUGGGGUGCCAGGCCUGCAGCCUGCCCGCGUGGCAGCUGUCUCUACACACGUGGCCCUCGGGGCCUACGCCCCGCUCACAAAGCAUGGGACACUGGUGGUGGAGGAUGUGGUGGCAUCCUGCUUCGCGGCCGUGGCUGACCACCACCUGGCUCAGUUGGCCUUCUGGCCCCUGAGACUCUUUCACAGCUUGGCAUGGGGCAGCUGGACUCCGGGGGAGGGUGUGCAUUGGUACCCCCAGCUGCUCUACCGCCUGGGGCGUCUCCUGCUAGAAGAGGGCAGCUUCCACCCACUGGGCAUGUCCGGGGCAGGGAGCUGAAAGGACUCCACCGCUGCCCUCCUGGAACUGCUGUACUGGGUCCAGAAGCCUCUCAGCCAGGAGGGAGCUGGCCCUGGAAGGGACCUGAGCUGGGGGACACUGGCUCCUGCCAUCUCCUCUGCCAUGAAGAUACACCAUUGAGACUUGACUGGGCAACACCAGCGUCCCCCACCCCCGUCGUGGUGUAGUCAUAGAGCUGCAAGCUGAGCUGGCGAGGGGAUGGUUGUUGACCCCUCUCUCCUAGAGACCUUGAGGCUGGCACGGCGACUCCCAACUCAGCCUGCUCUCACUACGAGUUUUCAUACUCUGCCUCCCCCAUUGGGGAGGGCCCAUUCCAUCCAUCUUAGGCCCCUUUGGGUGGGCUUGCGCCUCAGUUGAUGCUGCUAAAUUCCCUGGGAGCCAGCAUGGAUCUGGCUGGACCCGAUGCUGUCCAGAACUGGGAAGGCCACAGGGGUGGGGCAGCCAUCCCGGCCAUUCUGAGGUAUGACAUUCCUCCCCGGCCACACUCCUCAAGACACAUCCAGAGACUGUUGCUGUCUGUGGGCAGAGUUCUGUGUUCUGGCCAAUGUGACCGUAGUGCCGGGGACUGGGGGAGGUGGGUUGGAUGUGCUUGCCACCCCCCCGGCUAAGCUCCCCCUUCUGCUGAACCAUGAUCCCCACCCCCUCCGCCGGUCAGUCUCCCAUACCUUAUUUAUUGGAGUGGAGGGGGAAGCCCAUGGGAGAAUUUUGGGGAUGUUUUGGUCUUUUCUUCCUUUUGUAAUAAAAAUUAUUUAAGUUGUUAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1146.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1180.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 729.22

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((((..(((((((((((....)))).)))))))..((((.....))))((((((((.(((((((...(((....)))(((((((..(((.(.((((((((..(((.......)))..).))))))).).))))))))))((((.((((((.......((((((.((((.........)))))).)))).........)))))).)))).))))))).).)))).).))(((((((((.((((.....((((.((.....((((((((...(((((...((...((......))...)).))))).(((........)))(((((.((((....))))))).))...((((......))))..))))))))....)).)))))))).)))..))))))((((.((..(....((((((((...((.((((.(((((((((((((((((((((.((.....(((((((((((((((((((((((....)))..)))).......((((((((((...)))))))))).))))))).)))))))))((((((((((.(((((((.(((...(((...((...(((((.((((((((((.(((((.((((.((......((((((.((......))))))))..))))))))).)).))))..(.((((((((((((.(((((.((....)).))))......................((.(((((......)))))))((((.((.(((.((.(..((((.((((((((.....(((....))).....)))))........))).))))..).))))))).))))).)))))))))))).)..)))).)).))))).....(((((((.(((....((((((((.....((((((((((((((.(...((.........))...).))))).....(((.((((.((((.(((((..(((((((.(((((((((((((((.(........).)))))))(((((((((((.((((((.......((((.(((...((..((((((.........))))))..)).)))))))..(((((....))))).)))))).))))))).))))((((((((((((((((.(((((...(((((...(((((((((((((.((((...)))))))..(((.....))).....((((((..(.(((((((...(((((...)))))...))))..))).)..)))))).)))))).......))))...)))))...))).)).)))..)))))))))))))...((((..((.(((((((((....)))))......)))).))..))))(((((..((((((....)))))))))))....))).))))).))..))))).))))).)))).)))).)))....)))))))))(((((....))))).........))).))))).))))))))))(((((((....)))))))))...))))))))))))).)))))))))).(((((..((((....)))).)))))...........)).)))).))))).)))......))))))))))))).))........((((((..((......)))))))).))))))))...)..)))))).(((((.(((((...((((..((((((((((((((((....)).))))....)))))))...)))..))))....)))))...)))))...(((((.(((.(((((((((((((.((((((.((((((.(((((((....(((....(((((((((((.(((((((...((((((((...(((..(..((((..((......))..))))..)..))))))))))).))))..((((........))))))))))))))))))..........(((((...)))))...((((...((((.(((((........)).)))))))))))....((((......))))..(((((((....))))))))))...))).)))).)))))).)))))).)).((((....))))(((((.((((((.....((((...)))).)))))).)).))).((((((........))))))..((.((((((((...(((((((.....))))))))))).)))).))............((((((((((((....(((.((((((((((.((((.......)))).))))........)))))).)))....))))........))))))))..(((((.(((((...(......)...)))))))))))))).))))))))))...)))))......(((((((....((((...(((...((((((.(((((........)).)))..)))))).)))....)))).....))))))).....))))........(((..(((((....)))))..)))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,{((({,{(((((((((((,,,,||||,|||||||.,((((,|,{{|}||.{.{{{,{.{((((((,{{(({{{{....(((({({.,{((.{,{|{|{|||,,{||..,,,,.|||,.||},|||||{},||}|||||||((((.((((((.......((((((.((((,........))))))}}))).........)))))).)))).}}|{(({.{({{,{.{,{||(({|{|{,{(((|.|,||{,|||{||....||{{||||.,,|{{|,...||}}.|,.,,,},}|,..|},|||||,{({.{{.....})|||{{{,((((,,,,}}}}})}.||{,{((((.|,,..}|||.|||||||||.,..||,||||||,,.||},.|||}||((((.{(,,({,..{{((((((...((,{({{,((({{{{||||{{{{{|||{{.||},,,.(((((((((((((((((((((({....)))..)))).......((((((((((...)))))))))).))))))).)))))))))((((((((((.((((((|{(({..,(((.,.({...(((((.((((((((((.(((((.((((.((......((((((,,(......})))))))..))))))))).)).))))..{.((((((((((((.,((((.{{....)).))))......................{{.(((((......))))))}{{{{.((,({{|.{,(,,(({{.((((((((.....(((....))).....)))))}.......|)).}}}}.,}.))))))).)))}}.}))))))))))}.,..)))).)).))))).....(((((((,(({.,..((((((((.....(((((((((({(((,(...{{.,,......,,..,|.}}})).....(((.((((.((((.(((((..(((((((.((((((((,((((((.(........).))))))|(((((((((((.,{((((......,((((.(((...((,.((((((........,))))))..}).))))))),,(((((....))))).))))}}.))))))).))))|(((((((((((((((.(((((...(((((..,(((((((((((((.((((...)))))))..(((,...,))).....((((((..{.(((((((...(((((...)))))...))))..))).}..)))))).)))))).......))))...)))))...))).)).)),},)))))))))))),...((((..((.(((((((((....)))))......)))).))..))))(((((..((((((....)))))))))))....))).))))).))..))))).))))).)))).)))).)))...,)))))))))(((((....))))).........))).))))).))))))))))(((((((....))))))))).,.))))))))))))).))))))))))|(((((..((((....)))).)))))..........,)),)))).))))),})),,,.,,)))))))}|||}|,||....}},|{||{((,.((......)}}})))),)}||||||,{.,..|||||},(((((.(((((.,,((((..((((((((((((((((....)).))))....))))))},,|))}.,))))....)))))...)))))}},|||||,|||}||{(({(|((({,.{{{(((.||{{((.(((((((...,(({....(((((((((((.(((({({...((((((((...(((..{..((((..((......))..))))..,..))))))))))}.))},..((((........)))))))))))))))))).|..|.,,,,(((((,..,))))....|{(|,,(({{.(({,,...}}..,}}.)))}))}}}},....((((......))))..(((((((....)))))))}}}...}}}.}}}}.}}}})).}}}}})))))})))},})))))|||{|,{{||{|||....|||,,.))))}})))}},|},}|}|{{((|{..,,.,.,||}}}}..{{,((({((((...(((((((.....))))))))))).}))),||,..,},,,..},||,|||||||{,..,,,|,.{{{{{{{{{{}||,|}},}},})))),)))|{{{,....}}}}})}))}},..,},).,}}}}))})))))),||(((((.(((((...(......)...))))))))))||||{||||||||},...,||},,((({{,,{,{,,((((((((((..,,.....{{{.,,,.......,}},)),))))))))))..,.,}}}}),,,.....,))))),},,,))))}........(((..(((((....)))))..)))..},,}}.