Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002227.4
Sequence Length
5092 nt
GC Content
0.4645
GCGUCGCUGAGCGCAGGCCGCGGCGGCCGCGGAGUAUCCUGGAGCUGCAGACAGUGCGGGCCUGCGCCCAGUCCCGGCUGUCCUCGCCGCGACCCCUCCUCAGCCCUGGGCGCGCGCACGCUGGGGCCCCGCGGGGCUGGCCGCCUAGCGAGCCUGCCGGUCGACCCCAGCCAGCGCAGCGACGGGGCGCUGCCUGGCCCAGGCGCACACGGAAGUGCGCUUCUCUGAAGUAGCUUUGGAAAGUAGAGAAGAAAAUCCAGUUUGCUUCUUGGAGAACACUGGACAGCUGAAUAAAUGCAGUAUCUAAAUAUAAAAGAGGACUGCAAUGCCAUGGCUUUCUGUGCUAAAAUGAGGAGCUCCAAGAAGACUGAGGUGAACCUGGAGGCCCCUGAGCCAGGGGUGGAAGUGAUCUUCUAUCUGUCGGACAGGGAGCCCCUCCGGCUGGGCAGUGGAGAGUACACAGCAGAGGAACUGUGCAUCAGGGCUGCACAGGCAUGCCGUAUCUCUCCUCUUUGUCACAACCUCUUUGCCCUGUAUGACGAGAACACCAAGCUCUGGUAUGCUCCAAAUCGCACCAUCACCGUUGAUGACAAGAUGUCCCUCCGGCUCCACUACCGGAUGAGGUUCUAUUUCACCAAUUGGCAUGGAACCAACGACAAUGAGCAGUCAGUGUGGCGUCAUUCUCCAAAGAAGCAGAAAAAUGGCUACGAGAAAAAAAAGAUUCCAGAUGCAACCCCUCUCCUUGAUGCCAGCUCACUGGAGUAUCUGUUUGCUCAGGGACAGUAUGAUUUGGUGAAAUGCCUGGCUCCUAUUCGAGACCCCAAGACCGAGCAGGAUGGACAUGAUAUUGAGAACGAGUGUCUAGGGAUGGCUGUCCUGGCCAUCUCACACUAUGCCAUGAUGAAGAAGAUGCAGUUGCCAGAACUGCCCAAGGACAUCAGCUACAAGCGAUAUAUUCCAGAAACAUUGAAUAAGUCCAUCAGACAGAGGAACCUUCUCACCAGGAUGCGGAUAAAUAAUGUUUUCAAGGAUUUCCUAAAGGAAUUUAACAACAAGACCAUUUGUGACAGCAGCGUGUCCACGCAUGACCUGAAGGUGAAAUACUUGGCUACCUUGGAAACUUUGACAAAACAUUACGGUGCUGAAAUAUUUGAGACUUCCAUGUUACUGAUUUCAUCAGAAAAUGAGAUGAAUUGGUUUCAUUCGAAUGACGGUGGAAACGUUCUCUACUACGAAGUGAUGGUGACUGGGAAUCUUGGAAUCCAGUGGAGGCAUAAACCAAAUGUUGUUUCUGUUGAAAAGGAAAAAAAUAAACUGAAGCGGAAAAAACUGGAAAAUAAACACAAGAAGGAUGAGGAGAAAAACAAGAUCCGGGAAGAGUGGAACAAUUUUUCUUACUUCCCUGAAAUCACUCACAUUGUAAUAAAGGAGUCUGUGGUCAGCAUUAACAAGCAGGACAACAAGAAAAUGGAACUGAAGCUCUCUUCCCACGAGGAGGCCUUGUCCUUUGUGUCCCUGGUAGAUGGCUACUUCCGGCUCACAGCAGAUGCCCAUCAUUACCUCUGCACCGACGUGGCCCCCCCGUUGAUCGUCCACAACAUACAGAAUGGCUGUCAUGGUCCAAUCUGUACAGAAUACGCCAUCAAUAAAUUGCGGCAAGAAGGAAGCGAGGAGGGGAUGUACGUGCUGAGGUGGAGCUGCACCGACUUUGACAACAUCCUCAUGACCGUCACCUGCUUUGAGAAGUCUGAGCAGGUGCAGGGUGCCCAGAAGCAGUUCAAGAACUUUCAGAUCGAGGUGCAGAAGGGCCGCUACAGUCUGCACGGUUCGGACCGCAGCUUCCCCAGCUUGGGAGACCUCAUGAGCCACCUCAAGAAGCAGAUCCUGCGCACGGAUAACAUCAGCUUCAUGCUAAAACGCUGCUGCCAGCCCAAGCCCCGAGAAAUCUCCAACCUGCUGGUGGCUACUAAGAAAGCCCAGGAGUGGCAGCCCGUCUACCCCAUGAGCCAGCUGAGUUUCGAUCGGAUCCUCAAGAAGGAUCUGGUGCAGGGCGAGCACCUUGGGAGAGGCACGAGAACACACAUCUAUUCUGGGACCCUGAUGGAUUACAAGGAUGACGAAGGAACUUCUGAAGAGAAGAAGAUAAAAGUGAUCCUCAAAGUCUUAGACCCCAGCCACAGGGAUAUUUCCCUGGCCUUCUUCGAGGCAGCCAGCAUGAUGAGACAGGUCUCCCACAAACACAUCGUGUACCUCUAUGGCGUCUGUGUCCGCGACGUGGAGAAUAUCAUGGUGGAAGAGUUUGUGGAAGGGGGUCCUCUGGAUCUCUUCAUGCACCGGAAAAGCGAUGUCCUUACCACACCAUGGAAAUUCAAAGUUGCCAAACAGCUGGCCAGUGCCCUGAGCUACUUGGAGGAUAAAGACCUGGUCCAUGGAAAUGUGUGUACUAAAAACCUCCUCCUGGCCCGUGAGGGCAUCGACAGUGAGUGUGGCCCAUUCAUCAAGCUCAGUGACCCCGGCAUCCCCAUUACGGUGCUGUCUAGGCAAGAAUGCAUUGAACGAAUCCCAUGGAUUGCUCCUGAGUGUGUUGAGGACUCCAAGAACCUGAGUGUGGCUGCUGACAAGUGGAGCUUUGGAACCACGCUCUGGGAAAUCUGCUACAAUGGCGAGAUCCCCUUGAAAGACAAGACGCUGAUUGAGAAAGAGAGAUUCUAUGAAAGCCGGUGCAGGCCAGUGACACCAUCAUGUAAGGAGCUGGCUGACCUCAUGACCCGCUGCAUGAACUAUGACCCCAAUCAGAGGCCUUUCUUCCGAGCCAUCAUGAGAGACAUUAAUAAGCUUGAAGAGCAGAAUCCAGAUAUUGUUUCAGAAAAAAAACCAGCAACUGAAGUGGACCCCACACAUUUUGAAAAGCGCUUCCUAAAGAGGAUCCGUGACUUGGGAGAGGGCCACUUUGGGAAGGUUGAGCUCUGCAGGUAUGACCCCGAAGGGGACAAUACAGGGGAGCAGGUGGCUGUUAAAUCUCUGAAGCCUGAGAGUGGAGGUAACCACAUAGCUGAUCUGAAAAAGGAAAUCGAGAUCUUAAGGAACCUCUAUCAUGAGAACAUUGUGAAGUACAAAGGAAUCUGCACAGAAGACGGAGGAAAUGGUAUUAAGCUCAUCAUGGAAUUUCUGCCUUCGGGAAGCCUUAAGGAAUAUCUUCCAAAGAAUAAGAACAAAAUAAACCUCAAACAGCAGCUAAAAUAUGCCGUUCAGAUUUGUAAGGGGAUGGACUAUUUGGGUUCUCGGCAAUACGUUCACCGGGACUUGGCAGCAAGAAAUGUCCUUGUUGAGAGUGAACACCAAGUGAAAAUUGGAGACUUCGGUUUAACCAAAGCAAUUGAAACCGAUAAGGAGUAUUACACCGUCAAGGAUGACCGGGACAGCCCUGUGUUUUGGUAUGCUCCAGAAUGUUUAAUGCAAUCUAAAUUUUAUAUUGCCUCUGACGUCUGGUCUUUUGGAGUCACUCUGCAUGAGCUGCUGACUUACUGUGAUUCAGAUUCUAGUCCCAUGGCUUUGUUCCUGAAAAUGAUAGGCCCAACCCAUGGCCAGAUGACAGUCACAAGACUUGUGAAUACGUUAAAAGAAGGAAAACGCCUGCCGUGCCCACCUAACUGUCCAGAUGAGGUUUAUCAACUUAUGAGGAAAUGCUGGGAAUUCCAACCAUCCAAUCGGACAAGCUUUCAGAACCUUAUUGAAGGAUUUGAAGCACUUUUAAAAUAAGAAGCAUGAAUAACAUUUAAAUUCCACAGAUUAUCAAGUCCUUCUCCUGCAACAAAUGCCCAAGUCAUUUUUUAAAAAUUUCUAAUGAAAGAAGUUUGUGUUCUGUCCAAAAAGUCACUGAACUCAUACUUCAGUACAUAUACAUGUAUAAGGCACACUGUAGUGCUUAAUAUGUGUAAGGACUUCCUCUUUAAAUUUGGUACCAGUAACUUAGUGACACAUAAUGACAACCAAAAUAUUUGAAAGCACUUAAGCACUCCUCCUUGUGGAAAGAAUAUACCACCAUUUCAUCUGGCUAGUUCACCAUCACAACUGCAUUACCAAAAGGGGAUUUUUGAAAACGAGGAGUUGACCAAAAUAAUAUCUGAAGAUGAUUGCUUUUCCCUGCUGCCAGCUGAUCUGAAAUGUUUUGCUGGCACAUUAAUCAUAGAUAAAGAAAGAUUGAUGGACUUAGCCCUCAAAUUUCAGUAUCUAUACAGUACUAGACCAUGCAUUCUUAAAAUAUUAGAUACCAGGUAGUAUAUAUUGUUUCUGUACAAAAAUGACUGUAUUCUCUCACCAGUAGGACUUAAACUUUGUUUCUCCAGUGGCUUAGCUCCUGUUCCUUUGGGUGAUCACUAGCACCCAUUUUUGAGAAAGCUGGUUCUACAUGGGGGGAUAGCUGUGGAAUAGAUAAUUUGCUGCAUGUUAAUUCUCAAGAACUAAGCCUGUGCCAGUGCUUUCCUAAGCAGUAUACCUUUAAUCAGAACUCAUUCCCAGAACCUGGAUGCUAUUACACAUGCUUUUAAGAAACGUCAAUGUAUAUCCUUUUAUAACUCUACCACUUUGGGGCAAGCUAUUCCAGCACUGGUUUUGAAUGCUGUAUGCAACCAGUCUGAAUACCACAUACGCUGCACUGUUCUUAGAGGGUUUCCAUACUUACCACCGAUCUACAAGGGUUGAUCCCUGUUUUUACCAUCAAUCAUCACCCUGUGGUGCAACACUUGAAAGACCCGGCUAGAGGCACUAUGGACUUCAGGAUCCACUAGACAGUUUUCAGUUUGCUUGGAGGUAGCUGGGUAAUCAAAAAUGUUUAGUCAUUGAUUCAAUGUGAACGAUUACGGUCUUUAUGACCAAGAGUCUGAAAAUCUUUUUGUUAUGCUGUUUAGUAUUCGUUUGAUAUUGUUACUUUUCACCUGUUGAGCCCAAAUUCAGGAUUGGUUCAGUGGCAGCAAUGAAGUUGCCAUUUAAAUUUGUUCAUAGCCUACAUCACCAAGGUCUCUGUGUCAAACCUGUGGCCACUCUAUAUGCACUUUGUUUACUCUUUAUACAAAUAAAUAUACUAAAGACUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1536.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1633.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 1234.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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