Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002232.5

Sequence Length

2476 nt

GC Content

0.5691

AGACCCAGACAGAGCAUCGCGGCUUUGGCUGCAACAGGCGGUGGGCUCGGCUCGGGGGCGGAGGCGGCGAAAGGGCGGGGAGCGCGAGGAGGAGCGACCUGGCCUCACCGCUGCCGCCUCUUCCCCGCCGCAUGGACGAGCGCCUCAGCCUUCUGCGCUCGCCGCCGCCGCCCUCAGCCCGCCACCGCGCCCACCCUCCUCAGCGCCCAGCGAGCAGCGGCGGUGCCCACACGCUGGUGAACCACGGCUACGCGGAGCCCGCCGCAGGCCGCGAGCUGCCGCCCGACAUGACCGUGGUGCCCGGGGACCACCUGCUGGAGCCGGAGGUGGCCGAUGGUGGAGGGGCCCCGCCUCAAGGCGGCUGUGGCGGCGGCGGCUGCGACCGCUACGAGCCGCUGCCGCCCUCACUGCCGGCCGCGGGCGAGCAGGACUGCUGCGGGGAGCGCGUGGUCAUCAACAUCUCCGGGCUGCGCUUCGAGACGCAGCUGAAGACCCUUUGCCAGUUCCCCGAGACGCUGCUGGGCGACCCCAAGCGGCGCAUGAGGUACUUCGACCCGCUCCGCAACGAGUACUUCUUCGACCGCAACCGGCCCAGCUUCGACGCCAUCCUCUACUACUAUCAGUCCGGGGGCCGCAUCCGCCGGCCGGUCAACGUGCCCAUCGACAUUUUCUCCGAGGAGAUCCGCUUCUACCAGCUGGGCGAGGAGGCCAUGGAGAAGUUCCGCGAGGACGAGGGCUUCCUGCGGGAGGAGGAGCGGCCCUUGCCCCGCCGCGACUUCCAGCGCCAGGUGUGGCUGCUCUUCGAGUACCCCGAGAGCUCCGGGCCGGCCCGGGGCAUCGCCAUCGUGUCCGUGCUGGUCAUCCUCAUCUCCAUUGUCAUCUUCUGCCUGGAGACGCUGCCGGAGUUCCGCGACGAGAAGGACUACCCCGCCUCGACGUCGCAGGACUCAUUCGAAGCAGCCGGCAACAGCACGUCGGGGUCCCGCGCAGGAGCCUCCAGCUUCUCCGAUCCCUUCUUCGUGGUGGAGACGCUGUGCAUCAUCUGGUUCUCCUUCGAACUGCUGGUGCGGUUCUUCGCUUGUCCUAGCAAAGCCACCUUCUCGCGAAACAUCAUGAACCUGAUCGACAUUGUGGCCAUCAUUCCUUAUUUUAUCACUCUGGGUACCGAGCUGGCCGAACGACAGGGCAAUGGACAGCAGGCCAUGUCUCUGGCCAUCCUGAGGGUCAUCCGCCUGGUAAGGGUCUUCCGCAUCUUCAAGCUGUCGCGCCACUCCAAGGGGCUGCAGAUCCUCGGGCAAACGCUGAAGGCGUCCAUGCGGGAGCUGGGAUUGCUCAUCUUCUUCCUCUUUAUUGGGGUCAUCCUUUUCUCCAGCGCGGUCUACUUUGCCGAGGCAGACGACCCCACUUCAGGUUUCAGCAGCAUCCCGGAUGCCUUCUGGUGGGCAGUGGUAACCAUGACAACAGUGGGUUACGGCGAUAUGCACCCAGUGACCAUAGGGGGCAAGAUUGUGGGAUCUCUCUGUGCCAUCGCCGGUGUCUUGACCAUCGCAUUGCCAGUUCCCGUGAUUGUUUCCAACUUCAAUUACUUCUACCACCGGGAGACAGAAGGGGAAGAGCAAUCCCAGUACAUGCACGUGGGAAGUUGCCAGCACCUCUCCUCUUCAGCCGAGGAGCUCCGAAAAGCAAGGAGUAACUCGACUCUGAGUAAGUCGGAGUAUAUGGUGAUCGAAGAGGGGGGUAUGAACCAUAGCGCUUUCCCCCAGACCCCUUUCAAAACGGGCAAUUCCACUGCCACCUGCACCACGAACAAUAAUCCCAACUCUUGUGUCAACAUCAAAAAGAUAUUCACCGAUGUUUAAUAUGUGAUACAAGUGACAUGCUGUGCUCAGUAUUGUGUGGAACGUGCCCCCUUGGUCUGCCUAUGCCCUUGUUUUAUACAUUUCCAGACCAUUCAUCAAGGAAAGGACCUGAAGAAGUGGAAAGCACACUUCAUUCUCCCUCUCCCUGCUGCUUCAUACUGAAACAGGUGCCUGUUUUGCAAGUGGGCUGCAUUCUCUCAGCUCUCCUUUUCCCUCUUACCCUCUCUCUCUUAACAUUGUAAACAACAGACUUACGUUAAACUUCAUUUCUAGUACACGCCCUAUUUAAAAAAGAGCAGUACAUCCUGGGAGGAAAUGAAACUAAAGAACAGUUAGAGUAACUGUUUAACCUCAGAAUUUUAAAGGCAGUUGUUUCUUUCCUAAGCACAUCAAUUCGUAGUAAAUGAUGCUUCGGUUUGAUGGACCUUUCAACGUUAUUUAUUGAAUAUGUAUUUCGGUUGCCUACCCUGUAGAUAUGUGGAUGAAGAGUCUAACUAGAAUAAUGACUUGUAAACCCACCAUGAGUUAUUUGGUUUUUGACUUAAAUUCCUAUUUGAAUCCCCUUUCCCGGAAUUUUAAGUGUCUCUACAACUUUGAAUAAAGGGAAAUGCCCAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-949.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -992.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 493.03

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((...((((((......))))))((((......(((((((....((((.((((((((.((((((((...(((((((((...((((.((((((...((....)).)))).)).)))))))))))))((.((((.(.((......))).)))).)))))))))).))))))))))))..)))))))..(((.(((((((...(((((((((((.(((((((.((((.(..((((........))))...).)).))))))))).(((((((.((.(((.((.(((.(((..((((((.....((.((((((.(((....)))))))))))(((((((..(((((.(((((....)))))....(((((((((((((.((.......)))))))))))))))......(((((..((((.(((((((.....))))((((((((((.((((.(((..........((((((((...)).))))))))).))))...)))..)))))))....((((((((((....))).)))))))...((((((((.((...((...))...)))))))))).))).))))..)))))...)))))..)))))))...))))))..)))))).)).))).))...)).)))))(((......)))...........((((....))))...))))......))))))))))))))...))).((((((.((((.((.((((((((((((.(....).))))..)))))))))).)).)).))))))))))(((((((((((((.(((((((.((((((.(((.((((((((....))))))))...(((((.(((((((((((((((.......((((((..((........)).)))))).(((((((((((((.((((((.((.((.(......)))))..)))))).))))))...))..))))).)))..)))))))..(((((.((.....)).)))))((((.((((((...((........)))))))).)))).((((((.(.(((((......)))))).))))))((((((((((..(.....((...))......)..))))).......))))).....))))).)))))....................))).)))))))))).((((((...((((.(((..((.....)).))).))))..))))))....))))))))..))))))))..))))))..............((((.((.((.......)).)).))))...((.(((((((((.((((((.(((((((((...(((((((((((((.((((((((........(((((((.((....((((..(((.((....)).))).))))..)).)))))))...............(((((...)))))((((((((((((((((((((((...((....)).))))))((((((..((((..((.((((((((.........))))))..)).))..)))).))))))(((......)))....))))))).......(((((((..........)))))))......)))))))))...)))))))).)))))))))))))...)))....((((((.(((((..(((((.(((((((...((((..(((((.........)))))..))))(((((((.....)))))))...........)))))))))))).)).......))).)))))).((((((...........(((((.(((((((((.....)))...................(.(((((((((.(((.....(((((((....)))))))...)))))))))))).)((((((((....))))).)))))))))..)))))...(((((((...(((.............)))...))))))).....((.(((.(((....(((((((((.......)))))).)))..))).))).)).(((((......(((((((.(((((((((((.(((.((((((........))))))..)))...........((((((....(((((...((((.........)))))))))............((((..((.((.........)).)).)))).....)))))).............(((((((((...))))))))).....)))))).....))))).)))))))......)))))(((((............)))))....)))))))))))))))))).)))).((((((.(((((.(((...(((.....)))..))).)))).).))))))(((((.(((((....((((((((((.........)))))))))))))))...)))))..((((......))))....((((((...((((.((((.........)))).))))...))))))))))).)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....{,{.{{({({.,.{{(((|||,||||,.{{{((((((((((.(((,,.((((((,({(((((((....(((((((((...((((.((((((...{{....}}.)))).)).))))))))))))){{.,((.{(((({{....,,...,,))))))))))})})))))))),)))}.)),))).))))))|((((((..,(((((((((((.(((((((.((((.(..((((........))))...).)).))))))))).(((((((,((.(((.(({(((.(((..((((((...{{((.((((((.(((....)))))))))))(((((((..(((((.(((((....)))))..(.(((((((((((((.((.......)))))))))))))))..,,..(((((..((((.(((((((.....))))((((((((((.((((.((,.........{(((((({{...,}.))))))))).))))...)))..)))))))..,.((((((((((....))),})))))),..((((((({{((...,{...})...)))))))))).))).))))..)))))...)))))..))))))),,.))))))..)))))),))}))).)).,.)),}))))(({......}}}....,......{(({...,)))}...))))......)))))))))))))|{((((((((((.,,((.(((({,{.(((({{(((((({(..(((((((((((..{(((..(,{((........))))..)))).)))))))))))....((((((({{((((((((....)))))))).}|,,...,|||,.{{(((((({,.......((((((..(,........)}.)))))).(((((((((((((.((((((.(,{((.{......}))))..)))))).))))))...))..))))),))),.}}))))))))))))})).))))))))))).,.}})))))))....)))))))))))|(((((,{({{,(,,,||.,.|||||}}}...|||||{{,,,,)))}}))..,|||}}}..}))),,,|||{{..,.{{|,|,...{(({.....,))}}}}}..,,|}||}..((({(({.{{{{{,,.{{...{((((((((({.((((((...((((.(((..((.....)).))).)))),.}))))).((((((((((..{.(((({{...{(({...,,((..,.....}}.)..}|}}}.,,)}..,)))).)..))))))))))..((((.((((((.(((({((((,{.(((((((((((((.((((((((.,{{....(((((((.((....((((..({(,((....,,.))),)))).,)).)))))))....}}}........(((((...)))))((((((((((((((((((((((,{.......}),))))))((((((..((((..((.((((((((.........))))))..)).))..)))).))))))(((......)))....))))))).......(((((((..........))))))).....})))))))))...)))))))).))))))))))))).,.}}},.{.((((((.((({{..((({({(((((((...((((..(((((.........)))))..)))}(((((((.....)))))))....,,,....)))))))))))).)).......)))})))))).|,{,..,,,,,,.....(((((.(((((((((.....)))...................{.(((((((({{(((.....(((((((....)))))))...)))))))))))).)((((((((....)))))},))))))))..)))))...(((((((...(((.............)))...)))))))........{||,|((....(((((((((.......)))))).)))..))}.))),}}.(((((......(((((((.(((((((((((.,.(.((((((........))))))..,,{{{,{{((,,,....,,({{{,((,,...{((,....,,,,..,,,|}},..,,{........}||,,..|,.,,........,))}),}),,,....,))))))},,.},.......(((((((((...))))))))).....)))))).....))))).)))))))......))))),{((((.(((.((((.....)))).))).))))))))))))))).))))...,.....,,,..,..}))))},)))))...,)})))}),}.)))))).(((((.((((({...,{((((((((.........)))))))))))))))...))))),{((((,.....|||.....,|||{{,,,||||.{|||||,,,,}).,)}}.))),...))))}},))}}....