Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002245.4

Sequence Length

2061 nt

GC Content

0.4522

AGAAGAGGCGGCGGGCCGCGCUCCGGCCGGUCUGCGGCGUUGGCCUUGGCGGCGGCGGUGGAGAAGAUGCUGCAGUCCCUGGCCGGCAGCUCGUGCGUGCGCCUGGUGGAGCGGCACCGCUCGGCCUGGUGCUUCGGCUUCCUGGUGCUGGGCUACUUGCUCUACCUGGUCUUCGGCGCAGUGGUCUUCUCCUCGGUGGAGCUGCCCUAUGAGGACCUGCUGCGCCAGGAGCUGCGCAAGCUGAAGCGACGCUUCUUGGAGGAGCACGAGUGCCUGUCUGAGCAGCAGCUGGAGCAGUUCCUGGGCCGGGUGCUGGAGGCCAGCAACUACGGCGUGUCGGUGCUCAGCAACGCCUCGGGCAACUGGAACUGGGACUUCACCUCCGCGCUCUUCUUCGCCAGCACCGUGCUCUCCACCACAGGUUAUGGCCACACCGUGCCCUUGUCAGAUGGAGGUAAGGCCUUCUGCAUCAUCUACUCCGUCAUUGGCAUUCCCUUCACCCUCCUGUUCCUGACGGCUGUGGUCCAGCGCAUCACCGUGCACGUCACCCGCAGGCCGGUCCUCUACUUCCACAUCCGCUGGGGCUUCUCCAAGCAGGUGGUGGCCAUCGUCCAUGCCGUGCUCCUUGGGUUUGUCACUGUGUCCUGCUUCUUCUUCAUCCCGGCCGCUGUCUUCUCAGUCCUGGAGGAUGACUGGAACUUCCUGGAAUCCUUUUAUUUUUGUUUUAUUUCCCUGAGCACCAUUGGCCUGGGGGAUUAUGUGCCUGGGGAAGGCUACAAUCAAAAAUUCAGAGAGCUCUAUAAGAUUGGGAUCACGUGUUACCUGCUACUUGGCCUUAUUGCCAUGUUGGUAGUUCUGGAAACCUUCUGUGAACUCCAUGAGCUGAAAAAAUUCAGAAAAAUGUUCUAUGUGAAGAAGGACAAGGACGAGGAUCAGGUGCACAUCAUAGAGCAUGACCAACUGUCCUUCUCCUCGAUCACAGACCAGGCAGCUGGCAUGAAAGAGGACCAGAAGCAAAAUGAGCCUUUUGUGGCCACCCAGUCAUCUGCCUGCGUGGAUGGCCCUGCAAACCAUUGAGCGUAGGAUUUGUUGCAUUAUGCUAGAGCACCAGGGUCAGGGUGCAAGGAAGAGGCUUAAGUAUGUUCAUUUUUAUCAGAAUGCAAAAGCGAAAAUUAUGUCACUUUAAGAAAUAGCUACUGUUUGCAAUGUCUUAUUAAAAAACAACAAAAAAAGACAAAUGGAACAAAGAAGCUGUGACCCCAGCAGGAUGUCUAAUAUGUGAGGAAAUGAGAUGUCCACCUAAAAUUCAUAUGUGACAAAAUUAUCUCGACCUUACAUAGGAGGAGAAUACUUGAAGCAGUAUGCUGCUGUGGUUAGAAGCAGAUUUUAUACUUUUAACUGGAAACUUUGGGGUUUGCAUUUAGAUCAUUUAGCUGAUGGCUAAAUAGCAAAAUUUAUAUUUAGAAGCAAAAAAAAAAAGCAUAGAGAUGUGUUUUAUAAAUAGGUUUAUGUGUACUGGUUUGCAUGUACCCACCCAAAAUGAUUAUUUUUGUAGAAUCUAAGUUAAACUUACUAUUUAUAAUGCAUAGGUAACCAUUAACUAUGUACAUAUAAAGUAUAAAUAUGUUUAUAUUCUGUACAUAUGGUUUAGGUCACCAGAUCCUAGUGUAGUUCUGAAACUAAGACUAUAGAUAUUUUGUUUCUUUUGAUUUCUCUUUAUACUAAAGAAUCCAGAGUUGCUACAAUAAAAUAAGGGGAAUAAUAAACUUGAGAGUGAAUAACCAUAGUAUUCUGCUGCAAUAAAUGUUUCUACCCUCUUGCGAUAGAAUGGUGUCAGAUGUCUAACAUGUUUAUAAACAUUUUUUUGAAUUGAACAGGUUAUGAAAAGGAUUUAUUAAAAGGUUAAGAUACUUUGUUUUGAAAGUACAUUGUGAUUUGCAGCCACCUAGCACUAAAGCAUAGAACUUAAACACGAAUCCCUAAAUGAACAGAUUAUGUUACAUUAAUCUGAGAAUUUUAAAUUUAGAAGCUAAAAUAAAUAAAAAUCACAGCUGGUUGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-646.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -686.35

Frequency: 0.0000

Diversity: 656.71

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((((((.((((.(((((((((((.((((((((((..((.(.((....)).).))....))))))))))...)))))))).))).)).)).)))(((.(((.(((((....))))).))).)))((((((((((....((((.((((.....)))).....(.((((.(((((((((((((((.....(((......)))....))))))).)))))))))))).).))))))))))))))..))))))))((((.((((((.((((.((.(.(((.((.((((((((.((((((.(..((((.((((.(((((..((.....((.((...)).))....))...))))).)))).))))..).))))))....))))).))))).))).).))))))))))))))))..((((((.(((((.....))))).))).(((((((((((.....((.....))........)))))))..))))((((((((.(((..(((((...(((((((((.....))))((((....)))).)))))...)))))..)))..(((.((((((((((((((((((....((((.(((((((((((((((....(((((((.((((((..(((((((......(((((..(((((((((((.((((..((((......)))).))))(((((..(.(((...))).)..))))).......((((....((((((((.((((.((...((....))...)))))).))))))))...)))).......((((..(((.((....(((..((..((.((.(....(((((((.((((......)))).).))))))..)))))..)).)))..)).)))..))))(((((....))))).............)))))))))))..)))))(((((..(((.(((..((((.....)))).....))))))..)))))....)))))))))).)))))))))).((((((..((.........))..))))))))))))))).........)))))).))))((((((((.......((.(((((((...........))))))).))....))))))))(((((((........((((..((((................))))..))))........)).)))))......((((((.((((((....((((((..................))))))....))))..)).))))))..))))))).))))))....(((((((((...(((((((((((.............)).))))......))))).)))))))))))))))))........(((((....)))))..(((((((((...........)))))))))((.(((((((((.(((((((((((.(((((.....))))))))))).)))))..........((((((((((....((((((((....)))))))).........((((((((((((((((......((((........((((((((....((((....(((((...)))))))))..))))).))).))))......))))).)))))))))))((((((((((....))))).))))).((((((((.(((...((((..(((...))).))))..))).))))))))....)))))))))).........((((((...)))))).))))))))).))...........))))))))....(((((...(((((((..(((((.(((((((.(((((.....((....))....))))).))))))).)))......((((((.((((((....((......))...)))))).)))).))...)))))))))...)))))....((((((......))))))....)))..((((((((..(((((......)).))).................((((((...(((((((........)))))))..........)))))).((((..................))))))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((({{((((((((.(({{{{|||||,||||((({{{.,|{.{,(({,,,|}{|{||{{,,||}|||||||,|||.||||||,|||,||,||,,(((((.(((.(((((....))))).))).)))||..{{({,.{{,{((({,((((.....)))},|||.||{{{{,(((((((((((((((.....(({|,...,)))....))))))).))))))))||||||}}|||,}}}}{{{||,.,))))),{((({{((((((.((({,((.{.(((.((.((((((((.((((((.(..((((.{(((.(((((.{((,.{,{{{,...}}.},))}}..},...))))).)))}.))))..).))))))....))))).))))).))).).))))))))))))))))}.,.,,((,.(((({{{{{|||||{||{.((,,({(((((({({(({{.,{{((.....{,{{.{{{{{{..|||{...,,,,......,,}}}}..)))))),.)))},...{|((......)))).,,..,,,,))))),,)),}}}.}}}}}|||{,||.||,||||}...,,,..}}.))}||)))}}}}...,|,,}}}}.)}},,,,}))|,||,.}},))}.|||))}})))))))|,,,{{{|||||{|,.,,,{{{,..,{((((((..(.(((...))).)..)))))},.{(((((({{,,,{{(((((,,((,{....,}||,.})))}...|||||{{,,,,,))}}.))),.,.,,,,,,,,,,,{{{(({{,,{{{,,(((((..((((((..(((((((.((((......)))).),,))))).,{{,,.{(((({.,(((({|({(((((.(((....((((((((((((((({...{((((.{,{(((.(((((((,((.{{{.{(((.,......,.))))))}}...))))))).)))))..))))),...(((({.(((((((.,((((((...(((((({...{(((((((((.{.|,{((((...{{(((((....}))))||({((((.......{{.{((((({|........|.})))))).},,...)))))}}.)))))}..}.)))))))))}.,,...,,{,,,,......}})}||...{(((((.((((((((((((({((..((((((.((((((....((((((.,................))))))....))))}.,).))))))..((((,,((((,{.(((..(((((((((...(((((((({{({.,,.......,,.)})))}.....,))))).)))))))))..}))},,.,.)))}.(((((....)))))..(((((((((...........))))))))){{.,((((((({.{((((((((((.(((((.....))))))))))).))))}..........((((((((({....{(((((((....)))))))|,,,,,,,({{.((((((((......}}))})})},.,..,,,{{,,.,,,,||,||{{{,...(((((...)))))}}})))))}},}}}},|||,{{{,,.{{{{(((({{{{{{{,{(((({{,....}))))))}.)))))))}}))}|{{|||,,,}.}|.|}||,({((({{{{...,,,.}))))))}....)))))))))).........((((((...}))))).,)))))))}.}}............)))).........)))})}))))).....)))))).))).)))}},.....}))))))..)))))).........}.))))))).)))))............})))))))))))))))...))).)))))....)),)))))...}))))).}|,((((((......))))))...{(({..,{||,|,,..{{{||......)).)))......)))))).)))))..,,,...(((((((........)))))))..}}}}}},..,,}}),,})}.,,,}}},,,,,,,,.}}}))})))}}...