Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002273.4
Sequence Length
1784 nt
GC Content
0.5930
AUUCCUGAGAGCUCUCCUCACCAAGAAGCAGCUUCUCCGCUCCUUCUAGGAUCUCCGCCUGGUUCGGCCCGCCUGCCUCCACUCCUGCCUCUACCAUGUCCAUCAGGGUGACCCAGAAGUCCUACAAGGUGUCCACCUCUGGCCCCCGGGCCUUCAGCAGCCGCUCCUACACGAGUGGGCCCGGUUCCCGCAUCAGCUCCUCGAGCUUCUCCCGAGUGGGCAGCAGCAACUUUCGCGGUGGCCUGGGCGGCGGCUAUGGUGGGGCCAGCGGCAUGGGAGGCAUCACCGCAGUUACGGUCAACCAGAGCCUGCUGAGCCCCCUUGUCCUGGAGGUGGACCCCAACAUCCAGGCCGUGCGCACCCAGGAGAAGGAGCAGAUCAAGACCCUCAACAACAAGUUUGCCUCCUUCAUAGACAAGGUACGGUUCCUGGAGCAGCAGAACAAGAUGCUGGAGACCAAGUGGAGCCUCCUGCAGCAGCAGAAGACGGCUCGAAGCAACAUGGACAACAUGUUCGAGAGCUACAUCAACAACCUUAGGCGGCAGCUGGAGACUCUGGGCCAGGAGAAGCUGAAGCUGGAGGCGGAGCUUGGCAACAUGCAGGGGCUGGUGGAGGACUUCAAGAACAAGUAUGAGGAUGAGAUCAAUAAGCGUACAGAGAUGGAGAACGAAUUUGUCCUCAUCAAGAAGGAUGUGGAUGAAGCUUACAUGAACAAGGUAGAGCUGGAGUCUCGCCUGGAAGGGCUGACCGACGAGAUCAACUUCCUCAGGCAGCUAUAUGAAGAGGAGAUCCGGGAGCUGCAGUCCCAGAUCUCGGACACAUCUGUGGUGCUGUCCAUGGACAACAGCCGCUCCCUGGACAUGGACAGCAUCAUUGCUGAGGUCAAGGCACAGUACGAGGAUAUUGCCAACCGCAGCCGGGCUGAGGCUGAGAGCAUGUACCAGAUCAAGUAUGAGGAGCUGCAGAGCCUGGCUGGGAAGCACGGGGAUGACCUGCGGCGCACAAAGACUGAGAUCUCUGAGAUGAACCGGAACAUCAGCCGGCUCCAGGCUGAGAUUGAGGGCCUCAAAGGCCAGAGGGCUUCCCUGGAGGCCGCCAUUGCAGAUGCCGAGCAGCGUGGAGAGCUGGCCAUUAAGGAUGCCAACGCCAAGUUGUCCGAGCUGGAGGCCGCCCUGCAGCGGGCCAAGCAGGACAUGGCGCGGCAGCUGCGUGAGUACCAGGAGCUGAUGAACGUCAAGCUGGCCCUGGACAUCGAGAUCGCCACCUACAGGAAGCUGCUGGAGGGCGAGGAGAGCCGGCUGGAGUCUGGGAUGCAGAACAUGAGUAUUCAUACGAAGACCACCAGCGGCUAUGCAGGUGGUCUGAGCUCGGCCUAUGGGGGCCUCACAAGCCCCGGCCUCAGCUACAGCCUGGGCUCCAGCUUUGGCUCUGGCGCGGGCUCCAGCUCCUUCAGCCGCACCAGCUCCUCCAGGGCCGUGGUUGUGAAGAAGAUCGAGACACGUGAUGGGAAGCUGGUGUCUGAGUCCUCUGACGUCCUGCCCAAGUGAACAGCUGCGGCAGCCCCUCCCAGCCUACCCCUCCUGCGCUGCCCCAGAGCCUGGGAAGGAGGCCGCUAUGCAGGGUAGCACUGGGAACAGGAGACCCACCUGAGGCUCAGCCCUAGCCCUCAGCCCACCUGGGGAGUUUACUACCUGGGGACCCCCCUUGCCCAUGCCUCCAGCUACAAAACAAUUCAAUUGCUUUUUUUUUUUGGUCCAAAAUAAAACCUCAGCUAGCUCUGCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-725.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -757.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 517.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((((((....((.(((((.(((......))).))))).))......((((((((.((((((..(((((((....((((((((((((((.((..(((((((((((.............)).)).)))).)))(((((((((((.((.((..((((((......))))))((...((((((((.(((((((...)))))......))))))).))).)).......)))).)))))))).))))).))))))))))...))))....)))))))....)).......)))))))))).)).(((((((((.(((((((((((..(((.((.((........))..)).)))..))))).((((((((((((..................))))).)))))))....))))))...(((((((((..(((((........)))))....)))...))))))..((((....)))).....)))))..))))(((((.....)))))..))))))).).))).........(((((.((((((......(((((((((((((((((.(((((((((((..((.((....)).))..((((.((.((.((.(((((.......(.(((((((((((.((......(((......)))......)).)))))))))))).....((.(((((.(((((.................((((((((((((((((((..(((((((...((((..((((.((((((((.((((((.........((((((((((..(((((((((((.((((((((.((.....(((((((((((((((..((............))..)))))))))))))))))))))))))..((((..((......))..))))..((.((((((((((..((((....((.((........)).))......))))....)))))))))))).......))))....))))))).........))).)))))))..((((........)))).((((((((((.((((....((..((((((..(((((....))))).....))))))..))..((....))....)))).))))..))))))..........(((..(((((...(((((..(((.(.(.((((......)))).)).))).)))))))))).))))))))).)))).....)))).))))...))))...).))))))...))......(((((..((((((....))).)))..)))))..((((((((((((((((((((.((......((((....))))....((((((((.(((....))).)))))))).((((.((((....(((((.......)))))))))..)))).)).))))))))))))))..)))))))))).))))))))))))))))).)))))))((((((.(((((..((((....(((......)))...))))...((((..(((((.(.(((((.((((((...(((((((((.(((.....(((((((.(((((((((((............((.(((...))).))))))).))).))).)))..)))).....)))))))..)))))....))...))))))))).))))))......))))))))))))))).......))))).))))))..)))).))))))))))).)).............)))))))....))))))))..............)))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,{,,.({{,{,,,,....,},,},((((((((((((((((((.{{.{(((((((......((((({((((((((((((.{.((.(((.((.{({({..{{((({..{((((..({({,..,,((,(((((((((({(((((((((((.,{.((,((((,.(((((....)))))..}}}}|,{{((.,{,((((,,,|}|}}.....}))),)))},}..}}.......)))}.)))))))).)))(({...((.((((((((((((.(((..({{...(({{..,...}})))..)))..))).)))).))))))).)})},)))))))))).},....((((((((((((........,.((((((((((((..................)))))},)))))).,.......))))))..)))))).(((((........))))),,,.{{,..,}|,{{|{|((((....))))..|,.{((((...(.((((((.....)))))))..)))))...,,....,}}}}.}|,}}}.,)))).,})))))))}}}))))}.)).}.}),))))))))).)).,|{{,...,)).,))))))))))))},|||.........|,(((((((((((.((......(((......)))......)).)))))))))))}.))))))).))))).))))))...........((((((((((((((((((((((({.,(((((.((,,.({{.,,...})},}}.))))))).........,((((((,((((.,,,..,}}}).)})))){{,{......(((((((((((((((..((............))..))))))))))))))).|{|||{{|,..((((..((......,}..)))).,||.||||{((((({{{{(({.{.,({(.{...{{{{{.{||.|,.,{.{|{((((,|(((((((,.,.}}}.}}))......))))))).,.,....}))..))))),,.,.}}}..||||....,,,,))}),}}}}|||,|||,}|{{((((((,..}||||.||||{||||,{{{||||||{{,.,{{{.,.{|{,..}}|||,|(((,{((((({{,,,..||},}.,..,}}}..)))|}}}(((((((((.(((((({(((((..(((..((........))..))).)))))}{((((.((((((((((((....))),,)))...))))))).)),...(((((..((((((....))).)))..)))))..((((((((((((((((((((.{(......{{{{....}}}}....((((((((.(((....))).)))))))).((((.((((....(((((.......)))))))))..)))).)}.))))))))))))))..)))))))).)))).)))))))))..,|||,.(((((((((,{|{({.,{,((((,{{.{({......))).,,)))),..}})).}))))))))||||(.({{{||...((((((((,{(((.....(((((((.(((((((((((.,..........({.(({...))).)}))))),,)).))).))}..)))).....)))))))..)))))....,..,,)))))))))}}}})))||||||}}}..)))|)}.||.........((((...)))).,}}},..))))))))}...,,,.{{{,...,}}).,,||{,.{{{||,,.)},,,.,,,,,}}}..)))))))))))..
Back