Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002340.6
Sequence Length
4886 nt
GC Content
0.5808
AGUGGGCGGCGUAGAGCACUGCAGCAGCAAUGACGGAGGGCACGUGUCUGCGGCGCCGAGGGGGCCCCUACAAGACCGAGCCCGCCACCGACCUCGGCCGCUGGCGACUCAACUGCGAGAGGGGCCGGCAGACGUGGACCUACCUGCAGGACGAGCGCGCCGGCCGCGAGCAGACCGGCCUGGAAGCCUACGCCCUGGGGCUGGACACCAAGAAUUACUUUAAGGACUUGCCCAAAGCCCACACCGCCUUUGAGGGGGCUCUGAACGGGAUGACAUUUUACGUGGGGCUGCAGGCUGAGGAUGGGCACUGGACGGGUGAUUAUGGUGGCCCACUUUUCCUCCUGCCAGGCCUCCUGAUCACUUGCCACGUGGCACGCAUCCCUCUGCCAGCCGGAUACAGAGAAGAGAUUGUGCGGUACCUGCGGUCAGUGCAGCUCCCUGACGGUGGCUGGGGCCUGCACAUUGAGGAUAAGUCCACCGUGUUUGGGACUGCGCUCAACUAUGUGUCUCUCAGAAUUCUGGGUGUUGGGCCUGACGAUCCUGACCUGGUACGAGCCCGGAACAUUCUUCACAAGAAAGGUGGUGCUGUGGCCAUCCCCUCCUGGGGGAAGUUCUGGCUGGCUGUCCUGAAUGUUUACAGCUGGGAAGGCCUCAAUACCCUGUUCCCAGAGAUGUGGCUGUUUCCUGACUGGGCACCGGCACACCCCUCCACACUCUGGUGCCACUGCCGGCAGGUGUACCUGCCCAUGAGCUACUGCUACGCCGUUCGGCUGAGUGCCGCGGAAGACCCGCUGGUCCAGAGCCUCCGCCAGGAGCUCUAUGUGGAGGACUUCGCCAGCAUUGACUGGCUGGCGCAGAGGAACAACGUGGCCCCCGACGAGCUGUACACGCCGCACAGCUGGCUGCUCCGCGUGGUAUAUGCGCUCCUCAACCUGUAUGAGCACCACCACAGUGCCCACCUGCGGCAGCGGGCCGUGCAGAAGCUGUAUGAACACAUUGUGGCCGACGACCGAUUCACCAAGAGCAUCAGCAUCGGCCCGAUCUCGAAAACCAUCAACAUGCUUGUGCGCUGGUAUGUGGACGGGCCCGCCUCCACUGCCUUCCAGGAGCAUGUCUCCAGAAUCCCGGACUAUCUCUGGAUGGGCCUUGACGGCAUGAAAAUGCAGGGCACCAACGGCUCACAGAUCUGGGACACCGCAUUCGCCAUCCAGGCUCUGCUUGAGGCGGGCGGGCACCACAGGCCCGAGUUUUCGUCCUGCCUGCAGAAGGCUCAUGAGUUCCUGAGGCUCUCACAGGUCCCAGAUAACCCUCCCGACUACCAGAAGUACUACCGCCAGAUGCGCAAGGGUGGCUUCUCCUUCAGUACGCUGGACUGCGGCUGGAUCGUUUCUGACUGCACGGCUGAGGCCUUGAAGGCUGUGCUGCUCCUGCAGGAGAAGUGUCCCCAUGUCACCGAGCACAUCCCCAGAGAACGGCUCUGCGAUGCUGUGGCUGUGCUGCUGAACAUGAGAAAUCCAGAUGGAGGGUUCGCCACCUAUGAGACCAAGCGUGGGGGGCACUUGCUGGAGCUGCUGAACCCCUCGGAGGUCUUCGGGGACAUCAUGAUUGACUACACCUAUGUGGAGUGCACCUCAGCCGUGAUGCAGGCGCUUAAGUAUUUCCACAAGCGUUUCCCGGAGCACAGGGCAGCGGAGAUCCGGGAGACCCUCACGCAGGGCUUAGAGUUCUGUCGGCGGCAGCAGAGGGCCGAUGGCUCCUGGGAAGGCUCCUGGGGAGUUUGCUUCACCUACGGCACCUGGUUUGGCCUGGAGGCCUUCGCCUGUAUGGGGCAGACCUACCGAGAUGGGACUGCCUGUGCAGAGGUCUCCCGGGCCUGUGACUUCCUGCUGUCCCGGCAGAUGGCAGACGGAGGCUGGGGGGAGGACUUUGAGUCCUGCGAGGAGCGGCGUUAUUUGCAGAGUGCCCAGUCCCAGAUCCAUAACACAUGCUGGGCCAUGAUGGGGCUGAUGGCCGUUCGGCAUCCUGACAUCGAGGCCCAGGAGAGAGGAGUCCGGUGUCUACUUGAGAAACAGCUCCCCAAUGGCGACUGGCCGCAGGAAAACAUUGCUGGGGUCUUCAACAAGUCCUGUGCCAUCUCCUACACGAGCUACAGGAACAUCUUCCCCAUCUGGGCCCUCGGCCGCUUCUCCCAGCUGUACCCUGAGAGAGCCCUUGCUGGCCACCCCUGAGAACAUGCCUACCUGCUGGGUGCCGUCUGUGCGUUCCAGUGAGGCCAAGGGGUCCUGGCCGGGUUGGGGAGCCCUCCCAUAACCCUGUCUUGGGCUCCAACCCCUCAACCUCUAUCUCAUAGAUGUGAAUCUGGGGGCCAGGCUGGAGGCAGGGAUGGGGACAGGGUGGGUGGCUUAGACUCUUGAUUUUUACUGUAGGUUCAUUUCUGAAAGUAGCUUGUCGGGCUUGGGUGAGGAAGGGGGCACAGGAGCCGUGACCCCUGAGGAGGCACAGCGCCUUCUGCCACCUCUGGGCACGGCCUCAAGGUAGUGAGGCUAGGAGGUUUUUUCUGACCAAUAGCUGAGUUCUUGGGAGAGGAGCAGCUGUGCCUGUGUGAUUCCUUAGUGUCGAGUGGGCUCUGGGCUGGGGUCGGCCCUGGGCAGGCUUCUCCUGCACCUUUUGUCUGCUGGGCUGAGGGACACGAGGGCAACCCUGUGACAAUGGCAGGUAGUGUGCAUCCGUGAAUAGCCCAGUGCGGGGGUUGCUCAUGGAGCAUCCUGAGGCCGUGCAGCAGGGAGCCCCAUGCCCCUGGGUCGUGAGCUUGCCUGCGUAUGGGGUGGUGUCAUGGAGCCUCAUGCCCCUGGGUCGUGAGCUCGCCUGAGUAUGGGGUGGUGUCAUGGAGCCGCAUACCCCUGGGUUGUGAGCUCGCCUGCAUAUGCAGGGUCUGUCAUGGAACAUCCCAAGUCUGUGCAGCAGGGAGCCCCAUGCCCCUGGGACAUGAACCCACCUGCGUGGAAUGCUGUUUGUGAGGUGUCUACAGGGUUUAUAGUAGUCUUGUGGACACAGAAAUGCACAGGGGACACUUACGGACACAGAAAUGCACAGGGGAGGCCGAGCAUAACCAGGGGUGAGGGGCAGGCAGCAGUUGUAGUUACUGCCGCGGGGCACUGCUAUGUGCAGGGACAGCCAGCACCCAGCCCAUCACCACUCCCUGGGCUGGCUGGCAGGUAUGGCACCCUGGGAGCCCGGCAUAUACCCAGGGCACCCCUACGGCUGCCGCCAGUCUCAUGCCCAGGUGGGUGCUCUGGGCUGGAGCGAGGGCCAGGUUUUGGGCCGAGGCUUCCCCAGGCAAUCCUGUGAGCUCCCUUCUAGCCUCUGACCCAGUCUGGUCUGGCUUGCAUGGAUGUAGGGCUUGGGGUGGGAAGUUCAGGUCCUGGCUUUGCCUUUGCCUGAUGUGGAUGAGCAGCUCACAUGCUCAGGGCCACCUGAGACUGUCACUGCUCUCCCCUGGCUACUGGGAGGAGUCACUGAGAGCUUCGUUACCCCUGCUGCCUUGCCCAGGGCACACCCUAUACCUCCUUAUCUGCUCUUCCCCUCCCUGCCGCCUUCUGGGCAGGUAGCAGUCCCUGGCCUCUCCCCCUGGCUGAUCACUCUCCCUCAGGCAGUGGAGAUCUGCGUCUGGACACCCUCAGAUCCUGUCAUUGCCUGCCCAGAGUCCUUCAGGGGCACCCCUCUGCCUUGGUGUGCAGUCCAGGGCUCUCACCCAGGUGCCGCACCCUCUGGGGUCUUCUGUCCAGCUCCCUUGCCCCAUGUGCUGUCACUGACUCUCCUUGGGACUCGCCUGCCUGCUCAGAGCCCUGCAGGGCUUGGUCAGCUGCCUGUUCAGUGUCAACACUUCCCUGCACAUCUUAAAACUGGGCUUUAUUUUCGCUGAAGGAACUGUGUUGGGACCCUUGACAUCUGUCAGGUUUGCACAUGCUGUUUUUUUUUCUCAGCCCACGUGUUCUCCCCCACGUGGGGUAGCAGCAGGACAGACAGUGAAUCACAGAGUCUGCCCUGAGCAGAGGCUGCUGUCCCUGGGACUCCUAGCCAUGGUCAGACUGUACAAAACGGUUUUCCAGAAAUGAAAUGUAAAUCCAUUUUUAUACUGAAAAUGUUACUGAAAGUCACUUUUAUGAGCAUCUGCCUUAAUAAACAGACAUUGAUUCCCUUAUCAGAAGCCUGUCACACUGUGUUUCGUUUCAUCCUGGGGAGAACUGCAGAUUUGGGGUUUCUGGCUGUCAUACGUCACCUGCCUGUGGGGCGAGUGGGAGGCCCAGCCUGGUUUAGGGAACAAGAGUGACGUGAGGAGUAGCAGGGUGCGUCUCCAGUUACCUGAGGGAAAACAGAUAUUUUAAGAGAUAAUAGCAUAGCCUAUUUUAAUAUGUUUUAAAGGCCAUAAGCAUAUCCAGGAAGAUAAAUAAACGUGAUACAAUGUCCACAUAGGAGGAACUUUCUUUCACUGCAUUGUUUUCCUUCACAGUGGCCUUCAAGUCACAGGACGCAGCGAUUCCCUGCCCUCUUCGGUGUUAUUACACAGGCAGGACUUCAGUGUCAGUAUCCCUGCCUUCAGUCUUCUUUAGAAAUCACAUCUGUGUUCAAUCCAUUGUUUAGAGGGAGUGUAUUUUUCCUGUUCCACGAAGAGGACUUUUUGUUCACAAUUGGAUCACAAUGCAGAGGAGUCUGUUCCUCCCCCGUCGGCUUCUCGGUGCUGGGAGGGUGACCUGUCCCAGAUGACUCAUCACCCUGACAUGCUCUUGACAAAGGACACCACCAAGAGGAGAUGGCAGCUGUACCGGUGCAGCCUCUGUCUGAGGGGGAUAUUUGCCUCAGUGUGAUUAAAAAUCAGUCAUGAAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2046.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2129.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 1221.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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