Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002408.4

Sequence Length

2683 nt

GC Content

0.4752

GCAGUUGCGGGUUGUCAUAACGGUCCCCGCCGGAGUGAGGCGAGGCCGCGUCGCUCAGUUCUGGCCGUCUAGGGCCCCUGUAAGGAUGAGAGCGCAGAGGACGCAGGGCCGCUGGAGGCGCAGGUAACGAAGCUAGGGUGCGGUUGGGACCGCGGCUGAGCUUUUUCCGGGACCCGUGGUGCUGAAUGGAGAGGACGGAGACGAAGCCGAGCCGCGGCUCCUAGCGGCGGCGCCGAUGCUCGAGCUGUAGCUGCCAGGCGAGGAUGUGUGGAGCGCAGGCGGCGCGGGGUAAAUGAGAGGUCUCGGGCCCCAGGACCCCCGGGGCCCGGGAUGAGUUAGCGAGGGCAGCCGCGGGGGCCAGUUCCGACCGUGACAGGCCAAGGCGACGGCCGCCGCCCGCCCGCCCCUUCCGUGCAGAAGCAGCUGCUCCUUUCCGCGCCCGCCCGCCUGCGCUCCCGGCCCUGGAGACCAUGAGGUUCCGCAUCUACAAACGGAAGGUGCUAAUCCUGACGCUCGUGGUGGCCGCCUGCGGCUUCGUCCUCUGGAGCAGCAAUGGGCGACAAAGGAAGAACGAGGCCCUCGCCCCACCGUUGCUGGACGCCGAACCCGCGCGGGGUGCCGGCGGCCGCGGUGGGGACCACCCCUCUGUGGCUGUGGGCAUCCGCAGGGUCUCCAACGUGUCGGCGGCUUCCCUGGUCCCGGCGGUCCCCCAGCCCGAGGCGGACAACCUGACGCUGCGGUACCGGUCCCUGGUGUACCAGCUGAACUUUGAUCAGACCCUGAGGAAUGUAGAUAAGGCUGGCACCUGGGCCCCCCGGGAGCUGGUGCUGGUGGUCCAGGUGCAUAACCGGCCCGAAUACCUCAGACUGCUGCUGGACUCACUUCGAAAAGCCCAGGGAAUUGACAACGUCCUCGUCAUCUUUAGCCAUGACUUCUGGUCGACCGAGAUCAAUCAGCUGAUCGCCGGGGUGAAUUUCUGUCCGGUUCUGCAGGUGUUCUUUCCUUUCAGCAUUCAGUUGUACCCUAACGAGUUUCCAGGUAGUGACCCUAGAGAUUGUCCCAGAGACCUGCCGAAGAAUGCCGCUUUGAAAUUGGGGUGCAUCAAUGCUGAGUAUCCCGACUCCUUCGGCCAUUAUAGAGAGGCCAAAUUCUCCCAGACCAAACAUCACUGGUGGUGGAAGCUGCAUUUUGUGUGGGAAAGAGUGAAAAUUCUUCGAGAUUAUGCUGGCCUUAUACUUUUCCUAGAAGAGGAUCACUACUUAGCCCCAGACUUUUACCAUGUCUUCAAAAAGAUGUGGAAACUGAAGCAGCAAGAGUGCCCUGAAUGUGAUGUUCUCUCCCUGGGGACCUAUAGUGCCAGUCGCAGUUUCUAUGGCAUGGCUGACAAGGUAGAUGUGAAAACUUGGAAAUCCACAGAGCACAAUAUGGGUCUAGCCUUGACCCGGAAUGCCUAUCAGAAGCUGAUCGAGUGCACAGACACUUUCUGUACUUAUGAUGAUUAUAACUGGGACUGGACUCUUCAAUACUUGACUGUAUCUUGUCUUCCAAAAUUCUGGAAAGUGCUGGUUCCUCAAAUUCCUAGGAUCUUUCAUGCUGGAGACUGUGGUAUGCAUCACAAGAAAACCUGUAGACCAUCCACUCAGAGUGCCCAAAUUGAGUCACUCUUAAAUAAUAACAAACAAUACAUGUUUCCAGAAACUCUAACUAUCAGUGAAAAGUUUACUGUGGUAGCCAUUUCCCCACCUAGAAAAAAUGGAGGGUGGGGAGAUAUUAGGGACCAUGAACUCUGUAAAAGUUAUAGAAGACUGCAGUGAAAAUCACAGUUACAAAAGCGACAGUCUUCUAUUUUUGAUAUUUGUCCAAACAGGACAUACAAUUGAAUAAAAGAGUUUAGGAACUGGUUUCUGCUUUAAUACAAAAACAAAAUCUUGUAAAAGGUGUCCAAAUACAUAGUAAUCUUUUCCAGUUAUGUCUGAUUAAGAUUUAAAACUGAAGGUUUCAUUUUGGGAGUAGGGUUUUAAAGCUCAAUCUGUUAUCUGCUAAAAUUGAUUAUUGUUGAUAUGAGAGAAGAGGGGAAAUUUUAUUUAAAUUGCAUUUAUUAAUCUUUUUAUCUGAAACUUUGUACACUUUUCCACUUUCAAAACCUAUUUUAAGUACAGCAAAAUUUAUUUAAAACUGUCAUAGCAGUAAAAAGUAUUACGAUGAAAUUGUUAGGGUAUUAAUGGAACAAACCCAGUUUCACUCUCUUGACACACUUAUUAGGAAGGGAUUGCUUCACUGGUUUAAUAAUUUAAAAGUUAUGUUUGUUAAACACCCUGUCAGAACAGUCAUUUUCAGUAUUAGAUUCCUGUACUAUUGUGUUUUGAGUGUGUUUUGGAACCUUCAUAGAACACACUUUCUUUUGGAAUGUAUUUGAUUGAUAAGAAAGUUUAAACAUUGUUUUCACCUCAAUGUAGAAAUACAGUGGUUUUGUUUUUUUUUUUCUUUUAGUGCUGACAAAAUAAAAUACUCAUUUUUGCAUAAAAAGGUUCCUAAUCCUUUUGCAGAAUAAGUUUUGUUUACUCUUUAUACCAAAAUUCAGUGAAGGCAUUCUACAAGUUUUGAGUUAGCAUUACAUUUUAAUAUUUACUAUUGCUACAUUGUAUAAUUGAGUUUGAAAUAAAACCCAGCUUAUGACAAUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-918.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -967.05

Frequency: 0.0000

Diversity: 682.27

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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