Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002433.5
Sequence Length
1792 nt
GC Content
0.4972
AGCACUGCCCUCCAAGAUCUUCCCUUGGGCUUUUCAGCAGUAAGGGGACAUGCACCCCAAGGGCCUCCACUUGGCCUGACCUUGCUGCGGGGGCUCUCUGUCCCCAGGAACAGUAGAGAUGGCAAGCUUAUCAAGACCCUCUCUGCCCAGCUGCCUCUGCUCCUUCCUCCUCCUCCUCCUCCUCCAAGUGUCUUCCAGCUAUGCAGGGCAGUUCAGAGUGAUAGGACCAAGACACCCUAUCCGGGCUCUGGUCGGGGAUGAAGUGGAAUUGCCAUGUCGCAUAUCUCCUGGGAAGAACGCUACAGGCAUGGAGGUGGGGUGGUACCGCCCCCCCUUCUCUAGGGUGGUUCAUCUCUACAGAAAUGGCAAGGACCAAGAUGGAGACCAGGCACCUGAAUAUCGGGGCCGGACAGAGCUGCUGAAAGAUGCUAUUGGUGAGGGAAAGGUGACUCUCAGGAUCCGGAAUGUAAGGUUCUCAGAUGAAGGAGGUUUCACCUGCUUCUUCCGAGAUCAUUCUUACCAAGAGGAGGCAGCAAUGGAAUUGAAAGUAGAAGAUCCUUUCUACUGGGUGAGCCCUGGAGUGCUGGUUCUCCUCGCGGUGCUGCCUGUGCUCCUCCUGCAGAUCACUGUUGGCCUCAUCUUCCUCUGCCUGCAGUACAGACUGAGAGGAAAACUUCGAGCAGAGAUAGAGAAUCUCCACCGGACUUUUGAUCCCCACUUUCUGAGGGUGCCCUGCUGGAAGAUAACCCUGUUUGUAAUUGUGCCGGUUCUUGGACCCUUGGUUGCCUUGAUCAUCUGCUACAACUGGCUACAUCGAAGACUAGCAGGGCAAUUCCUUGAAGAGCUACUCUUCCACCUGGAAGCCCUCUCUGGCUAAGGACAGGCAGGUGCCCCUCUCUCCAUCAGAGGACACCUGUACUGGAGAGCAACACAGGAUGGUCUCUGCCAUGAACUGGAGGCCAGGAAUCUCCUCACUGAAAAUUACAGUAUGGUAACUUUGCAAAUGGUGGUUGUUUCUUCCAAGACUCCAGCCCUGAUUGCGCAAAACUGAAAGGCAUGUGAAGGGAAGGAAGAGGAAGAGUGCAAAACAUUGAAGAGAGAGCUGAGUGAGCUGAAGAGUGAGGAUAUGAGUAGCCCCAACCCAAACCUGGAGAUGGGGAGAAACCUACAGAAUACUAGCCAGAGCUCCUCCUUGUCUUGGCAGCCUACUAGGGACCUGGGGAAGCAAAAACGAAAGCUGGGCAACAUGCCUGCUUUAGAAUGUUUUCCUUCUACUUACACAUCUUCCACAGGUCUCAGAAUCUUUCCUUCCUCUCAUCCUUUUCUCCUAUCUUCAUAUCUAUCAGAGUAUCCACUGUUUAUUCAACAACUACUACUUGAUGGUCAGACACAAACAAACAAGCUAGGUGCUAAUUAAUAAAGAUACGAGUUUUGGCCGGGUGCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCGGGCGAAUCACGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAACAAUUAACUGAGCAUAGUGGUGGGCACCUAUAAUACCAGCUACUCCGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCGUGCCACUGCACUCUAGCCGGAGUGACAGAGUAAGACUCUGUCUCAAAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAAAAUAAUAAUACAAGUUUUCAUAAGCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-600.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -634.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 529.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((..(((((.......)))))(((((((((((((..((((.......))))...((.(((((((((((((..((...(((.((((((.....))))))(((((.((((((...((((.(((.....(((.....)))....)))))))))))))..)))))((.(((((....(((...((((((((((((.(((((..((((((((....(.((..(((((.((..(((.....))).)))))))....)).)....)))))))).....))))).))....))))).)))))..)))...))))).))(((((.(((((((...........))))))))))))....)))....))..))).))))).))))).)).(((.(((((...)))))))).......)))))))))))..))..(((((.(((...(((..(((((((((((((((..((..((((((((((((((.((.(((((((.((((((((((.((((....)))).....))))))))))...)))))))...((((((((....))))))))(((....))).(((((((.(((.(.((....)).)..))).))))))).((.((((....)))).))))))))))..((((((...((((....)))).((((....))))..))))))...)))))))).)))))))...............))))))))))..)))..((((((((((((((((((((((...(((((((((((((.(((((((((((((((((.....((((....))))...)))..((.((((.(((((..((((..((((((...)))))).....)))))))))..)))))).....((((((((((..(((((.......))))).))))))).)))))).))))).))))(((((....)))))........))))))))))).....((((.......))))..))))...)))))))))).)))))..))))))).((((((.(((((((((.(((....((((..((.(((((((((...(((((((((.(((.(.........(((((((((.(((((....(((....(.((((((.((((((((((((.((((....))).).)))))((...((((.......((.(((((.((........)).))))))).....))))...))(((((((((......(((((.(((((...))))))))))....))))))))).)))))))...))))))).)))..)))))..))))).))))).))).)))))))))....))))))))))).)))).(((((...(((((..(((.(((.......))).)))..)))))..........(((.....)))..........)))))(((((...((((....))))))))).(((((....((((((....)))))).....))))).)))))))).).)))..)))))).........))).)))))...((((....((((((.(((...........................))).))))))))))........(((((.(....).))))).)))))((((((..((((....)))).(((((((..(((((((.((.........))))))))))))).)))...(.((((((((...)))))))).)...............................................................)))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,..,{{,{,(({{{.......||||||,..,,,,(((((((((((.......,))}..(((((.......)))))..}))))))))((((((.....))))))(((((.((((((,..(((,,(((...,,(((....,)))}...)))))))))))))..))))).(((((((((..(((((.,(((((({(({{,...((((((((.(((((({.,....(((({,((..(((.....))).)))))))((((((,((({{{...{(((.(((.{{...{{{,...,}},}}..)).}}))))}.{((((.((((((....)))))).)))}|{{{,.{|(((|||.{{{{{,.....,|||,,.}},))}...}))}}.((.(((.(((((...))))))))))......{{{{{,.{{{..,,,...(((((((....(((((.((((((((...(({..((((((,((((.((.((((.((((...)))).)))).)).))))....,}}}}|,..{{{|((((((((.,{{.......((((((({....}))))))){((.||,|)}.{,..,,},},,})))))).,)}))}})))).},})))))))).))))))))..,..))))))){((((((..{,,{{{{.,,,}}}}))))))}..}))|.}))))||,|,,,,,,}}}))))),,}},})}.)))))).,.})))))},.))))))))||||||||{{{{{((((((({{.,,(((((((({,(((,{{{((((((((((((,,..,,.((({....})))...,,,..||.{{{{,|((({..{(((..((((((...)))))).....)))}))))}..}}})}).,|,.(((((((({(,,(((((,,,,,..|}}|}.}}))))).})))))})}},,.,))).,}|},}}|})}.,,..}))),))))}|||,,,.}|..((((.......))))..))}}...}}||}|}|}|.|||||..|||}}},,||,,,|,||||||,||}|||....((((.{({.{((((((((,,{(((((((((,(((.{.........{{{((((((.(((((,{,,(((..{{(,(((((,.{(((((((((((.((((....))).).))))),,...,||,..,....{{.(({({.{(,.......)},)))))))|,|.,},}}|.,||(((((((((......(((((.(((({...}))))))))).,..))))))))).)))))}}...,)))))}.))),))))))..))))))))))),))}.))))))}}),,..})))))))))).)))){(({.,...{(({.....},}}...,,||||}},}}},.}}.}}},.,,,,,},((({.{{{|,|..........,,},..,{{|{{((((({{{.,{{{|||||.(((((,...((((({....}))))).....)))))}))}}}}}},..|||{.}|,}}},..}))}.})))))))},...((((....((((((.(((,,.....................,...))).)))))))))).....,,}))))).....)))))..)))).))))).....{{||,.,,)))).(((((((..(((((((.((,,....,,.))))))))))))).)))}}}}.((((((((...)))))))).................................................................||,,.....,))...
Back