Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002475.5
Sequence Length
828 nt
GC Content
0.5906
GCUAUGCCCCGCCCCCUCCCCAGCCCCAGACACGGACCCCGCAGGAGAUGGGUGCCCCCAUCCGCACACUGUCCUUUGGCCACCGGACAUCAUGCCUCCCAAGAAGGAUGUUCCCGUGAAGAAACCAGCAGGGCCCUCCAUCUCCAAACCUGCUGCUAAGCCAGCAGCAGCAGGGGCUCCUCCAGCCAAGACCAAAGCUGAGCCAGCUGUCCCCCAGGCCCCUCAGAAAACCCAGGAGCCUCCAGUCGAUCUCUCCAAAGUGGUGAUCGAGUUUAACAAGGACCAGCUGGAGGAGUUCAAGGAGGCCUUCGAGCUGUUUGACCGAGUGGGGGAUGGCAAGAUCCUGUACAGCCAGUGUGGGGACGUGAUGAGGGCCCUGGGCCAGAACCCCACCAACGCCGAGGUGCUCAAGGUCCUGGGGAACCCCAAGAGUGAUGAGCUGAAGUCGCGGCGUGUGGACUUUGAGACUUUCCUGCCCAUGCUCCAGGCAGUGGCCAAGAACCGAGGCCAAGGCACAUAUGAGGACUACUUGGAGGGGUUUCGUGUGUUUGACAAGGAGGGGAACGGCAAAGUCAUGGGAGCAGAGCUCAGACAUGUUCUCACCACCCUUGGAGAGAAGAUGACUGAGGAGGAGGUGGAGACCGUUCUGGCAGGACACGAGGACAGCAACGGCUGCAUCAACUACGAGGCCUUCUUGAAACACAUCCUAAGCGUCUGAGUGCUGCAGAUCCAGUGGGGUCCGGACACUGGGCCCCGCAGGCGAAAGCACGUUCCAGCCACCAGGAGGCCACCUAUUGUUUCAAAAUAAAGACUGGGUUCCUCUCUUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-316.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -335.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 215.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((....(((((((.......(((((((((((((((((((((((((((((........)))).))))).(((((((...(((((((....((....))...)))))))..((......))...((((((((((.(((.(....(((((((((........)))))))))(((((....(((..........)))))))).((((((((((((((((((..(((..........(((((((((((((...(((...))).))))).((((.....))))..))))))))..))).))).))))((((..(.....)..)))))))))))))))....((((.((((.....)))))))).).))))))))))))))))))))...((((..((((((.((.(((((.(.((.((((....)))).)).)..))))).....)).))))))))))............))))))((((.(((...((..(((((.........)))))..))......))).).....))).))))))...))))))))....)))))))...)))).)))....(((((....(((((.(((.(((((.(((....))).))))).))).))))).((..((((.((.((((((((..............))).))))))).))))..))...(((((((...((......))..))).))))..(((((......((.(((((((((((...))))))))))).))....)))))))))).....((((((((..(((((..((((........)))))))))..).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((....(((((((........(.(((((((((((((((((((((((,,,.}}}}}}.}|},.,}|||,(((((((,,.(((((((.,.,{(.....}..,))))}})}.}|,..........((((((((({{(((.{....(((((((((........)))))))))(((({...,(((..........)))))))).((((((((((((((.(((..(.......}}}.}|||,,{.((((((.,.((,...})).)))))).|....,..||}}{{{||,||||.{{||..,},))))))}.})}}}...}.,}..,}))))))))))....{(((.{(({.....)))))))).,.)))))))))))))}))))}}...((((..((((((.{{,(((((.(.((.((((....)))).)).)..))))).....}}.)))))))))).......,....))}}}}(,,..,{{,.|||,,(((((.........)))))..)).,....}}},},..}}))}.))))))}))))).)..}....)))))))...)))}.})),.,|({{(||,.|(((((.(((.(((((.(((....))).))))).))).)))}|{((,.((((.((.((((((((.,.,....,.....))).))))))).))))..}}.,.{(({{{{|||{.......,,...,|,}}}},,||{||,,.,.,||.(((((((((((...))))))))))).|||...}}}}}.}},,.}},.{{||||||,,(((((.,{(((......,,)})}))))).,)})))}))}
Back