Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002479.6
Sequence Length
1507 nt
GC Content
0.5773
GGGCUGCUGGAGCUUGGGGGCUGGUGGCAGGAACAAGCCUUUUCCGACCCCAUGGAGCUGUAUGAGACAUCCCCCUACUUCUACCAGGAACCCCGCUUCUAUGAUGGGGAAAACUACCUGCCUGUCCACCUCCAGGGCUUCGAACCACCAGGCUACGAGCGGACGGAGCUCACCCUGAGCCCCGAGGCCCCAGGGCCCCUUGAGGACAAGGGGCUGGGGACCCCCGAGCACUGUCCAGGCCAGUGCCUGCCGUGGGCGUGUAAGGUGUGUAAGAGGAAGUCGGUGUCCGUGGACCGGCGGCGGGCGGCCACACUGAGGGAGAAGCGCAGGCUCAAGAAGGUGAAUGAGGCCUUCGAGGCCCUGAAGAGAAGCACCCUGCUCAACCCCAACCAGCGGCUGCCCAAGGUGGAGAUCCUGCGCAGUGCCAUCCAGUACAUCGAGCGCCUCCAGGCCCUGCUCAGCUCCCUCAACCAGGAGGAGCGUGACCUCCGCUACCGGGGCGGGGGCGGGCCCCAGCCAGGGGUGCCCAGCGAAUGCAGCUCUCACAGCGCCUCCUGCAGUCCAGAGUGGGGCAGUGCACUGGAGUUCAGCGCCAACCCAGGGGAUCAUCUGCUCACGGCUGACCCUACAGAUGCCCACAACCUGCACUCCCUCACCUCCAUCGUGGACAGCAUCACAGUGGAAGAUGUGUCUGUGGCCUUCCCAGAUGAAACCAUGCCCAACUGAGAUUGUCUUCCAAGCCGGGCAUCCUUGCGAGCCCCCCAAGCUGGCCACAGAUGCCACUACUUCUGUAGCAGGGGCCUCCUAAGCCAGGCUGCCCUGAUGCUAGGAAGCCAGCUCUGGGGUGCCAUAGGCCAGACUAUCCCCUUCCUCAUCCAUGUAAGGUUAACCCACCCCCCAGCAAGGGACUGGACGCCCUCAUUCAGCUGCCUCCUUAGAGGAGAGGGCAUCCCCUUUCCAGGGAGGUAAAGCAGGGGACCAGAGCGCCCCCUCGUGUAUGCCCCAGCUCAGGGGGCAAACUCAGGAGCUUCCUUUUUAUCAUAACGCGGCCUCUAAUUCCACCCCCCAAGUGAAACGGUUUGAGAGACGCAGUGCCCUGACCUGGACAAGCUGUGCACGUCUCCUGUUCUGGUCUCUUCCCGAUGCCAGUGGCUGGGCUGGGCCUGCCCUGAAUUGAGAGAGAAGAAGGGGAGAGGAACAGCCCUCUGUUCCCAAGUCCCUGGGGGGCCAAACUUUUGCAGUGAAUAUUGGGAACCUUCCAGUGGUUUUAUGUUUUGUUUUGUUUCGUGUGUUGUUUGUAAAGCUGCCAUCCGACCAAGGUCUCCUGUGCUGAAGUUGCCGGGGACAGGCAGGGAAAAGGGGUUGGGGCCUCUUGGGGGUGAUUUCUUUUGUUAACAAAGCAUUGUGUGGUUUUGCCAUUGUUUUGUAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGCUAACUUAUUUGGAUUUCCUUUUUUAAAAAAUGAAUAAAGACUGGUUGCCAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-592.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -616.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 330.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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