Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002491.3

Sequence Length

493 nt

GC Content

0.4077

CGUUUCCGGUUGGCUCCGGUUGCAGAGUUGAGUGUCCUGAGAGGUCAGAUUGCUGUCAGACAUGGCCCAUGAACAUGGACAUGAGCAUGGACAUCAUAAAAUGGAACUUCCAGAUUAUAGACAAUGGAAGAUAGAAGGGACACCAUUAGAAACUAUCCAGAAGAAGCUGGCUGCAAAAGGGCUAAGGGAUCCAUGGGGCCGCAAUGAAGCUUGGAGAUACAUGGGUGGCUUUGCAAAGAGUGUUUCCUUUUCUGAUGUAUUCUUUAAAGGAUUCAAAUGGGGAUUUGCUGCAUUUGUGGUAGCUGUAGGAGCUGAAUAUUACCUGGAGUCCCUGAAUAAAGAUAAGAAGCAUCACUGAAGAUAAUACCUGGAAGCAUCAUAGUGGUUUCUUAACUCUCCAAAAUAAGAUUUCUUCUCUGUAGCCUACUUGUCUGGUUUAUCCCUUACAGAAUAUUAGUAAGAUUUAAUCAAUUAAAAUAUAUAUAUAUGCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-123.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -134.13

Frequency: 0.0000

Diversity: 110.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.........(((((...((((((((((..(((((((.(((.((.........)).))))))))...(((((..(((....)))..)))))...((((((..((((...))))..)))).))...((((.((...(((((..(((((((((..((.(((((........((((.((...(((((...)).))).)).))))((((.(..(((((........)))))..).)))).....(((((..((((..((((((.(((((......(((((....(((((((........(((..(((((.....))))).))).......))))))))))))......)))))))))))..))))..))))))))))))..)).))))))))))))...))))))..........))..))))))))))........(((((.....(((((.........)))))....)))))..................)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.........,((((...((((((((((..((({(({{(((.((.........)).))))))}|,..(((((..(((....)))..))))).,.{{((((..((({...})))..)))}.,,...{((||({...,{((((.(((((((((..((.(((((.....,{,((((.((...((({{...}}.))).)).)))){{,,.,..||||({,,,,,|.|,,}|,.}.}})).....|||||,,|(((,,((((((.(((((......(((({...{(((((((,{{{{....||,}|{(((.....}))},..,,...,,,,})))))))))))......)))))))))))..)))),.}}}}})))))))..)).)))))))}))))...))))))......,,.,))..)))))))))).,,{,,{,{({......,|,,||}},.....,)}},|.,,,||,,...,,,.,,,,....,,,,)))),