Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002507.4
Sequence Length
3408 nt
GC Content
0.6288
AGAGCGAGCCGAGCCGCGGCCAGCUCCGGCGGGCAGGGGGGGCGCUGGAGCGCAGCGCAGCGCAGCCCCAUCAGUCCGCAAAGCGGACCGAGCUGGAAGUCGAGCGCUGCCGCGGGAGGCGGGCGAUGGGGGCAGGUGCCACCGGCCGCGCCAUGGACGGGCCGCGCCUGCUGCUGUUGCUGCUUCUGGGGGUGUCCCUUGGAGGUGCCAAGGAGGCAUGCCCCACAGGCCUGUACACACACAGCGGUGAGUGCUGCAAAGCCUGCAACCUGGGCGAGGGUGUGGCCCAGCCUUGUGGAGCCAACCAGACCGUGUGUGAGCCCUGCCUGGACAGCGUGACGUUCUCCGACGUGGUGAGCGCGACCGAGCCGUGCAAGCCGUGCACCGAGUGCGUGGGGCUCCAGAGCAUGUCGGCGCCGUGCGUGGAGGCCGACGACGCCGUGUGCCGCUGCGCCUACGGCUACUACCAGGAUGAGACGACUGGGCGCUGCGAGGCGUGCCGCGUGUGCGAGGCGGGCUCGGGCCUCGUGUUCUCCUGCCAGGACAAGCAGAACACCGUGUGCGAGGAGUGCCCCGACGGCACGUAUUCCGACGAGGCCAACCACGUGGACCCGUGCCUGCCCUGCACCGUGUGCGAGGACACCGAGCGCCAGCUCCGCGAGUGCACACGCUGGGCCGACGCCGAGUGCGAGGAGAUCCCUGGCCGUUGGAUUACACGGUCCACACCCCCAGAGGGCUCGGACAGCACAGCCCCCAGCACCCAGGAGCCUGAGGCACCUCCAGAACAAGACCUCAUAGCCAGCACGGUGGCAGGUGUGGUGACCACAGUGAUGGGCAGCUCCCAGCCCGUGGUGACCCGAGGCACCACCGACAACCUCAUCCCUGUCUAUUGCUCCAUCCUGGCUGCUGUGGUUGUGGGCCUUGUGGCCUACAUAGCCUUCAAGAGGUGGAACAGCUGCAAGCAGAACAAGCAAGGAGCCAACAGCCGGCCAGUGAACCAGACGCCCCCACCAGAGGGAGAAAAACUCCACAGCGACAGUGGCAUCUCCGUGGACAGCCAGAGCCUGCAUGACCAGCAGCCCCACACGCAGACAGCCUCGGGCCAGGCCCUCAAGGGUGACGGAGGCCUCUACAGCAGCCUGCCCCCAGCCAAGCGGGAGGAGGUGGAGAAGCUUCUCAACGGCUCUGCGGGGGACACCUGGCGGCACCUGGCGGGCGAGCUGGGCUACCAGCCCGAGCACAUAGACUCCUUUACCCAUGAGGCCUGCCCCGUUCGCGCCCUGCUUGCAAGCUGGGCCACCCAGGACAGCGCCACACUGGACGCCCUCCUGGCCGCCCUGCGCCGCAUCCAGCGAGCCGACCUCGUGGAGAGUCUGUGCAGUGAGUCCACUGCCACAUCCCCGGUGUGAGCCCAACCGGGGAGCCCCCGCCCCGCCCCACAUUCCGACAACCGAUGCUCCAGCCAACCCCUGUGGAGCCCGCACCCCCACCCUUUGGGGGGGGCCCGCCUGGCAGAACUGAGCUCCUCUGGGCAGGACCUCAGAGUCCAGGCCCCAAAACCACAGCCCUGUCAGUGCAGCCCGUGUGGCCCCUUCACUUCUGACCACACUUCCUGUCCAGAGAGAGAAGUGCCCCUGCUGCCUCCCCAACCCUGCCCCUGCCCCGUCACCAUCUCAGGCCACCUGCCCCCUUCUCCCACACUGCUAGGUGGGCCAGCCCCUCCCACCACAGCAGGUGUCAUAUAUGGGGGGCCAACACCAGGGAUGGUACUAGGGGGAAGUGACAAGGCCCCAGAGACUCAGAGGGAGGAAUCGAGGAACCAGAGCCAUGGACUCUACACUGUGAACUUGGGGAACAAGGGUGGCAUCCCAGUGGCCUCAACCCUCCCUCAGCCCCUCUUGCCCCCCACCCCAGCCUAAGAUGAAGAGGAUCGGAGGCUUGUCAGAGCUGGGAGGGGUUUUCGAAGCUCAGCCCACCCCCCUCAUUUUGGAUAUAGGUCAGUGAGGCCCAGGGAGAGGCCAUGAUUCGCCCAAAGCCAGACAGCAACGGGGAGGCCAAGUGCAGGCUGGCACCGCCUUCUCUAAAUGAGGGGCCUCAGGUUUGCCUGAGGGCGAGGGGAGGGUGGCAGGUGACCUUCUGGGAAAUGGCUUGAAGCCAAGUCAGCUUUGCCUUCCACGCUGUCUCCAGACCCCCACCCCUUCCCCACUGCCUGCCCACCCGUGGAGAUGGGAUGCUUGCCUAGGGCCUGGUCCAUGAUGGAGUCAGGUUUGGGGUUCGUGGAAAGGGUGCUGCUUCCCUCUGCCUGUCCCUCUCAGGCAUGCCUGUGUGACAUCAGUGGCAUGGCUCCAGUCUGCUGCCCUCCAUCCCGACAUGGACCCGGAGCUAACACUGGCCCCUAGAAUCAGCCUAGGGGUCAGGGACCAAGGACCCCUCACCUUGCAACACACAGACACACGCACACACACACACAGGAGGAGAAAUCUCACUUUUCUCCAUGAGUUUUUUCUCUUGGGCUGAGACUGGAUACUGCCCGGGGCAGCUGCCAGAGAAGCAUCGGAGGGAAUUGAGGUCUGCUCGGCCGUCUUCACUCGCCCCCGGGUUUGGCGGGCCAAGGACUGCCGACCGAGGCUGGAGCUGGCGUCUGUCUUCAAGGGCUUACACGUGGAGGAAUGCUCCCCCAUCCUCCCCUUCCCUGCAAACAUGGGGUUGGCUGGGCCCAGAAGGUUGUGAUGAAGAAAAGUGGGCCAGUGUGGGAAUGCGGCAAGAAGGAAUUGACUUCGACUGUGACCUGUGGGGAUUUCUCCCAGCUCUAGACAACCCUGCAAAGGACUGUUUUUUCCUGAGCUUGGCCAGAAGGGGGCCAUGAGGCCUCAGUGGACUUUCCACCCCCUCCCUGGCCUGUUCUGUUUUGCCUGAAGUUGGAGUGAGUGUGGCUCCCCUCUAUUUAGCAUGACAAGCCCCAGGCAGGCUGUGCGCUGACAACCACCGCUCCCCAGCCCAGGGUUCCCCCAGCCCUGUGGAAGGGACUAGGAGCACUGUAGUAAAUGGCAAUUCUUUGACCUCAACCUGUGAUGAGGGGAGGAAACUCACCUGCUGGCCCCUCACCUGGGCACCUGGGGAGUGGGACAGAGUCUGGGUGUAUUUAUUUUCCUCCCCAGCAGGUGGGGAGGGGGUUUGGGGGCUUGCAAGUAUGUUUUAGCAUGUGUUUGGUUCUGGGGCCCCUUUUUACUCCCCUUGAGCUGAGAUGGAACCCUUUUGGCCCCCGAGCUGGGGGCCAUGAGCUCCAGACCCCCAGCAACCCUCCUAUCACCUCCCCUCCUUGCCUCCUGUGUAAUCAUUUCUUGGGCCCUCCUGAAACUUACACACAAAACGUUAAGUGAUGAACAUUAAAUAGCAAAGAAAGAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1506.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1561.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 806.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..((((.....))))..)))).((((((.((((((((.(..((((.((((((((((((.((.(((((.((((((...)))))).))..)))..))...))))))).((((.(((((((.(((((((...((((((..(((...((((((((.((((((((((((((((((((.((((((..(((((.(((...(((((((((((....((((........(((((.(((((((.(((....))).))).))))..)))))...((((((....(((((((((((((((((((((((......(..((.((((....(((((((.(.((((((..(((((.((.....)).)))))......(((((((...((.((((((((.((((((.((.(((((..(((((.......))))).))))).)).))).))))).))).))).))...)))))))....((((..........))))))))))).)))).(((((((.(((((.(((((((.((((((.((((.....((((........))))....((.(((..(((..(((((.....)))))...)))..))).)).....)))).)).)))).))))))).))))))))).))))))))))))..)....)))))))))).......)))))))).)))))..((((...(((.(((((((..((((((((....)))))).))..)))).)))))).....)))).((.....)).)))))).))))..))))))))))).)))...))))).)).))))))))))))))))))))((.(((......))).))...))).).))))))))..))).))))))........)))))))))))))).))))(((((((((((((.......((((((((....)))))))))))))....)).))))))...)))))........((((...((((..((.((..((((...((((((((((((((((((...((((((((..((((((((..(((((.(((.(((..(((....))))))..))).((.((.(((..(((((((((((...((..((((.((((((.(((.((((((.(((((((((((..((.((((((((((.((..(((.(((((((.(.....).))))))..).)))..))))))).))...))).))...))).))))..((((((((...))))).))).......)))).)))))).))))))))).))))...))...)))).(((..((.((((...((((((..((((((...))).)))..))))))..)))).))...)))((((.((((.....)))))))).....(((((((((....))))).))))((((((((.........))))))))((....))(((((......(((..((((((...((.((((((((((((.((((.((((...((((((.....))))))))))))))..((((((.((((((((((((((((((((..(((((((..(((..(((....(((.(..((((....))))..)))))))..)))..)).))))).......)))))))))))).)))..((((((((((.((((((((..((.((.(.((.((((.(.((((((((.((......(((((((.....(((.(((((.((((((.........))))))..))))))))........))))))).....)).))))))))...).)))).)).).)).))(((((.((..(((.((...(((.((.(((........)).).)).)))...)).))).))))))).....((((((.(((...((((((((.....(((((..(((.(.((.(((.........(((((..(((.......)))..)))))..((((((.((((.(((((...(........)...))))).)))))))))).....))).)).).)))..))))))))))))))))))))))...((......))...)))))))).....)))))..))))).((((.(((.....)))))))))))).))))))((((((.(((((((((((((((((......)))).....(((((...))))).((((((((((((((....((.((((((((((((((((.....(((((..(((((((((..((((((..((((.(.((.....)).))))).)))))).))).).))))).)))))...))))...)))).))).(((((((((..(((...((((.((((.(((.((((.((....)).)))))))((((((((.(.(((((((.(((......)))...))))......(((((((((((.......)))))))))))....(((((........))))).............................((((((((((((.((((..........))))))))))))))))))).)))))))))..(((((...))))).)))).)))).))).)))))))))..)))).).))(((((.(((((.....(((((((....))).))))..))))).)))))..))))).)))))))))((..((((....))))..))....((((.....)))).))))))))))))))))).)).....))))))))))))))......))))))...))).....)))))...)))))))..))))))).((((.......)))).)))))...)))))))).))))))))(((((.(((((..(((....)))..)))))......))))).((((((.((((((((....)))....(((((...))))))))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((.((((...))))..)))))))))))).)))).(((((((((.((.(((......))).)).((((((((((((((((((((((...((((((.....)))).)).)))))............(((((....))).))(((.....)))((((((((((.......))).....))))))))))))))...))))))))))......))))))).))........(((((((((.....))))))))))))..)))))).......(((((....))))).)))))))))...)))).)).))..)))).)))).((((...((((...(((.((((((((.....)))))))).))).))))......))))....))))...).)))))))).))))))...(((((((...((((..((.....)).)))).)))))))......((((..((((....))))..)))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..((((.....))))..)))).(((((({((((((((,(((((,{{(((((((.{(((.{({,..((.((((((...)))))).))..,))..)},..))))))).||((,(((((((.((((((({,.((((((..{((,,,((({((((.{((((((((((((((((((,,((((((..(((((,(,{...(((((((((((....((((........(((((.(((((((.(((....))).))).))))..)))))...((((((.{.(((((((((((((((((.(((.{,......((((((((((..(((({((((.(.((((((,.(((((.((,...,)).)))))}.....((((((({.,((.(,((((((.((((((.((.(((((..(((((.......))))).))))).)).))).))))).))))}))}))},.,))))))....((((..........))))))))))).))))}....(((((((((..(((((((.,((((((((((((((((((........))))..(((((.((((,{((.(({.......((((((...(((,{((.((....)).))))))..))))))}))))))))))).))).)))))))}}))).)))))).))))...})))))))).)))),.}).((((..((.(((.....))).))..))))...}))))))).,.,,,,))).}))))).}}...,)})},})),..,).)))))).))))..))))))))))).,,,..,))))}.)),})))))))))))))))))))|..(({......}||{|....}}}.),)))))))}.|)}}.))))))........)))))))))))))).}}}},{,.,,((((((((((((((((((((((....))))))),..(((((...)))))......|||}|..||,,....,)}..},}))},,}})},))))}).|{{||||{|||||||{||...((((((((..((((((((..((((((((.{((,..,||,..}))}|,|,|{{{.,,.,,.|||}.{{{,((,((((...((..((((.(((((({(((.((((((.(((((((({{,,,({.((((((((((.((..(((.{((((((.(.....}.))))))..}.)))..))))))).}}...})),))..,))}.))))..((((((((...))))).))).......)))).)))))).))))))))).))))...))...)))).||,..((.((((...((((((..((((({...})).)))..))))))..)))).))(((((|((({,((((.....)))))))}.....(((((((((....)))))}})))((((((((.,,....},))))))))...{{{({{,.({{{{{{.(((..((((((..,({,((((((((((((.((((.((((...((((((.....))))))))))))))..((((({.((((((((((((((((((((..(((((((..(((..{{{....(((.{..((((....))))..,})))))..)))..))}})))).......)))))))))))).)))..((((((((((,((((((((..,({((.{,((.((((.{.((((((((.((......(((((((.....{((,(((((.((((((.........))))))..)))))))),.......))))))).....)).))))))))...,,)))}.}).).}},))((((({,{..(((.((,,.(({.((.{((........)).).)}.))).,.)).))).})))))).....((((((.(((...((((((((....,(((((..(((.(.((.(((.........(((((..(((.......)))..))))).},,,(((.,(((.{((((,..,........)},,}}))).))),,,,})).....))).)).).)))..))))))))))))))))))))))...((......))...)))))))).....)))))..))))).((({{(((.....)))))))))))).}))))),{((((.(((((((((((((..((,,.{{{{{{|{,...,(((((({{{,||,({{((({({{((({,.,,({,{{{{{(((((((((((.....(((((..(((((((((..((((((..{(((.(.((.....)).)))}|.)))))).))).).))))).)))))...))))...)))).}}}.{((((((((..(((...((({.((({.(((.((((.((....)).)))))))((((((((.(.(((((((.(((......)))...))))......(((((((((((.......)))))))))))|...(((((........))))).............................((((((((((((.((((..........))))))))))))))))))).}))))))))..(((((...))))).}))),)))}.))).))))))))}..|||}.}.|}{{(((.(((({...,.((({{{{....,)),))))..})))).))))),,))))),})))))))),,,}),))))}.))))...,.}}})))))...})}},.))))))))))))))))).}}.....)))))))))))))}.,,...))))))...},,,,...)))))}..)})))))..))))))..((((.......)))).)))))...)))))))).)))))))){({{{.{((((..(((....)))..)))),......||||}.((((((.((((((((..,,|}||...{((({...}))))}))))..)))))).,}}}{(({.((||{{{{,.|(({(,{{{|,.,))))..)))}}}}}}||}.}}}}.(((((((((.((.(((......)}}.}).((((((((((((((((((((((...((((((.....)))).)).)))))......{.....(((((....))).)),,,....,,,.((((((((({.......||}...,.))))))))))))))...))))))))))......))))))).)}........{((((((({.....))))))))}}||.}|||||}.{{(,.,{{{{{....))))},})}})}}||.{((||,{{.{{{{{{{|,.,..))).))))),)),.,,|{{.((((((((,...,)))))))).},)}))))).}}}}}}}}...})}}}...,.))))))))}))))))...(((((((...((((..(({...,)).)))).)))))))......((({.,({{{....}))}..}})).............
Back