Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002529.4
Sequence Length
2669 nt
GC Content
0.6280
GGAGGCCUGGCAGCUGCAGCUGGGAGCGCACAGACGGCUGCCCCGCCUGAGCGAGGCGGGCGCCGCCGCGAUGCUGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCUUGGCUGGCACAGCUGGGCUGCGGGGCCGGGCAGCCUGCUGGCUUGGCUGAUACUGGCAUCUGCGGGCGCCGCACCCUGCCCCGAUGCCUGCUGCCCCCACGGCUCCUCGGGACUGCGAUGCACCCGGGAUGGGGCCCUGGAUAGCCUCCACCACCUGCCCGGCGCAGAGAACCUGACUGAGCUCUACAUCGAGAACCAGCAGCAUCUGCAGCAUCUGGAGCUCCGUGAUCUGAGGGGCCUGGGGGAGCUGAGAAACCUCACCAUCGUGAAGAGUGGUCUCCGUUUCGUGGCGCCAGAUGCCUUCCAUUUCACUCCUCGGCUCAGUCGCCUGAAUCUCUCCUUCAACGCUCUGGAGUCUCUCUCCUGGAAAACUGUGCAGGGCCUCUCCUUACAGGAACUGGUCCUGUCGGGGAACCCUCUGCACUGUUCUUGUGCCCUGCGCUGGCUACAGCGCUGGGAGGAGGAGGGACUGGGCGGAGUGCCUGAACAGAAGCUGCAGUGUCAUGGGCAAGGGCCCCUGGCCCACAUGCCCAAUGCCAGCUGUGGUGUGCCCACGCUGAAGGUCCAGGUGCCCAAUGCCUCGGUGGAUGUGGGGGACGACGUGCUGCUGCGGUGCCAGGUGGAGGGGCGGGGCCUGGAGCAGGCCGGCUGGAUCCUCACAGAGCUGGAGCAGUCAGCCACGGUGAUGAAAUCUGGGGGUCUGCCAUCCCUGGGGCUGACCCUGGCCAAUGUCACCAGUGACCUCAACAGGAAGAACGUGACGUGCUGGGCAGAGAACGAUGUGGGCCGGGCAGAGGUCUCUGUUCAGGUCAACGUCUCCUUCCCGGCCAGUGUGCAGCUGCACACGGCGGUGGAGAUGCACCACUGGUGCAUCCCCUUCUCUGUGGAUGGGCAGCCGGCACCGUCUCUGCGCUGGCUCUUCAAUGGCUCCGUGCUCAAUGAGACCAGCUUCAUCUUCACUGAGUUCCUGGAGCCGGCAGCCAAUGAGACCGUGCGGCACGGGUGUCUGCGCCUCAACCAGCCCACCCACGUCAACAACGGCAACUACACGCUGCUGGCUGCCAACCCCUUCGGCCAGGCCUCCGCCUCCAUCAUGGCUGCCUUCAUGGACAACCCUUUCGAGUUCAACCCCGAGGACCCCAUCCCUGUCUCCUUCUCGCCGGUGGACACUAACAGCACAUCUGGAGACCCGGUGGAGAAGAAGGACGAAACACCUUUUGGGGUCUCGGUGGCUGUGGGCCUGGCCGUCUUUGCCUGCCUCUUCCUUUCUACGCUGCUCCUUGUGCUCAACAAAUGUGGACGGAGAAACAAGUUUGGGAUCAACCGCCCGGCUGUGCUGGCUCCAGAGGAUGGGCUGGCCAUGUCCCUGCAUUUCAUGACAUUGGGUGGCAGCUCCCUGUCCCCCACCGAGGGCAAAGGCUCUGGGCUCCAAGGCCACAUCAUCGAGAACCCACAAUACUUCAGUGAUGCCUGUGUUCACCACAUCAAGCGCCGGGACAUCGUGCUCAAGUGGGAGCUGGGGGAGGGCGCCUUUGGGAAGGUCUUCCUUGCUGAGUGCCACAACCUCCUGCCUGAGCAGGACAAGAUGCUGGUGGCUGUCAAGGCACUGAAGGAGGCGUCCGAGAGUGCUCGGCAGGACUUCCAGCGUGAGGCUGAGCUGCUCACCAUGCUGCAGCACCAGCACAUCGUGCGCUUCUUCGGCGUCUGCACCGAGGGCCGCCCCCUGCUCAUGGUCUUUGAGUAUAUGCGGCACGGGGACCUCAACCGCUUCCUCCGAUCCCAUGGACCUGAUGCCAAGCUGCUGGCUGGUGGGGAGGAUGUGGCUCCAGGCCCCCUGGGUCUGGGGCAGCUGCUGGCCGUGGCUAGCCAGGUCGCUGCGGGGAUGGUGUACCUGGCGGGUCUGCAUUUUGUGCACCGGGACCUGGCCACACGCAACUGUCUAGUGGGCCAGGGACUGGUGGUCAAGAUUGGUGAUUUUGGCAUGAGCAGGGAUAUCUACAGCACCGACUAUUACCGUGUGGGAGGCCGCACCAUGCUGCCCAUUCGCUGGAUGCCGCCCGAGAGCAUCCUGUACCGUAAGUUCACCACCGAGAGCGACGUGUGGAGCUUCGGCGUGGUGCUCUGGGAGAUCUUCACCUACGGCAAGCAGCCCUGGUACCAGCUCUCCAACACGGAGGCAAUCGACUGCAUCACGCAGGGACGUGAGUUGGAGCGGCCACGUGCCUGCCCACCAGAGGUCUACGCCAUCAUGCGGGGCUGCUGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCAUCAAGGAUGUGCACGCCCGGCUGCAAGCCCUGGCCCAGGCACCUCCUGUCUACCUGGAUGUCCUGGGCUAGGGGGCCGGCCCAGGGGCUGGGAGUGGUUAGCCGGAAUACUGGGGCCUGCCCUCAGCAUCCCCCAUAGCUCCCAGCAGCCCCAGGGUGAUCUCAAAGUAUCUAAUUCACCCUCAGCAUGUGGGAAGGGACAGGUGGGGGCUGGGAGUAGAGGAUGUUCCUGCUUCUCUAGGCAAGGUCCCGUCAUAGCAAUUAUAUUUAUUAUCCCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1238.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1281.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 606.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((((((.(((((.(((((.(((..(((((((((((((.....))))))...(((((.((......)).))))).((((.(..((((((((((((...)))))))))))).).)))))))))))..)))))..(((.(.....((((((.(.(((((........))))))))))))..).))).(((.(((((((((((..(((...))))))))...)))))).)))(((.(((((.(((((.((((((((((((....(((.(((.(.(((......))).)))))))..))))).(((((.((...(((((((((.(((((((((.((....)).)).....((((....))))...(.(((((((((.....((((.....))))............((((((..(((.((((.(((...(((((((..(((((...((((((((((((....(((.((((((((..(((((..((((((.....)))))).)))))..)).)))))).)))......(((.((((((....)))))).))))))).))))))))))))).(((((((..((((..((..(((((((.((((((.(((((...)))))...))))))....((((.((((.....))))))))..((((..((.(((((..((((..((....((((((((((..(.(((((((((((((((((((((((.(.(((((((((.(.(((((((((............)))))).((((((((((((((((((......(.((((((.(((........))).)))))).).....)))))).))).(((....))).......(((((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((....))))))).)))).)))))....((((.(((.((((((....))))))))).).)))((((((((...))))))))...)))))).(((.(((((.((.((((((....((((((.((.(((.((.((((((((.((((...(((..(((...........)))..)))...))))))).))))).)))))))))))))....)))))).))))).)).))))))))..))))))).....(((........)))))))))))).....))).)..)))))))))).)))))))).)))).)))....(((((...........))))).(((((((.((((((......((((((((((.(((.(((...((..(((.....))).))..))).))).).))))))).)).........))))))))))).)).(((((((.((((((.....((((((((((...(((((.((((((...((((.....))))..)))).)).))))).......((......))(((.(((...))))))...))))).))))))))))).))))..)))..(((......))))))))))).)..)))))))))).....))..))))..))))).))..)))).((((((.(((............))).))))))(((..((((.((((....(((((.((....)))))))...))))))))..)))...(((((..((((.((((....)))).)))))))))......((((((....))))))...)))))))))..))))..))))))))))))))((((.(((..(((((.((.........((((.....)))).(((((..........))))).))))))).))).))))...))))))).)))..))))))(((((....((((((.......))))))...)))))))))))))).)....)).))))).))))..))))))).)))))...))))..))).)))))))))).))).(((((((((((...))))))))))).))).))))).)))))).)))))))).))..((((((((((....((((((((((((........((((((..(((((((.(((...........))))))))))..))))))(((((((((...)))))))))..((((((((((((((.((((.((..........((((((....))))))...((((.(((...((((..((((((((.((((((((.((..(((.((((((..(((((....))..)))..))))))))))).))))))))))).............)))))..))))..)))...)))).((((.....))))(((......))).....(((((.(((((.((((...))))))))).)))))(((((....((((...(((.((((((((((((((((.((((((((((((((....((....(((((...)))))....))(((((((....((((((((((((.((.(((.........))).)))))))))))))).((((.(((((...)))))..)))))))))))....))))))).(((.....))))))).....))).)))))))))))(((((((................)))))))..))))))))....)))).)))))))))))........))))))))))))))......)).))).))))))).............))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.((((,(((.,{((((((((((.(.(((((,.((((.(((((((((.....))))))).)).)))},(((((((...(((({,.((({(.(((((((((((,({{.{{{(,{(({|{(,{,{|,|,|||||||||}}|}|,|||,,.....((({((.|,(({{{.....,,,}))))})})))).{|{,((((((.(((((((((((,{({((,,{{..(((((.,(((|...((((.....)))),|.))}}))))),(((((....(((.(((.{{(({.....})),.,))))))..))))).)}})).)|}),}}}}}..,})))))))))))))))}}){(((....)))},,,{{|.{{.|,{,(((((((((...,,(({{.....})))............((((((..(((.((((.(({...(((((((,.(((((...((((((((((((,{{,,{(.((((((((..(((((..((((((.....)))))).)))))..)).)))))).))),}....(((.((((((....)))))).)))))))}})))))))))))).(((((((..((((..((..(((((((.((((((.(((((...)))))...))))))....((((.((((.....))))))))..((((..((.(((((..((((..((....((((((((((..{.(((((((((((((((((((((((.(.(((((((((.{.(((((((((,........,..)))))).((((((((((((((((((,.....{.((((((.(((........))).)))))).}....,)))))).))).(((....}))......,(((((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((....))))))).)))).)))))....,{((.(((.((((((....))))))))),).))}((((((((...))))))))...)))))).(((.(((((.((.((((((,,..((((((.((.(({{((.((((((((.((((...({({((((...........))).)))}...))))))).))))).))))))))))))).,,.)))))).))))).)).))))))))..))))))}.,..,(((........)))))))))))).....))).}..)))))))))).)))))))).)))).))).,,,(((({...........))}},.(((((({{((((((....{{((((((((((.(((.(((...{{..(((.....))).,}..))),))).),})))))).)}..},.....))))))))))).)).,{,((((.((((((.....((((((((((...{((({.((((((...{(((.....)))}..)))).)).})))}.......((,.....}}{|||(((...))))))...))))).))))))))))).))))}.)),.,|||,,,...,,.)))))))).,..)))))))))).....))..))))..))))).))..)))).((((((.(((............))).))))))(((,.((((.((((.,..(((({,({....}))))))..,)))))))).}}}|,.,(((((..((((.((((....)))).))))))))).}..}}((((((....))))))...)))))))))..))))..)))))))))))))}((((.(((..(((((.((...,.,...(((({{{.,||}}.{{{||,...,,}},,)}))).))))))).))).)))),,,))))))).)))..))))))(((((....((((((.......))))))...)))))))))))))).,...,})}}},|||},|,,..,))}.,.,..))))))))))),)|{((((((.(((((((((((((((((((...))))))))))}.((((({.(((((((({.(((((((((((.......|)))).))))))),||}|.,,((((((..((((((..(((((((.(((...........))))))))))..))))))..)))))}.(((({,.,{(((({.,,(((,((..,...(((((..,.........((((((....))))))..))))),,...}},))}.}})))|{((.((((((((.{{..(((.((((((.{(((((....,,.,),)}})))))))))}).))))))))})).,....})}}).})))).}))))).{{{,{.((((({((((....,|||}(((......))).}|.||,,,|,||||))))))),,))))))))).))).))))))}}..,,...,))).}}.(((((((((.(((....))).)))))).))}.)))).)))))))..,..))))).).)))))))))}..((((((((((((.((.(((.........))).)))))))))))))).}|||}||((({{{|||||.,|||||.||}}|....,|(((((((((({{((({.,{((((,,.,{((((|,{{{{,..(((((((................)))))))..)).)))))),.},,,,.})}))))))))))..{((((((.{{...,))))))))}))),})))))))},...}},,,,,,.,,,.,}},))))},
Back