Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002580.3
Sequence Length
808 nt
GC Content
0.5161
AAACCAUACCAUAUCCCACCAGAGAGUGACUCCUGAUUGCCUCCUCAAGUCGCAGACACUAUGCUGCCUCCCAUGGCCCUGCCCAGUGUAUCUUGGAUGCUGCUUUCCUGCCUCAUGCUGCUGUCUCAGGUUCAAGGUGAAGAACCCCAGAGGGAACUGCCCUCUGCACGGAUCCGCUGUCCCAAAGGCUCCAAGGCCUAUGGCUCCCACUGCUAUGCCUUGUUUUUGUCACCAAAAUCCUGGACAGAUGCAGAUCUGGCCUGCCAGAAGCGGCCCUCUGGAAACCUGGUGUCUGUGCUCAGUGGGGCUGAGGGAUCCUUCGUGUCCUCCCUGGUGAAGAGCAUUGGUAACAGCUACUCAUACGUCUGGAUUGGGCUCCAUGACCCCACACAGGGCACCGAGCCCAAUGGAGAAGGUUGGGAGUGGAGUAGCAGUGAUGUGAUGAAUUACUUUGCAUGGGAGAGAAAUCCCUCCACCAUCUCAAGCCCCGGCCACUGUGCGAGCCUGUCGAGAAGCACAGCAUUUCUGAGGUGGAAAGAUUAUAACUGUAAUGUGAGGUUACCCUAUGUCUGCAAGUUCACUGACUAGUGCAGGAGGGAAGUCAGCAGCCUGUGUUUGGUGUGCAACUCAUCAUGGGCAUGAGACCAGUGUGAGGACUCACCCUGGAAGAGAAUAUUCGCUUAAUUCCCCCAACCUGACCACCUCAUUCUUAUCUUUCUUCUGUUUCUUCCUCCCCGCUGUCAUUUCAGUCUCUUCAUUUUGUCAUACGGCCUAAGGCUUUAAAGAGCAAUAAAAUUUUUAGUCUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-261.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -275.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 169.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((..((.((((((.(((.(((((((....(((((((..((.(((((((((...((.(((......)))...)).(((.((.(((.((..((((((((.(.(((...(((..(((((.((((.....(((((.((.((.(((((((.....)))))))...)).)).(((........)))..((((((..(((((.......)))))))))))......))))).....)))))))))..))).....)))..)...))))))))..)).))).)))))))))))))))).)).)))))...))))........)))))).))))))..))....))))).((((((((((..(.(((..(((((((((..((.(((......)))))..)))))))))..))).)..)))).(((((((((.((((((.......))))))))))..((((......)))))))))..(((.(((((..((((..((((((((..((..((((...(((((......((((.(((((.(........((((.(((((((..((((...((((((((((....))))..))))))))))..((((((((((((((...(((.....)))...))))))).))...((((.((((....)))).))))(((.((....)).)))............))))).)))))))..))))........).))))).))))...)))))........))))..)).)))).)))).))))...)))))...))).............))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
................,(((((.(((.(((((((....(((((((..((.(((((((({...((.(((......)))...)),(((.((.(({.((..((((((((.,.(((...(((..(((((.((((.....(((((.((,{,.(((((((.....)))))))...||,,,.,{{,.......))}..{(((((..(((((.......))))))))))),}}},.))))).....)))))))))..))),,...)))..}...))))))))..}}.))).)))))))))))))))).}).)))))...))))........)))))).)))))|(((((.(((((,.(((((........{.(((..(((((((((..((.(((......)))))..)))))))))..))}.|,,,(((((.((((.{((((.{{...(({({....,,{|{,((((..(((......)))..)))),,}}}|{...,}}..((((((....{{....}}..))))))......{(((((((..({{,,,,....||||},{.(((|...}}}...{(((((((((....))))..)))))}{(((.((((..((..(((.((((.((((.((........)).)))).)))))))..))..))))..))))(((({,(,.......})}..))))......))..))))))))...)))))..,,..))))).))))))))}.)))))....})))))))))}.....,,,....|||{..,||||..,.,||,,,......,,},}}},})}..
Back