Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002593.4
Sequence Length
1516 nt
GC Content
0.6187
GAUUAUCCUGCUGCUGCCGCCACCGCUGCUGCUGCUCUGCAAAAUUCAGCUGCUGCCUCUGUCUUGAGGACCCCAGCGCCUUUCCCCCGGGGCCAUGCUGCCUGCAGCCACAGCCUCCCUCCUGGGGCCCCUCCUCACUGCCUGCGCCCUGCUGCCUUUUGCCCAGGGCCAGACCCCCAACUACACCAGACCCGUGUUCCUGUGCGGAGGGGAUGUGAAGGGGGAAUCAGGUUACGUGGCAAGUGAGGGGUUCCCCAACCUCUACCCCCCUAAUAAGGAGUGCAUCUGGACCAUAACGGUCCCCGAGGGCCAGACUGUGUCCCUCUCAUUCCGAGUCUUCGACCUGGAGCUGCACCCCGCCUGCCGCUACGAUGCUCUGGAGGUCUUCGCUGGGUCUGGGACUUCCGGCCAGCGGCUCGGACGCUUUUGUGGGACCUUCCGGCCUGCGCCCCUAGUCGCCCCCGGCAACCAGGUGACCCUGAGGAUGACGACGGAUGAGGGCACAGGAGGACGAGGCUUCCUGCUCUGGUACAGCGGGCGGGCCACCUCGGGCACUGAGCACCAAUUUUGCGGGGGGCGGCUGGAGAAGGCCCAGGGAACCCUGACCACGCCCAACUGGCCCGAGUCCGAUUACCCCCCGGGCAUCAGCUGUUCCUGGCACAUCAUCGCGCCCCCGGACCAGGUCAUCGCGCUGACCUUCGAGAAGUUUGACCUGGAGCCGGACACCUACUGCCGCUAUGACUCGGUCAGCGUGUUCAACGGAGCCGUGAGCGACGACUCCCGGAGGCUGGGGAAGUUCUGCGGCGACGCAGUCCCGGGCUCCAUCUCCUCCGAAGGGAAUGAACUCCUCGUCCAGUUCGUCUCAGAUCUCAGUGUCACCGCUGAUGGCUUCUCAGCCUCCUACAAGACCCUGCCGCGGGGCACUGCCAAAGAAGGGCAAGGGCCCGGCCCCAAACGGGGAACUGAGCCUAAAGUCAAGCUGCCCCCCAAGUCCCAACCUCCGGAGAAAACAGAGGAAUCUCCUUCAGCCCCUGAUGCACCCACCUGCCCAAAGCAGUGCCGCCGGACAGGCACCUUGCAGAGCAACUUCUGUGCCAGCAGCCUUGUGGUGACUGCGACAGUGAAGUCCAUGGUUCGGGAGCCAGGGGAGGGCCUUGCCGUGACUGUCAGUCUUAUUGGUGCUUAUAAAACUGGAGGACUGGACCUGCCUUCUCCACCCACUGGUGCCUCCCUGAAGUUUUACGUGCCUUGCAAGCAGUGCCCCCCCAUGAAGAAAGGAGUCAGUUAUCUGCUGAUGGGCCAGGUAGAAGAGAACAGAGGCCCCGUCCUUCCUCCAGAGAGCUUUGUGGUUCUCCACCGGCCCAACCAGGACCAGAUCCUCACCAACCUAAGCAAGAGGAAGUGCCCCUCUCAACCUGUGCGGGCUGCUGCGUCCCAGGACUGAGACGCAGGCCAGCCCCGGCCCCUAGCCCUCAGGCCUUCUUUCUUAUCCAAAUAAAUGUUUCUUAAUGAGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-602.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -629.39
Frequency: 0.0000
Diversity: 335.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((.(((.(.((((((.((((((((((((((((((......((((..(((((......)))).)..))))(((((((((((.((((...((((....))))....))))(((....))).(((((((.(((...(((.((((((..((.....)).)))))))))..........((((.......))))....))).))))))).......)))))))..))))...(.((((.(((.(((((............)))))(((....))).(((((((.(((((.....)))))..(((((.((.....)).))))).....(((.(((...))).)))(((.(((.......))).)))..(((.(((((....((((((..((((.((((((((..((.(((((((((((.(.((((((.(((.((....(((((..((((.((((.((((((((((....((((((.((((((.(((.(((((((..((((...((((((.((((...(((((.(((......))))))))...))))((((.((((..........(((.((((((((((((.....((((.(((......((((..(((.....)))..).)))........))).)))).)))))))))))).)))..)))..).))))((((.((((((((.....((........)).....))))))))..))))((((...((((((........))).))).)))).....((((.(((.....))).)))).((((.((((((.....(((((....))))))))))).))))...))))))...((((......)))).)))).))))))))))..)))))).))))))(((((.......)))))..............))))).)))))))))........))))..))))).))))))))).)).)..))))))).........)))).))...)))))))))))).))))))...)))))..))).............))))))).))).)))))......(((((........))))).))))))))))........).)))))))...)))))).).))).))).((((.((..((((.(((.(((.((((..(((((....(((..(.((((((((...(((((.........(((((((..((((..((((((((......(((((.(((((......((((.((((....(((.....))).....))))))))..))))(((((.....))))).).)))))......))))....))))...)))).)))))))(((((((....)))))))...((((((...((((...((((((((..............)))))........)))...))))...))))))..))).)).)))))))).)))))))))..)))))))))).))))....)).)))).(((((((..((((....))))....))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......(((.(((.(.((((((.((((((((((((((((((......((((..(((((......)))).}..))))((((,((({(({((((..{((({...,||||{|,.||||(((....}}},(((((((.(((...(((.((((((..((.....)).)))))))))..........((((.......))))....))).))))))).......)))))}}..}))}...{{(({{.((({(((((,....,,}}}},,},,,{{,....,||.(((((,{.(((((.....)))))..(((((.((.....)).)))))....{(((.(((...))).))))|,}||}}.,}}}.)))}))...,,,.(((((|,||({{{{{..((({.((((((((..((.(((((((((((.(.(,{{{|,{((.,,..||(((((..((((,((((.((((((((((....((((((.((((((.(((,(((((((,,((((..,(((({,,((((...(((((,(((......))))))))...))))|(((.,,{{,,........(((.((((((((((({.....((((.(((....{.((({..(((.....)))..}.))).}.....,)},.)))).)))))))))))).)))..}}.,,),))))((((.((((((((..,,.((........))..,,.))))))))..))))((((...((((((........))).))).)))),....((((.(((.....))).)))).((((.((((((.....(((((....))))))))))).))))...}}}|}}...||||.....,)))),)))).)))))))))}..)))))).))))))(((((.{.....})))),,.......,....))))).))))))))}........))))..))))).))||||}}}.))})..))))))).........)))),)}...)))))))))))),)))))}...}}||||,..,.,,,,},|,..}}))}}}}},}..,|||....,)))|||||.,,,,..,))),..)))))))))),,....,,),}))))))...)))))).,.))).))).((((.((..((((.(((.(((.((((..(((({,({,(,,..{.((((((({..,(({((........,(((((((..((((..((((((((((((....)))).,,........((((((.(((((..(,{((((,({..,,{{.,.......)).)...}}...))))))..)))}}).)))))})))}...,))))...)))).)))))))|((((((....)))))))...{(((((...{(((..,({{(((((..............))))}..,}....}}}...}})).,.)))))).,)}),}),)))))))).)))))))))..)))))))))).))))....)).)))),{{{((({..,,,,....,,}}....})))))).
Back